More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3754 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3754  methyltransferase GidB  100 
 
 		 219 aa  442  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139272 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4356  methyltransferase GidB  33.74 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  35.96 
 
 		 210 aa  98.2  8e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  32 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  32 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  32 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  32 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1409  methyltransferase GidB  38.51 
 
 		 212 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302587  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  32 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  32 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4511  methyltransferase GidB  33.74 
 
 		 215 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  32 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  31.31 
 
 		 207 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1027  methyltransferase GidB  37.65 
 
 		 212 aa  94.7  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.707991  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4492  methyltransferase GidB  32.52 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3140  methyltransferase GidB  27.8 
 
 		 217 aa  93.2  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4100  16S rRNA methyltransferase GidB  31.5 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205274  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2949  16S rRNA methyltransferase GidB  32.5 
 
 		 208 aa  92.8  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4124  16S rRNA methyltransferase GidB  32.14 
 
 		 207 aa  92.8  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000172745  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2803  16S rRNA methyltransferase GidB  32.5 
 
 		 208 aa  92.4  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3654  16S rRNA methyltransferase GidB  33.53 
 
 		 206 aa  92  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.611058  hitchhiker  0.00060095 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1655  methyltransferase GidB  33.96 
 
 		 211 aa  92  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4092  methyltransferase GidB  35.58 
 
 		 211 aa  91.7  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.295538  normal  0.0121134 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1286  methyltransferase GidB  36.11 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4085  16S rRNA methyltransferase GidB  31 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0040729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1863  methyltransferase GidB  34.81 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0828096 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3985  methyltransferase GidB  31.02 
 
 		 206 aa  91.3  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  31 
 
 		 207 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4156  16S rRNA methyltransferase GidB  31 
 
 		 207 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00135676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4206  16S rRNA methyltransferase GidB  31 
 
 		 207 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0819041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03243  16S rRNA methyltransferase GidB  27.78 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1584  methyltransferase GidB  34.81 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.047924 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  33.76 
 
 		 239 aa  89.4  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  35.85 
 
 		 238 aa  89.4  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2035  16S rRNA methyltransferase GidB  30.77 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00382628  normal  0.306355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0166  16S rRNA methyltransferase GidB  33.95 
 
 		 222 aa  88.6  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.851437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3620  methyltransferase GidB  29.03 
 
 		 221 aa  88.2  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  35 
 
 		 210 aa  88.2  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4496  16S rRNA methyltransferase GidB  31.44 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.227983  hitchhiker  0.00000107328 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  34.38 
 
 		 234 aa  87.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0209  16S rRNA methyltransferase GidB  32.97 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.444443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3626  glucose inhibited division protein  36.31 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1822  16S rRNA methyltransferase GidB  30.85 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3935  16S rRNA methyltransferase GidB  32.72 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.387591  hitchhiker  0.000403371 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4027  16S rRNA methyltransferase GidB  32.72 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.537471  normal  0.874868 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0005  methyltransferase GidB  36.42 
 
 		 193 aa  87  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3084  glucose inhibited division protein  31.69 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167506  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3966  16S rRNA methyltransferase GidB  30.93 
 
 		 206 aa  86.7  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.181169  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  32.05 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2126  16S rRNA methyltransferase GidB  27.37 
 
 		 204 aa  86.7  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  33.11 
 
 		 209 aa  86.7  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4249  16S rRNA methyltransferase GidB  31.45 
 
 		 206 aa  85.9  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0001  16S rRNA methyltransferase GidB  32.72 
 
 		 206 aa  86.3  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.895325  hitchhiker  0.000116578 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  30.41 
 
 		 208 aa  85.5  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0197  16S rRNA methyltransferase GidB  27.37 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5025  methyltransferase GidB  34.38 
 
 		 221 aa  85.9  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.692099 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4909  16S rRNA methyltransferase GidB  30.81 
 
 		 206 aa  85.9  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346301  hitchhiker  0.00404661 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38010  glucose-inhibited division protein B  32.56 
 
 		 210 aa  85.5  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2889  methyltransferase GidB  34.39 
 
 		 206 aa  85.5  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3855  16S rRNA methyltransferase GidB  32.42 
 
 		 234 aa  85.5  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382464  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4210  16S rRNA methyltransferase GidB  32.05 
 
 		 206 aa  85.1  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00534269  normal  0.148659 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3327  16S rRNA methyltransferase GidB  31.16 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1228  putative GidB, glucose inhibited division protein  34.39 
 
 		 206 aa  85.1  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2589  methyltransferase GidB  30.05 
 
 		 219 aa  85.1  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103455 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4184  16S rRNA methyltransferase GidB  32.05 
 
 		 206 aa  85.1  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000958004  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  32.48 
 
 		 210 aa  85.1  8e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  33.99 
 
 		 234 aa  85.1  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2665  methyltransferase GidB  36.18 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102332  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  27.96 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7094  methyltransferase GidB  34.64 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4305  methyltransferase GidB  29.63 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.412707  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2879  methyltransferase GidB  30.11 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  26.96 
 
 		 211 aa  84.7  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4375  16S rRNA methyltransferase GidB  30.65 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321441  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4508  methyltransferase GidB  32.1 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4320  16S rRNA methyltransferase GidB  30.65 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000104223 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4011  glucose inhibited division protein B  31.61 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.256555 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0289  16S rRNA methyltransferase GidB  31.4 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.919787 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4250  16S rRNA methyltransferase GidB  31.21 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4376  16S rRNA methyltransferase GidB  30.65 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000253102  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3762  16S rRNA methyltransferase GidB  34.15 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.247019  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  28.72 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4517  16S rRNA methyltransferase GidB  30.65 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289594 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4185  methyltransferase GidB  33.76 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0282933  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3456  methyltransferase GidB  31.21 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1704  16S rRNA methyltransferase GidB  30.39 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4055  16S rRNA methyltransferase GidB  30.77 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0911  16S rRNA methyltransferase GidB  26.87 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0201  methyltransferase GidB  31.55 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4220  methyltransferase GidB  31.98 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4146  methyltransferase GidB  34.55 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2769  16S rRNA methyltransferase GidB  26.19 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142379  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  31.38 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  32.67 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  27.69 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1035  16S rRNA methyltransferase GidB  26.87 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.943257  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0096  16S rRNA methyltransferase GidB  30.9 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4588  16S rRNA methyltransferase GidB  35.15 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.188204  hitchhiker  0.000465387 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1835  16S rRNA methyltransferase GidB  31.71 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0884797  normal  0.317572 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0390  16S rRNA methyltransferase GidB  29.02 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>