167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3603 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3603  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 229 aa  452  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0139  TrkA-N domain protein  36.2 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0249  TrkA-N domain protein  33.48 
 
 		 219 aa  128  9.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  31.98 
 
 		 215 aa  125  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  32.88 
 
 		 215 aa  125  5e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000226197  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  34.25 
 
 		 227 aa  125  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  29.91 
 
 		 217 aa  124  9e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  34.25 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  33.79 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1854  potassium uptake protein  30.14 
 
 		 221 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0461191  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2142  putative potassium uptake protein  30.14 
 
 		 221 aa  121  8e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.897368  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0416  TrkA domain-containing protein  32.88 
 
 		 217 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000130553  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0085  K+ transport systems, NAD-binding component  30.05 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.73294e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1617  TrkA domain-containing protein  29.03 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1392  TrkA-N domain protein  33.64 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.643107  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3557  TrkA-N domain protein  32.54 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.647516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0141  TrkA domain-containing protein  28.3 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00479404  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0104  TrkA-N domain protein  28.25 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200527  hitchhiker  0.0000000000000167844 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0339  TrkA-N domain protein  29.86 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00738023  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0523  TrkA-N domain protein  32.73 
 
 		 223 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  29.86 
 
 		 220 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0267  TrkA-N domain protein  29.77 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0313  TrkA domain-containing protein  32 
 
 		 230 aa  105  4e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000239618  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1834  TrkA-N  28 
 
 		 233 aa  105  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.423842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2303  putative cation transporter  31.08 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1711  TrkA-N domain protein  31.08 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382687  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0952  TrkA-N domain protein  31.53 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6144  TrkA-N  33.78 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674267  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1043  hypothetical protein  27.91 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00981  VIC family potassium channel protein  30.04 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0088  VIC family potassium channel protein  30.04 
 
 		 234 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00971  VIC family potassium channel protein  30.04 
 
 		 234 aa  101  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0321337  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2314  VIC family potassium channel protein  34.53 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.537657  normal  0.229836 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3209  TrkA-N domain protein  29.41 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.652247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3882  TrkA-N  28.05 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.94887  decreased coverage  0.00720211 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1928  TrkA domain-containing protein  27.65 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4804  TrkA-N  29.41 
 
 		 231 aa  99.8  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00951  VIC family potassium channel protein  30.94 
 
 		 234 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.304573  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  27.15 
 
 		 221 aa  99  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000338081  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3465  TrkA-N domain-containing protein  27.6 
 
 		 231 aa  98.6  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  27.15 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  27.15 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  27.15 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  27.15 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  27.15 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  27.15 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  27.15 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  27.15 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00941  VIC family potassium channel protein  30.8 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  27.15 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1449  putative potassium channel, VIC family  29.6 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.286988  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01511  VIC family potassium channel protein  29.6 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3805  TrkA domain-containing protein  27.15 
 
 		 221 aa  97.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0251033  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0379  VIC family potassium channel protein  32.59 
 
 		 234 aa  95.5  6e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1793  TrkA-N domain protein  31.16 
 
 		 220 aa  95.1  8e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  26.58 
 
 		 219 aa  94.7  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1584  TrkA-N  33.02 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.514465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  27.03 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18040  K+ transport system, NAD-binding component  32.26 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  26.13 
 
 		 220 aa  93.6  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  26.13 
 
 		 220 aa  93.6  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4091  TrkA-N domain protein  28.77 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0232188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4052  TrkA-N domain protein  28.77 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0012  TrkA-N domain protein  26.89 
 
 		 216 aa  91.3  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0122  TrkA-N domain protein  26.85 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00122863  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2841  TrkA-N domain protein  29.03 
 
 		 222 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal  0.066626 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004055  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  28.11 
 
 		 220 aa  90.5  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.248543  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01407  hypothetical protein  27.65 
 
 		 220 aa  90.5  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1833  TrkA-N domain protein  27.06 
 
 		 244 aa  90.1  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2828  TrkA-N domain protein  28.05 
 
 		 250 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0119084 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14840  K+ transport system, NAD-binding component  30.1 
 
 		 229 aa  89  6e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.289305  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02541  putative potassium channel, VIC family  29.2 
 
 		 234 aa  88.6  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0398  TrkA-N  28.77 
 
 		 224 aa  88.6  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.81484  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0458  potassium uptake protein KtrA  26.13 
 
 		 220 aa  88.2  9e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2069  TrkA-N domain protein  24.32 
 
 		 228 aa  87.4  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4249  TrkA-N domain protein  27.05 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1353  TrkA-N domain protein  29.55 
 
 		 217 aa  87.4  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36690  K+ transport system, NAD-binding component  28.51 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164115  normal  0.724398 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0350  K+ transport system, NAD-binding component  26.7 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.53262  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24350  K+ transport system, NAD-binding component  29.89 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1631  Trk family potassium uptake protein , putative  25.34 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0428  TrkA-N domain protein  29.63 
 
 		 225 aa  85.1  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0519  TrkA-N domain protein  27.23 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.416454  normal  0.506126 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1606  K+ uptake transporter, KtrA subunit  26.22 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000611134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0372  TrkA domain-containing protein  29.72 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.849541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4247  TrkA-N domain protein  29.33 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.61262 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4040  TrkA-N domain protein  30.52 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0294  TrkA domain-containing protein  23.74 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0137  TRK system potassium uptake protein TrkA, putative  27.06 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0728  TrkA-N domain protein  31.16 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.439731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1585  TrkA-N domain protein  21.86 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453253  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0630  TrkA-N domain protein  27.18 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.208337  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0214  TrkA-N  25.91 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3347  TrkA domain-containing protein  28.8 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3145  TrkA-N domain protein  28.8 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.436065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7573  TrkA-N domain protein  27.05 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.879249  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1541  TrkA-N domain protein  27.57 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1513  TrkA-N domain-containing protein  27.67 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0505  TrkA-N domain protein  28.24 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0590826 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0750  TrkA domain-containing protein  24.66 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.803573  normal  0.253071 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>