158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3524 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 
341 aa  706    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  51.45 
 
 
343 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  54.81 
 
 
343 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  51.45 
 
 
343 aa  384  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  51.16 
 
 
343 aa  380  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  50.15 
 
 
343 aa  369  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  52.6 
 
 
346 aa  360  2e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  54.36 
 
 
343 aa  355  5.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  52.17 
 
 
344 aa  351  1e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  50 
 
 
346 aa  343  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  47.37 
 
 
342 aa  340  1e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  47.97 
 
 
343 aa  327  1.0000000000000001e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  47.51 
 
 
338 aa  320  3e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  47.09 
 
 
344 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  48.66 
 
 
339 aa  314  1.9999999999999998e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  48.66 
 
 
339 aa  313  3.9999999999999997e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  46.97 
 
 
344 aa  311  1e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  47.26 
 
 
344 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.51 
 
 
343 aa  307  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  47.81 
 
 
343 aa  299  4e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  43.6 
 
 
343 aa  297  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  44.61 
 
 
343 aa  292  7e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  46.9 
 
 
344 aa  290  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  44.02 
 
 
343 aa  288  7e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  45.43 
 
 
344 aa  288  1e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  46.4 
 
 
344 aa  281  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.69 
 
 
343 aa  281  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  45.45 
 
 
343 aa  276  5e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.71 
 
 
342 aa  272  7e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.23 
 
 
342 aa  260  2e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  40.7 
 
 
346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  36.53 
 
 
598 aa  226  5.0000000000000005e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  36.09 
 
 
333 aa  225  9e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  35.52 
 
 
545 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  35.67 
 
 
594 aa  199  5e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  34.4 
 
 
559 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.74 
 
 
339 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  32.04 
 
 
550 aa  194  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.82 
 
 
344 aa  192  7e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.52 
 
 
544 aa  192  8e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  34.32 
 
 
570 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.74 
 
 
339 aa  190  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  34.76 
 
 
553 aa  182  7e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  34.11 
 
 
339 aa  182  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  32.93 
 
 
580 aa  179  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.63 
 
 
330 aa  177  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.53 
 
 
350 aa  170  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  33.53 
 
 
326 aa  170  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  32.44 
 
 
727 aa  168  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.44 
 
 
731 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  31.02 
 
 
325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  31.02 
 
 
325 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  30.47 
 
 
331 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.97 
 
 
347 aa  162  6e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.38 
 
 
334 aa  162  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  31.77 
 
 
731 aa  161  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  30.5 
 
 
325 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  29.49 
 
 
336 aa  158  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  33.67 
 
 
558 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.97 
 
 
333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  33.72 
 
 
525 aa  156  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  29.2 
 
 
325 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  29.52 
 
 
334 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.05 
 
 
350 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.29 
 
 
332 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.9 
 
 
347 aa  149  8e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.18 
 
 
332 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  29.52 
 
 
330 aa  144  3e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  32.23 
 
 
330 aa  143  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.68 
 
 
337 aa  139  7.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  27.22 
 
 
336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.13 
 
 
331 aa  132  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  30.95 
 
 
329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.85 
 
 
331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  26.58 
 
 
330 aa  129  6e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  27.62 
 
 
337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3303  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.11 
 
 
338 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1289  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.11 
 
 
306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  33.33 
 
 
336 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  26.54 
 
 
330 aa  124  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  29.67 
 
 
323 aa  123  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  26.94 
 
 
331 aa  122  8e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1154  hypothetical protein  31.13 
 
 
371 aa  122  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00923322  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  26.22 
 
 
333 aa  122  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  26.33 
 
 
331 aa  121  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.38 
 
 
337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12831  hypothetical protein  28.18 
 
 
338 aa  120  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00550704  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  25 
 
 
330 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  26.47 
 
 
333 aa  119  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0161  hypothetical protein  28.41 
 
 
330 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  25 
 
 
330 aa  117  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.31 
 
 
330 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0127  CRISPR-associated protein Cas1  25.81 
 
 
326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0708  CRISPR-associated protein Cas1  30.27 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000161833  hitchhiker  0.00702489 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1651  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.98 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1800  CRISPR-associated protein Cas1  29.04 
 
 
691 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0919  CRISPR-associated protein Cas1  26.21 
 
 
330 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000247044 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1727  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.3 
 
 
321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.914147 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  24.42 
 
 
331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1127  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.71 
 
 
333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.168006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>