More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3643 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  100 
 
 
442 aa  890    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  36.28 
 
 
434 aa  290  3e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  35.45 
 
 
434 aa  287  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  35.45 
 
 
434 aa  287  2.9999999999999996e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  35.45 
 
 
434 aa  287  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  35.65 
 
 
436 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  35.71 
 
 
448 aa  280  3e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  35.08 
 
 
435 aa  280  5e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3265  trigger factor  36.28 
 
 
434 aa  278  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108339  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  34.09 
 
 
434 aa  277  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  34.55 
 
 
434 aa  276  7e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2878  trigger factor  35.6 
 
 
434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125506  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  33.56 
 
 
432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  33.56 
 
 
432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  33.79 
 
 
432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  34.01 
 
 
432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  33.56 
 
 
432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  33.56 
 
 
432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  33.56 
 
 
432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  33.56 
 
 
432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  33.56 
 
 
432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  34.01 
 
 
432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  33.56 
 
 
432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  33.79 
 
 
432 aa  273  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  33.79 
 
 
432 aa  273  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  33.79 
 
 
432 aa  273  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  33.26 
 
 
432 aa  271  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  34.34 
 
 
435 aa  270  4e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  34.55 
 
 
435 aa  270  5e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  34.8 
 
 
435 aa  269  7e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  34.7 
 
 
434 aa  268  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  35.16 
 
 
435 aa  267  2.9999999999999995e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  35.52 
 
 
436 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  33.79 
 
 
434 aa  264  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1677  trigger factor  31.28 
 
 
443 aa  263  3e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294765  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  33.56 
 
 
434 aa  263  4e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  33.56 
 
 
434 aa  263  4e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  35.32 
 
 
435 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  33.33 
 
 
434 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  33.33 
 
 
434 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  33.33 
 
 
434 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  33.33 
 
 
434 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  33.33 
 
 
434 aa  261  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  32.19 
 
 
434 aa  261  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  34.02 
 
 
432 aa  261  2e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  33.56 
 
 
434 aa  260  4e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  33.79 
 
 
434 aa  259  8e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2496  trigger factor  33.33 
 
 
434 aa  259  9e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000460382  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  35.45 
 
 
445 aa  258  1e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  33.11 
 
 
434 aa  257  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  34.02 
 
 
441 aa  258  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  32.88 
 
 
434 aa  256  5e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  34.17 
 
 
435 aa  256  6e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0817  trigger factor  32.65 
 
 
432 aa  255  9e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153407  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  32.71 
 
 
433 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  34.02 
 
 
434 aa  253  4.0000000000000004e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  33.26 
 
 
436 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  35.21 
 
 
439 aa  253  5.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  33.26 
 
 
436 aa  253  6e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  32.57 
 
 
436 aa  253  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  37.26 
 
 
446 aa  253  7e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3698  trigger factor  32.35 
 
 
436 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3497  trigger factor  32.88 
 
 
436 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0314111  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  37.71 
 
 
425 aa  250  4e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  32.86 
 
 
431 aa  249  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2299  trigger factor  34.25 
 
 
443 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  33.26 
 
 
444 aa  248  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1901  trigger factor  33.79 
 
 
437 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191378  hitchhiker  0.00938494 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2597  trigger factor  32.19 
 
 
434 aa  249  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000131318  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41250  trigger factor  32.65 
 
 
436 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.755772 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3470  trigger factor  34.02 
 
 
437 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000745697 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  33.73 
 
 
433 aa  248  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2233  trigger factor  33.33 
 
 
447 aa  248  2e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0292986  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  32.42 
 
 
436 aa  247  3e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  33.79 
 
 
437 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1826  trigger factor  34.38 
 
 
443 aa  247  4e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  33.18 
 
 
463 aa  247  4e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  34.01 
 
 
447 aa  246  6e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2341  trigger factor  31.38 
 
 
435 aa  246  6.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0955017  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  35.08 
 
 
428 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  34.45 
 
 
433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1830  trigger factor  33.89 
 
 
443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2289  trigger factor  33.11 
 
 
450 aa  242  7.999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.410432 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23550  trigger factor  32.65 
 
 
436 aa  240  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  36.59 
 
 
425 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  36.31 
 
 
425 aa  238  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  32.58 
 
 
512 aa  238  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  33.73 
 
 
433 aa  239  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  36.31 
 
 
425 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  36.31 
 
 
425 aa  238  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  36.31 
 
 
425 aa  238  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  36.31 
 
 
425 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0909  trigger factor  30.68 
 
 
434 aa  238  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1030  trigger factor  30.68 
 
 
434 aa  238  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.553429  hitchhiker  0.0000000130547 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  36.31 
 
 
425 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  35.64 
 
 
433 aa  237  3e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  35.64 
 
 
433 aa  237  3e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  38.27 
 
 
428 aa  237  4e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  31.94 
 
 
437 aa  237  4e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  36.03 
 
 
425 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>