More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3647 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3647  threonine dehydratase  100 
 
 
516 aa  1064    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  58.48 
 
 
506 aa  599  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  58.48 
 
 
506 aa  599  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0676  threonine dehydratase  57.46 
 
 
503 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.427964 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  55.96 
 
 
507 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3269  threonine dehydratase  57.06 
 
 
502 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579031  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  57.97 
 
 
514 aa  583  1.0000000000000001e-165  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  54.27 
 
 
503 aa  579  1e-164  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  54.47 
 
 
503 aa  578  1e-164  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  56.55 
 
 
504 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  56.55 
 
 
504 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  55.09 
 
 
505 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  54.06 
 
 
507 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  53.73 
 
 
526 aa  571  1e-161  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  55.05 
 
 
507 aa  570  1e-161  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  56.42 
 
 
520 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  53.27 
 
 
507 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5288  threonine dehydratase, biosynthetic  57.82 
 
 
514 aa  566  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  54.44 
 
 
527 aa  565  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  53.14 
 
 
501 aa  567  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  53.07 
 
 
507 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5202  threonine dehydratase  57.14 
 
 
504 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5149  threonine dehydratase  56.94 
 
 
504 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5056  threonine dehydratase  56.75 
 
 
504 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.381788  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4846  threonine dehydratase  57.54 
 
 
504 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2774  threonine dehydratase  57.66 
 
 
506 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199104  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  52.87 
 
 
507 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  56.15 
 
 
504 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0316  threonine dehydratase  56.75 
 
 
504 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.167113 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3806  threonine dehydratase, biosynthetic  58.03 
 
 
507 aa  560  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.276753  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  54.56 
 
 
501 aa  558  1e-158  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1672  threonine dehydratase  57.83 
 
 
511 aa  558  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  56.85 
 
 
509 aa  561  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  52.5 
 
 
549 aa  561  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1280  threonine dehydratase  58.18 
 
 
505 aa  559  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48270  threonine dehydratase  57.14 
 
 
504 aa  559  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4221  threonine dehydratase  56.55 
 
 
504 aa  558  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  52.17 
 
 
507 aa  553  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  52.98 
 
 
511 aa  551  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1083  threonine dehydratase  53.31 
 
 
529 aa  554  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715043  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0303  threonine dehydratase  53.63 
 
 
565 aa  548  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0613066  normal  0.380423 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  53.48 
 
 
515 aa  549  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  54.37 
 
 
515 aa  548  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  54.37 
 
 
515 aa  549  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5381  threonine dehydratase  55.56 
 
 
504 aa  548  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0562  threonine dehydratase  54.06 
 
 
507 aa  548  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0354  threonine dehydratase  56.26 
 
 
509 aa  544  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  50.29 
 
 
514 aa  544  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  52.57 
 
 
509 aa  545  1e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1177  threonine dehydratase  55.24 
 
 
523 aa  542  1e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3446  threonine dehydratase  56.13 
 
 
530 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2654  threonine dehydratase  53.07 
 
 
507 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0658  threonine dehydratase  54.47 
 
 
520 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0435798  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0679  threonine dehydratase  54.47 
 
 
520 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0606689  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2318  threonine dehydratase  56.13 
 
 
519 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0020  L-threonine ammonia-lyase  52.98 
 
 
504 aa  539  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.381683  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2787  threonine dehydratase  53.27 
 
 
507 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1605  threonine dehydratase, biosynthetic  52.77 
 
 
506 aa  535  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.677814  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4123  threonine dehydratase  52.75 
 
 
510 aa  537  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0340  threonine dehydratase  52.37 
 
 
506 aa  537  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.432772 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1311  threonine dehydratase, biosynthetic  55.65 
 
 
503 aa  535  1e-151  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.484078  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0743  threonine dehydratase  52.86 
 
 
519 aa  535  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2490  threonine dehydratase  56.52 
 
 
519 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138025  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0087  threonine dehydratase  56.75 
 
 
504 aa  535  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0325  threonine dehydratase  52.37 
 
 
506 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.370445  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2766  threonine dehydratase  52.67 
 
 
507 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417211  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0181  threonine dehydratase  52.67 
 
 
507 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0840  threonine dehydratase  52.67 
 
 
507 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0549  threonine dehydratase  53.27 
 
 
507 aa  534  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2392  threonine dehydratase  52.67 
 
 
507 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0662  threonine dehydratase  52.48 
 
 
507 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0370  threonine dehydratase  52.48 
 
 
507 aa  535  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1900  threonine dehydratase, biosynthetic  52.17 
 
 
506 aa  534  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0677  threonine dehydratase  52.67 
 
 
507 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2312  threonine dehydratase  52.67 
 
 
507 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.345291  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2231  threonine dehydratase  52.1 
 
 
524 aa  530  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.485473  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3386  L-threonine ammonia-lyase  51.98 
 
 
503 aa  528  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.334671 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0645  threonine dehydratase  51.88 
 
 
507 aa  531  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.701109  normal  0.544724 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  48.33 
 
 
513 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5685  threonine dehydratase  52.29 
 
 
517 aa  527  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000112731  normal  0.257645 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1431  threonine dehydratase  53.03 
 
 
509 aa  523  1e-147  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0729808 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1144  threonine dehydratase  52.58 
 
 
535 aa  523  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15844  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2039  threonine dehydratase  51.9 
 
 
524 aa  523  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4054  threonine dehydratase  51.68 
 
 
535 aa  522  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.536214 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  49.51 
 
 
511 aa  524  1e-147  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1725  threonine dehydratase  51.98 
 
 
535 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3338  threonine dehydratase, biosynthetic  54.49 
 
 
511 aa  522  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  49.31 
 
 
511 aa  521  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0413  threonine dehydratase  52.05 
 
 
519 aa  521  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0284  threonine dehydratase  51.98 
 
 
535 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.832486  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1809  threonine dehydratase  51.79 
 
 
535 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1763  threonine dehydratase, biosynthetic  54.46 
 
 
512 aa  519  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3288  threonine dehydratase, biosynthetic  55.51 
 
 
514 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172901  normal  0.134421 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0354  threonine dehydratase  51.08 
 
 
565 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5252  threonine dehydratase, biosynthetic  55.6 
 
 
515 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.871195  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15381  threonine dehydratase  52.46 
 
 
514 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.313826 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3223  threonine dehydratase, biosynthetic  53.4 
 
 
512 aa  513  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49047  l-threonine ammonia-lyase  50.1 
 
 
606 aa  509  1e-143  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.866709  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0696  threonine dehydratase, biosynthetic  56.05 
 
 
507 aa  509  1e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0627  threonine dehydratase, biosynthetic  53.91 
 
 
509 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.554958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>