More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3656 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
270 aa  530  1e-150  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2757  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.79 
 
 
274 aa  221  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.447369  decreased coverage  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.11 
 
 
270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.81 
 
 
276 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.33 
 
 
270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.07 
 
 
274 aa  215  5e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.33 
 
 
276 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.19 
 
 
273 aa  211  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.24 
 
 
272 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.15 
 
 
270 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.76 
 
 
271 aa  211  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.68 
 
 
274 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.24 
 
 
271 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2541  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.81 
 
 
270 aa  209  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.68 
 
 
274 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.19 
 
 
271 aa  209  3e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.68 
 
 
274 aa  208  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.04 
 
 
264 aa  208  8e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.49 
 
 
272 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.7 
 
 
270 aa  207  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.86 
 
 
264 aa  207  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.39 
 
 
272 aa  207  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.7 
 
 
264 aa  206  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.18 
 
 
273 aa  206  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.9 
 
 
269 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24470  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.42 
 
 
279 aa  203  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2828  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.87 
 
 
270 aa  203  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.137875  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1472  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.51 
 
 
257 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000561637  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.91 
 
 
273 aa  201  9e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.18 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.53 
 
 
275 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6743  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.45 
 
 
270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.8 
 
 
270 aa  199  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.8 
 
 
273 aa  199  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.65 
 
 
279 aa  198  7.999999999999999e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00667686 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.4 
 
 
272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.4 
 
 
272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.4 
 
 
272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.33 
 
 
276 aa  196  3e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.85 
 
 
277 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.72 
 
 
270 aa  195  6e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.13 
 
 
267 aa  195  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.91 
 
 
267 aa  195  7e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.51 
 
 
267 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.02 
 
 
272 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.4 
 
 
272 aa  193  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.52 
 
 
280 aa  193  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.16 
 
 
273 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.44 
 
 
264 aa  192  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.7 
 
 
275 aa  191  9e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.19 
 
 
281 aa  191  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.02 
 
 
272 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.16 
 
 
272 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.66 
 
 
275 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.12 
 
 
275 aa  191  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.88 
 
 
272 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5062  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.7 
 
 
285 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.26 
 
 
272 aa  190  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.13 
 
 
266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0481  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.97 
 
 
267 aa  189  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790225  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.7 
 
 
293 aa  188  9e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01991  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.57 
 
 
286 aa  187  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.85 
 
 
271 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.5 
 
 
272 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.74 
 
 
272 aa  186  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2325  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.91 
 
 
282 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4590  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.57 
 
 
276 aa  186  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.02 
 
 
272 aa  186  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2167  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.26 
 
 
284 aa  186  4e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.45 
 
 
280 aa  186  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.27 
 
 
289 aa  185  7e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.42 
 
 
272 aa  185  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.54 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0533  Pyrroline-5-carboxylate reductase  41.22 
 
 
264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.18 
 
 
272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0857  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.6 
 
 
269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.42 
 
 
282 aa  183  3e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.18 
 
 
272 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.51 
 
 
271 aa  182  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.18 
 
 
271 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.401857 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00333  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.93 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3222  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.93 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3246  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.93 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0855673 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0413  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.93 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00337  hypothetical protein  39.93 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0454  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.93 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0416  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.55 
 
 
269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0460  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.55 
 
 
269 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0303  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.55 
 
 
269 aa  181  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02750  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.18 
 
 
270 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0351  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.63 
 
 
280 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0422  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.52 
 
 
269 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0423  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.52 
 
 
269 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.244975 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.95 
 
 
270 aa  180  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2273  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.16 
 
 
285 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.642771  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.81 
 
 
272 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0262  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.44 
 
 
275 aa  180  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.777137  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.12 
 
 
274 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0483  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.52 
 
 
269 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0439  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.44 
 
 
275 aa  180  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148938 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>