More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3743 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
321 aa  660    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1902  ornithine carbamoyltransferase  57.57 
 
 
306 aa  361  8e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  56.09 
 
 
329 aa  360  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  54.58 
 
 
303 aa  356  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  54.58 
 
 
305 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  59.34 
 
 
300 aa  355  3.9999999999999996e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  55.34 
 
 
309 aa  355  3.9999999999999996e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  57.33 
 
 
309 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  57.33 
 
 
309 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  57.33 
 
 
309 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  57.33 
 
 
309 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  53.92 
 
 
303 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  57.33 
 
 
309 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  57.33 
 
 
309 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  57.33 
 
 
309 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0732  ornithine carbamoyltransferase  57 
 
 
309 aa  354  1e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3012  ornithine carbamoyltransferase  55.77 
 
 
309 aa  353  2e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  58.69 
 
 
298 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  56.07 
 
 
306 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2472  ornithine carbamoyltransferase  57.33 
 
 
309 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.893068  normal  0.0170187 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  57.33 
 
 
309 aa  352  4e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.511035 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  56.07 
 
 
306 aa  351  1e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5885  ornithine carbamoyltransferase  56.68 
 
 
309 aa  351  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  57 
 
 
309 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0757  ornithine carbamoyltransferase  56.68 
 
 
309 aa  350  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0529  ornithine carbamoyltransferase  56.68 
 
 
309 aa  350  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1942  ornithine carbamoyltransferase  57 
 
 
309 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  57 
 
 
309 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3003  ornithine carbamoyltransferase  55.02 
 
 
305 aa  350  2e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2430  ornithine carbamoyltransferase  55.02 
 
 
305 aa  350  2e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  55.16 
 
 
310 aa  350  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1850  ornithine carbamoyltransferase  56.35 
 
 
305 aa  350  3e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  56.39 
 
 
301 aa  349  4e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2601  ornithine carbamoyltransferase  57 
 
 
560 aa  349  4e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.766266  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  55.99 
 
 
303 aa  348  8e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2120  ornithine carbamoyltransferase  55.37 
 
 
302 aa  348  9e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0533894  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  54.46 
 
 
307 aa  347  1e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3205  ornithine carbamoyltransferase  55.99 
 
 
309 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820291  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0907  ornithine carbamoyltransferase  53.61 
 
 
320 aa  346  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2763  ornithine carbamoyltransferase  54.69 
 
 
307 aa  345  4e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  54.75 
 
 
305 aa  345  4e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  55.95 
 
 
304 aa  345  6e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  55.08 
 
 
305 aa  345  6e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  52.79 
 
 
303 aa  345  7e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  56.68 
 
 
304 aa  343  2e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2424  ornithine carbamoyltransferase  54.43 
 
 
308 aa  343  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  53.75 
 
 
311 aa  343  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2830  ornithine carbamoyltransferase  54.11 
 
 
308 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.998909  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  54.07 
 
 
305 aa  342  5e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3030  ornithine carbamoyltransferase  53.61 
 
 
320 aa  341  1e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.883113 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2130  ornithine carbamoyltransferase  54.52 
 
 
305 aa  340  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  53.44 
 
 
315 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2554  ornithine carbamoyltransferase  53.35 
 
 
308 aa  339  4e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0520201  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  50.48 
 
 
312 aa  339  4e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  53.11 
 
 
302 aa  339  5e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  53.11 
 
 
306 aa  338  5e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1754  ornithine carbamoyltransferase  54.4 
 
 
326 aa  338  9e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0940132  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2675  ornithine carbamoyltransferase  53.35 
 
 
308 aa  338  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  53.11 
 
 
303 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  53.44 
 
 
307 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2902  ornithine carbamoyltransferase  54.17 
 
 
307 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.674769  normal  0.667761 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  52.94 
 
 
302 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  56.77 
 
 
300 aa  336  2.9999999999999997e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14030  ornithine carbamoyltransferase  53.11 
 
 
308 aa  336  3.9999999999999995e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  53.42 
 
 
304 aa  336  3.9999999999999995e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1469  ornithine carbamoyltransferase  55.37 
 
 
326 aa  335  5.999999999999999e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.808206  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  51.8 
 
 
305 aa  335  5.999999999999999e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  52.13 
 
 
303 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  53.77 
 
 
306 aa  333  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1345  ornithine carbamoyltransferase  53.72 
 
 
312 aa  333  3e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  55.88 
 
 
303 aa  333  3e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1042  ornithine carbamoyltransferase  52.38 
 
 
329 aa  332  6e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.246407  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  50.81 
 
 
305 aa  330  3e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  52.46 
 
 
307 aa  328  7e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  54.1 
 
 
306 aa  328  7e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3032  ornithine carbamoyltransferase  51.78 
 
 
306 aa  328  9e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1709  ornithine carbamoyltransferase  52.75 
 
 
306 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00976675  hitchhiker  0.00312362 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  54.75 
 
 
311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  54.75 
 
 
311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  53.92 
 
 
309 aa  326  3e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  51.8 
 
 
314 aa  324  1e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  51.8 
 
 
312 aa  322  4e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  49.15 
 
 
305 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
309 aa  319  5e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  53.11 
 
 
306 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4333  ornithine carbamoyltransferase  53.11 
 
 
306 aa  318  7e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  53.11 
 
 
306 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  52.58 
 
 
309 aa  316  3e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  54.57 
 
 
308 aa  315  5e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  51.64 
 
 
306 aa  315  9.999999999999999e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
316 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
316 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2540  ornithine carbamoyltransferase  55.72 
 
 
313 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  50.66 
 
 
298 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  49.19 
 
 
305 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
316 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  50.97 
 
 
303 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  48.68 
 
 
316 aa  310  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
316 aa  310  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  49.19 
 
 
313 aa  310  2e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>