More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3739 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3739  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 278 aa  563  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351695 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  47.83 
 
 		 280 aa  249  5e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  44.8 
 
 		 279 aa  248  9e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  46.24 
 
 		 282 aa  245  4.9999999999999997e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  46.21 
 
 		 281 aa  244  9e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1183  diaminopimelate epimerase  51.1 
 
 		 280 aa  244  9e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147631  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  45.16 
 
 		 277 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  44.44 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  43.73 
 
 		 277 aa  239  2e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  42.65 
 
 		 292 aa  236  3e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  47.08 
 
 		 278 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  44.73 
 
 		 278 aa  235  8e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  46.21 
 
 		 280 aa  233  3e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  46.4 
 
 		 283 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  43.32 
 
 		 281 aa  231  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  42.96 
 
 		 281 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  46.57 
 
 		 279 aa  229  4e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  47.64 
 
 		 284 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  44.72 
 
 		 287 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  44.89 
 
 		 277 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  44.36 
 
 		 277 aa  222  6e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 282 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  48.91 
 
 		 278 aa  218  7.999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  42.09 
 
 		 284 aa  217  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0523  Diaminopimelate epimerase  44.53 
 
 		 279 aa  215  5e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 282 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  42.65 
 
 		 283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  39.57 
 
 		 281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  39.49 
 
 		 278 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  49.82 
 
 		 279 aa  213  3.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  43.21 
 
 		 292 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  41.82 
 
 		 276 aa  211  7.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  39.71 
 
 		 278 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  38.41 
 
 		 278 aa  211  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  43.21 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  45.05 
 
 		 277 aa  211  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  44.29 
 
 		 280 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  42.11 
 
 		 407 aa  210  2e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1200  diaminopimelate epimerase  45.13 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0570214  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  39.71 
 
 		 278 aa  210  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  40.74 
 
 		 274 aa  209  3e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  41.16 
 
 		 278 aa  209  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  42.96 
 
 		 277 aa  208  7e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2730  diaminopimelate epimerase  43.91 
 
 		 268 aa  208  7e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0948067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  42.91 
 
 		 288 aa  208  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0799  diaminopimelate epimerase  42.96 
 
 		 292 aa  208  9e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  38.77 
 
 		 304 aa  207  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  38.79 
 
 		 278 aa  207  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  39.86 
 
 		 288 aa  207  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3435  diaminopimelate epimerase  43.66 
 
 		 295 aa  206  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1058  diaminopimelate epimerase  44.01 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553091  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5228  diaminopimelate epimerase  44.65 
 
 		 287 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  42.75 
 
 		 280 aa  205  5e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2498  diaminopimelate epimerase  43.82 
 
 		 277 aa  205  6e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0760107  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  42.44 
 
 		 308 aa  205  8e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3228  diaminopimelate epimerase  43.17 
 
 		 282 aa  203  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0035809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  38.91 
 
 		 279 aa  204  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3080  diaminopimelate epimerase  42.86 
 
 		 387 aa  203  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47710  diaminopimelate epimerase  44.28 
 
 		 276 aa  203  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5289  diaminopimelate epimerase  43.91 
 
 		 276 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  43.01 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6435  diaminopimelate epimerase  41.92 
 
 		 289 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  40.7 
 
 		 292 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69690  diaminopimelate epimerase  43.17 
 
 		 276 aa  201  9e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0119345  normal  0.292475 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6021  diaminopimelate epimerase  43.17 
 
 		 276 aa  201  9e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449975  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  39.49 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  39.49 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  39.49 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  39.49 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  41.55 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  40.7 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  39.49 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5137  diaminopimelate epimerase  43.91 
 
 		 276 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.91439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  39.13 
 
 		 288 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0266  diaminopimelate epimerase  43.54 
 
 		 276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  40.15 
 
 		 290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3102  diaminopimelate epimerase  40.78 
 
 		 309 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  39.13 
 
 		 288 aa  199  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2471  diaminopimelate epimerase  40.78 
 
 		 309 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3085  diaminopimelate epimerase  40.78 
 
 		 309 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  39.13 
 
 		 288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  39.13 
 
 		 288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  41.26 
 
 		 289 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0224  diaminopimelate epimerase  43.91 
 
 		 276 aa  199  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0316  diaminopimelate epimerase  46.13 
 
 		 276 aa  199  5e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  40.48 
 
 		 288 aa  199  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3245  diaminopimelate epimerase  43.6 
 
 		 296 aa  199  5e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0899  diaminopimelate epimerase  43.01 
 
 		 294 aa  199  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  42.2 
 
 		 286 aa  198  9e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0050  diaminopimelate epimerase  37.74 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.184283  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0244  diaminopimelate epimerase  43.54 
 
 		 276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0867905  normal  0.652879 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1415  diaminopimelate epimerase  44.52 
 
 		 293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  38.13 
 
 		 288 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0183  diaminopimelate epimerase  43.54 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  41.46 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  39.36 
 
 		 286 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  39.48 
 
 		 276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2526  diaminopimelate epimerase  43.75 
 
 		 288 aa  195  6e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.126589 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3444  diaminopimelate epimerase  41.49 
 
 		 291 aa  194  9e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1402  diaminopimelate epimerase  43.28 
 
 		 275 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0816431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>