262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3667 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3667  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 405 aa  842    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  53.77 
 
 		 405 aa  444  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2053  FAD dependent oxidoreductase  52.42 
 
 		 406 aa  423  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2542  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  51.79 
 
 		 403 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2040  FAD-dependent oxidoreductase  40.36 
 
 		 408 aa  270  2e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.985814  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0069  aminobutyraldehyde dehydrogenase  40.51 
 
 		 409 aa  268  2e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2022  FAD dependent oxidoreductase  42.66 
 
 		 399 aa  263  4e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.426745  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2197  FAD dependent oxidoreductase  41.67 
 
 		 399 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000547368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  34.8 
 
 		 396 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  34.39 
 
 		 406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  34.39 
 
 		 396 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  33.08 
 
 		 402 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  32.12 
 
 		 402 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  35.73 
 
 		 400 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  31.83 
 
 		 407 aa  193  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  33.25 
 
 		 403 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  32.74 
 
 		 410 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  32.58 
 
 		 409 aa  190  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  32.99 
 
 		 404 aa  189  9e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  32.48 
 
 		 410 aa  187  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  35.86 
 
 		 625 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5741  hydroxyglutarate oxidase  33.17 
 
 		 398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  32.07 
 
 		 404 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 409 aa  184  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2970  hydroxyglutarate oxidase  32.13 
 
 		 422 aa  182  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0184807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3091  hydroxyglutarate oxidase  32.13 
 
 		 422 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.854212  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02516  predicted enzyme  32.27 
 
 		 422 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02480  hypothetical protein  32.27 
 
 		 422 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06715  hydroxyglutarate oxidase  30.69 
 
 		 410 aa  182  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2934  hydroxyglutarate oxidase  31.89 
 
 		 422 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23592  normal  0.213528 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2873  hydroxyglutarate oxidase  33.42 
 
 		 416 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2781  hydroxyglutarate oxidase  32.43 
 
 		 416 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  31.3 
 
 		 407 aa  181  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2910  hydroxyglutarate oxidase  32.43 
 
 		 416 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1995  hydroxyglutarate oxidase  31.98 
 
 		 425 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2903  hydroxyglutarate oxidase  31.89 
 
 		 422 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000810  hypothetical protein YgaF  30.43 
 
 		 408 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  35.93 
 
 		 442 aa  180  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2795  hydroxyglutarate oxidase  32.03 
 
 		 422 aa  180  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3902  hydroxyglutarate oxidase  32.03 
 
 		 422 aa  180  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1046  hydroxyglutarate oxidase  32.03 
 
 		 422 aa  180  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2987  hydroxyglutarate oxidase  31.89 
 
 		 422 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.154389 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  35.53 
 
 		 398 aa  179  8e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1023  FAD dependent oxidoreductase  31.54 
 
 		 422 aa  179  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2940  hydroxyglutarate oxidase  31.78 
 
 		 422 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2780  hydroxyglutarate oxidase  31.78 
 
 		 422 aa  178  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.582782 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4660  hydroxyglutarate oxidase  29.59 
 
 		 399 aa  178  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  32.86 
 
 		 427 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  30.85 
 
 		 397 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1130  hydroxyglutarate oxidase  31.08 
 
 		 403 aa  176  8e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  34.86 
 
 		 412 aa  176  8e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3221  hydroxyglutarate oxidase  31.05 
 
 		 422 aa  175  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  31.5 
 
 		 398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3537  FAD dependent oxidoreductase  34.94 
 
 		 401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  31.7 
 
 		 427 aa  174  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  35 
 
 		 396 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0204  hydroxyglutarate oxidase  36 
 
 		 402 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0798  hydroxyglutarate oxidase  31.46 
 
 		 400 aa  170  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  34.38 
 
 		 396 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  30.37 
 
 		 397 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  31.3 
 
 		 394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  35.47 
 
 		 403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2738  hydroxyglutarate oxidase  28.78 
 
 		 416 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.368642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  32.44 
 
 		 400 aa  166  9e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  31.83 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  33.92 
 
 		 396 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0119  FAD dependent oxidoreductase  34.24 
 
 		 395 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14181  dehydrogenase  32.09 
 
 		 400 aa  159  6e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 406 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1187  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  32.15 
 
 		 390 aa  157  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  34.66 
 
 		 408 aa  156  7e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2522  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  31.99 
 
 		 399 aa  155  9e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0216497  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 		 403 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 		 398 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3598  FAD dependent oxidoreductase  30.15 
 
 		 399 aa  142  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.283414 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2156  FAD dependent oxidoreductase  31.41 
 
 		 399 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0724716  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0409  FAD dependent oxidoreductase  26.81 
 
 		 437 aa  136  7.000000000000001e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.218758 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  34.17 
 
 		 375 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  37 
 
 		 367 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  36.3 
 
 		 367 aa  127  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  34.06 
 
 		 368 aa  126  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  34.3 
 
 		 378 aa  125  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  35.25 
 
 		 364 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  33.7 
 
 		 368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3992  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  37.79 
 
 		 366 aa  122  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.475329  normal  0.0131881 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  33.7 
 
 		 371 aa  121  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  35.9 
 
 		 374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  34.32 
 
 		 366 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  35.11 
 
 		 367 aa  119  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  31.73 
 
 		 362 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4334  putative FAD dependent oxidoreductase  34.78 
 
 		 368 aa  117  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  35.87 
 
 		 371 aa  117  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2152  FAD dependent oxidoreductase  35.77 
 
 		 367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  34.89 
 
 		 368 aa  113  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1030  hypothetical protein  37.15 
 
 		 373 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.950675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  34.67 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  33.33 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3956  FAD dependent oxidoreductase  35.77 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2648  FAD dependent oxidoreductase  33.45 
 
 		 376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142643  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  33.69 
 
 		 373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>