More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3660 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0932  DNA topoisomerase I  48.73 
 
 		 914 aa  654    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231933  normal  0.891499 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2792  DNA topoisomerase I  44.78 
 
 		 831 aa  653    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0208029  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1934  DNA topoisomerase I  51.36 
 
 		 815 aa  642    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  57.14 
 
 		 757 aa  881    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2693  DNA topoisomerase I  44.6 
 
 		 813 aa  661    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305019  normal  0.0402807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4350  DNA topoisomerase I  48.49 
 
 		 913 aa  644    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.350571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  47.23 
 
 		 696 aa  640    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  56.16 
 
 		 768 aa  885    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  45.79 
 
 		 711 aa  667    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1869  DNA topoisomerase I  51.52 
 
 		 815 aa  645    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1645  DNA topoisomerase I  50.61 
 
 		 924 aa  643    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.247282 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0604  DNA topoisomerase I  48.85 
 
 		 877 aa  635    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2652  DNA topoisomerase I  56.03 
 
 		 759 aa  879    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2522  DNA topoisomerase I  56.03 
 
 		 759 aa  879    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3914  DNA topoisomerase I  49.64 
 
 		 901 aa  638    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1756  DNA topoisomerase I  49.09 
 
 		 904 aa  654    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0010  DNA topoisomerase I  50.87 
 
 		 857 aa  656    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1712  DNA topoisomerase I  47.28 
 
 		 911 aa  637    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.583112  normal  0.397735 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2326  DNA topoisomerase I  51.2 
 
 		 799 aa  678    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.240337  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3010  DNA topoisomerase I  52.53 
 
 		 783 aa  712    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.846821  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3535  DNA topoisomerase I  47.41 
 
 		 911 aa  636    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2090  DNA topoisomerase I  55.18 
 
 		 834 aa  692    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475207  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  55.74 
 
 		 841 aa  880    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0304  DNA topoisomerase I  46.01 
 
 		 748 aa  650    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000372801  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  56.96 
 
 		 756 aa  895    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  54.6 
 
 		 851 aa  880    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0891  DNA topoisomerase I  56.05 
 
 		 758 aa  874    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570299  decreased coverage  1.1513e-16 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1505  DNA topoisomerase I  50.22 
 
 		 896 aa  636    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3202  DNA topoisomerase I  49.16 
 
 		 915 aa  658    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2699  DNA topoisomerase  45.17 
 
 		 831 aa  660    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.737668  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1529  DNA topoisomerase I  55.23 
 
 		 779 aa  877    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.23259e-34 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3309  DNA topoisomerase I  48.06 
 
 		 888 aa  642    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0227  DNA topoisomerase I  53.4 
 
 		 845 aa  714    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0428468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  44.39 
 
 		 693 aa  637    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  49.8 
 
 		 789 aa  678    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3340  DNA topoisomerase  42.87 
 
 		 853 aa  639    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  54.6 
 
 		 851 aa  880    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1387  DNA topoisomerase I  48.52 
 
 		 884 aa  652    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903307  normal  0.17492 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1354  DNA topoisomerase I  49.5 
 
 		 849 aa  640    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.75959  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1295  DNA topoisomerase I  47.82 
 
 		 884 aa  648    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722616  decreased coverage  0.00167989 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4636  DNA topoisomerase I  45.72 
 
 		 894 aa  637    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2445  DNA topoisomerase I  46.98 
 
 		 758 aa  682    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000450772  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2831  DNA topoisomerase I  49.15 
 
 		 894 aa  659    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442826 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  52.9 
 
 		 765 aa  851    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2632  DNA topoisomerase I  52.48 
 
 		 797 aa  703    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.080388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0086  DNA topoisomerase I  52.77 
 
 		 765 aa  848    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000043689  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2711  DNA topoisomerase I  55.23 
 
 		 779 aa  877    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000391579  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3591  DNA topoisomerase I  53.36 
 
 		 824 aa  674    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.405231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3417  DNA topoisomerase I  50.14 
 
 		 961 aa  654    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0414891  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2885  DNA topoisomerase I  44.58 
 
 		 831 aa  652    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04049  DNA topoisomerase I  52.97 
 
 		 830 aa  654    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  44.16 
 
 		 758 aa  637    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  43.73 
 
 		 767 aa  651    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3660  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 783 aa  1626    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.739108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  49.8 
 
 		 836 aa  688    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3847  DNA topoisomerase I  50.72 
 
 		 977 aa  650    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0674028 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0528  DNA topoisomerase I  55.98 
 
 		 776 aa  873    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000697651  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  57.87 
 
 		 758 aa  885    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  49.6 
 
 		 780 aa  674    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  45.01 
 
 		 710 aa  646    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0191  DNA topoisomerase I  52.83 
 
 		 823 aa  703    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2277  DNA topoisomerase I  53.11 
 
 		 854 aa  699    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0137658 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  45.02 
 
 		 793 aa  649    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  47.54 
 
 		 703 aa  635  1e-180  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1133  DNA topoisomerase I  46.36 
 
 		 816 aa  634  1e-180  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0843  DNA topoisomerase I  46.36 
 
 		 869 aa  634  1e-180  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.077347  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  43.77 
 
 		 760 aa  633  1e-180  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2419  DNA topoisomerase I  47.27 
 
 		 911 aa  635  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0527527  normal  0.116125 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3508  DNA topoisomerase I  48.35 
 
 		 909 aa  633  1e-180  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.989959 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2239  DNA topoisomerase I  47.27 
 
 		 922 aa  634  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0515029  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2437  DNA topoisomerase I  48.26 
 
 		 936 aa  635  1e-180  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0547767  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0569  DNA topoisomerase I  48.85 
 
 		 877 aa  633  1e-180  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  43.73 
 
 		 747 aa  632  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3308  DNA topoisomerase I  48.64 
 
 		 910 aa  630  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.603325 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3033  DNA topoisomerase I  47.12 
 
 		 914 aa  630  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298843  normal  0.412116 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3631  DNA topoisomerase I  48.65 
 
 		 910 aa  631  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.391987 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  47.12 
 
 		 703 aa  629  1e-179  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  43.83 
 
 		 751 aa  629  1e-179  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3671  DNA topoisomerase I  48.28 
 
 		 885 aa  626  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  45.11 
 
 		 743 aa  628  1e-178  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0729  DNA topoisomerase I  46.07 
 
 		 891 aa  628  1e-178  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.074453  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4733  DNA topoisomerase I  46.84 
 
 		 916 aa  622  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.767724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  43.86 
 
 		 691 aa  625  1e-177  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0323  DNA topoisomerase I  48.05 
 
 		 820 aa  625  1e-177  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0218677  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1005  DNA topoisomerase I  47.35 
 
 		 894 aa  624  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.387965  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  45.26 
 
 		 697 aa  619  1e-176  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2485  DNA topoisomerase I  43.98 
 
 		 692 aa  620  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3684  DNA topoisomerase I  43.73 
 
 		 692 aa  615  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0116868  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3592  DNA topoisomerase I  43.73 
 
 		 692 aa  615  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00080901  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3971  DNA topoisomerase I  43.73 
 
 		 692 aa  615  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000571341  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0652  DNA topoisomerase I  48.1 
 
 		 703 aa  618  1e-175  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.957627  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3845  DNA topoisomerase I  43.73 
 
 		 692 aa  615  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.270330000000001e-60 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  43.43 
 
 		 691 aa  618  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1282  DNA topoisomerase I  47.24 
 
 		 867 aa  616  1e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390974  normal  0.233625 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1312  DNA topoisomerase I  43.86 
 
 		 692 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000876522  unclonable  7.60195e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3574  DNA topoisomerase I  43.6 
 
 		 692 aa  615  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000026995  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0750  DNA topoisomerase I  47.41 
 
 		 820 aa  613  9.999999999999999e-175  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2339  DNA topoisomerase I  47.97 
 
 		 893 aa  612  9.999999999999999e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.786994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3931  DNA topoisomerase I  43.73 
 
 		 692 aa  610  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000332787  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3656  DNA topoisomerase I  43.6 
 
 		 692 aa  610  1e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000216314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>