28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3708 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3708  WGR domain-containing protein  100 
 
 		 98 aa  205  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0084347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0027  WGR  42.47 
 
 		 86 aa  62  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1537  WGR  36.62 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4161  WGR  35.21 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0822744  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8126  hypothetical protein  31.43 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4085  WGR domain-containing protein  33.8 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144172  normal  0.0339375 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6815  WGR domain protein  32.43 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6560  WGR domain protein  32.43 
 
 		 81 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0010  hypothetical protein  33.33 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.0997876 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5519  WGR domain protein  31.43 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468487  hitchhiker  0.00260514 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3846  hypothetical protein  34.78 
 
 		 74 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.332219  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4974  WGR domain protein  32.14 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9182  hypothetical protein  34.78 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.7006  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7352  hypothetical protein  35.29 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0982555  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4763  WGR domain-containing protein  30 
 
 		 184 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000263254  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3038  hypothetical protein  29.33 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3754  WGR domain-containing protein  32.35 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139809  normal  0.744081 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4030  WGR domain-containing protein  32.35 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5799  WGR domain-containing protein  38.57 
 
 		 90 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362732  hitchhiker  0.0021434 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02180  hypothetical protein  30.67 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4328  WGR  28.99 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.153975  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4993  WGR domain-containing protein  33.33 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4670  hypothetical protein  33.33 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.223632  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7057  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213549  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9587  hypothetical protein  28.57 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128521  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5967  WGR domain-containing protein  29.17 
 
 		 83 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.49925 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0022  hypothetical protein  38.89 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7047  hypothetical protein  31.67 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>