More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3587 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3587  small GTP-binding protein  100 
 
 
495 aa  1013    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.748458  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  48.46 
 
 
444 aa  419  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  43.57 
 
 
438 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  45.3 
 
 
438 aa  392  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2126  GTP-binding protein EngA  44.33 
 
 
449 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.127058  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  43.01 
 
 
439 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  43.98 
 
 
440 aa  383  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  43.67 
 
 
440 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1630  small GTP-binding protein  41.89 
 
 
440 aa  379  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.52918  hitchhiker  0.00197431 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  42.17 
 
 
441 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2045  GTP-binding protein EngA  44.73 
 
 
464 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  44.2 
 
 
439 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  44.44 
 
 
441 aa  378  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1727  GTP-binding protein EngA  44.1 
 
 
448 aa  378  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2108  GTP-binding protein EngA  43.29 
 
 
443 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000750275  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0596  GTP-binding protein EngA  44.78 
 
 
467 aa  375  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115321  hitchhiker  0.00000000000000451977 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  43.04 
 
 
438 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  43.04 
 
 
438 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1227  GTP-binding protein EngA  41.5 
 
 
436 aa  369  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.718862  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1809  small GTP-binding protein  43.14 
 
 
446 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000018958  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1614  GTP-binding protein EngA  43.12 
 
 
499 aa  368  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106208 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1759  GTP-binding protein EngA  40.74 
 
 
473 aa  366  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739039 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  41.23 
 
 
434 aa  364  3e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2159  GTP-binding protein EngA  41.28 
 
 
436 aa  363  4e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0656  GTP-binding protein EngA  42.55 
 
 
480 aa  362  6e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0686  GTP-binding protein EngA  41.91 
 
 
473 aa  362  8e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3492  small GTP-binding protein  41.79 
 
 
473 aa  362  1e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.166224 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  41.96 
 
 
439 aa  362  1e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1428  GTP-binding protein EngA  40.84 
 
 
436 aa  361  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3785  GTP-binding protein EngA  40.84 
 
 
436 aa  362  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0456792  normal  0.0699486 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1667  GTP-binding protein EngA  39.74 
 
 
436 aa  361  2e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1631  GTP-binding protein EngA  39.74 
 
 
436 aa  361  2e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1414  GTP-binding protein EngA  39.74 
 
 
436 aa  361  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1386  GTP-binding protein EngA  39.74 
 
 
436 aa  361  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.844345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1386  GTP-binding protein EngA  39.74 
 
 
436 aa  361  2e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0845142  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2134  GTP-binding protein EngA  41.58 
 
 
458 aa  361  2e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0583205  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1525  GTP-binding protein EngA  39.74 
 
 
436 aa  361  2e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1559  GTP-binding protein EngA  39.74 
 
 
436 aa  361  2e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0922672  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1598  GTP-binding protein EngA  39.74 
 
 
436 aa  361  2e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000589883 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1043  GTP-binding protein EngA  41.18 
 
 
436 aa  358  9.999999999999999e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.617691  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0359  GTP-binding protein EngA  40.09 
 
 
436 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2713  GTP-binding protein EngA  43.16 
 
 
490 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2373  GTP-binding protein EngA  43.07 
 
 
466 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.537703  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0460  GTP-binding protein EngA  40.84 
 
 
436 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  41.98 
 
 
441 aa  357  2.9999999999999997e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  40.74 
 
 
440 aa  357  3.9999999999999996e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  41.01 
 
 
438 aa  356  5e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0799  GTP-binding protein EngA  38.99 
 
 
436 aa  354  2e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.940642  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2303  GTP-binding protein EngA  42.06 
 
 
447 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0637103  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2146  GTP-binding protein EngA  41.14 
 
 
493 aa  353  5e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  42.15 
 
 
494 aa  351  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1172  GTP-binding protein EngA  41.72 
 
 
489 aa  352  1e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.120565  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0738  ribosome-associated GTPase EngA  42.2 
 
 
484 aa  351  2e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.922813  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1122  GTP-binding protein EngA  40.41 
 
 
497 aa  350  3e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.827994  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  40.13 
 
 
441 aa  350  3e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2191  GTP-binding protein EngA  42.03 
 
 
447 aa  350  3e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02403  GTP-binding protein EngA  42.32 
 
 
490 aa  350  4e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000560332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1157  small GTP-binding protein  42.32 
 
 
490 aa  350  4e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000141762  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02365  hypothetical protein  42.32 
 
 
490 aa  350  4e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00134909  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2662  GTP-binding protein EngA  42.32 
 
 
490 aa  350  4e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000307508  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3735  GTP-binding protein EngA  42.32 
 
 
490 aa  350  4e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0134821  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2795  GTP-binding protein EngA  42.32 
 
 
490 aa  350  4e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000215643  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1166  GTP-binding protein EngA  42.32 
 
 
490 aa  350  4e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000585661  normal  0.0127623 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2663  GTP-binding protein EngA  42.32 
 
 
490 aa  350  4e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.194974 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3010  GTP-binding protein EngA  41.72 
 
 
495 aa  349  5e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0625  small GTP-binding protein domain-containing protein  41.88 
 
 
480 aa  349  6e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2082  GTP-binding protein EngA  42.24 
 
 
447 aa  349  7e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543675  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  41.27 
 
 
439 aa  349  7e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0822  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.89 
 
 
464 aa  349  8e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.460708  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0292  GTP-binding protein EngA  40.4 
 
 
494 aa  348  8e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1620  GTP-binding protein EngA  38.77 
 
 
436 aa  348  1e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2498  GTP-binding protein EngA  41.58 
 
 
602 aa  348  1e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1075  small GTP-binding protein  40.82 
 
 
438 aa  348  1e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3005  GTP-binding protein EngA  42.38 
 
 
490 aa  348  1e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.198767  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2886  GTP-binding protein EngA  42.32 
 
 
490 aa  348  1e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684219  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3005  GTP-binding protein EngA  41.08 
 
 
460 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.325  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0733  GTP-binding protein EngA  40.33 
 
 
500 aa  348  2e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1297  GTP-binding protein EngA  41.63 
 
 
495 aa  347  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1190  GTP-binding protein EngA  41.63 
 
 
495 aa  347  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000499446  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0414  GTP-binding protein EngA  41.63 
 
 
495 aa  347  3e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0317617  hitchhiker  0.000999032 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3776  GTP-binding protein EngA  41.33 
 
 
456 aa  347  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350234  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2279  GTP-binding protein EngA  40.73 
 
 
460 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0830899  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  41.33 
 
 
448 aa  346  5e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1992  GTP-binding protein EngA  42.7 
 
 
446 aa  345  8e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.916192  normal  0.0223311 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1262  GTP-binding protein EngA  41.3 
 
 
495 aa  345  8.999999999999999e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.763175  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2238  GTP-binding protein EngA  42.15 
 
 
445 aa  345  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.746998  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1832  GTP-binding protein EngA  40.86 
 
 
445 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5109  GTP-binding protein EngA  40.65 
 
 
445 aa  344  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314704  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6271  GTP-binding protein EngA  40.86 
 
 
445 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1808  GTP-binding protein EngA  40.86 
 
 
445 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2892  GTPase family protein  41.99 
 
 
463 aa  343  4e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1746  GTP-binding protein EngA  40.65 
 
 
445 aa  343  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4321  GTP-binding protein EngA  41.33 
 
 
487 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000597657 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2390  GTP-binding protein EngA  41.74 
 
 
441 aa  343  5e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000149599  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1131  GTP-binding protein EngA  40.62 
 
 
473 aa  342  5.999999999999999e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3605  GTP-binding protein EngA  41.21 
 
 
494 aa  342  5.999999999999999e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1291  GTP-binding protein EngA  38.95 
 
 
436 aa  343  5.999999999999999e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0244351  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  40 
 
 
440 aa  342  7e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1467  GTP-binding protein EngA  40.86 
 
 
445 aa  342  7e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496612  normal  0.453892 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  41.76 
 
 
440 aa  342  7e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>