More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3514 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1797  Alpha amylase, catalytic region  66.36 
 
 		 651 aa  924    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126302  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  65.02 
 
 		 650 aa  905    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2611  alpha amylase, catalytic region  63.94 
 
 		 650 aa  903    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3514  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 651 aa  1358    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.482546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  44.03 
 
 		 652 aa  548  1e-154  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  43.32 
 
 		 644 aa  526  1e-148  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3590  alpha amylase catalytic region  43.93 
 
 		 661 aa  522  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0704974 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0218  Alpha amylase, catalytic region  42.51 
 
 		 650 aa  513  1e-144  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  40.25 
 
 		 645 aa  513  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  40.87 
 
 		 646 aa  514  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0308  alpha amylase catalytic subunit  41.88 
 
 		 636 aa  511  1e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  39.69 
 
 		 649 aa  505  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1153  alpha amylase catalytic region  40.66 
 
 		 657 aa  502  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00213284  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  43.23 
 
 		 663 aa  500  1e-140  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  40.99 
 
 		 638 aa  485  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0572  alpha amylase, catalytic region  45.65 
 
 		 650 aa  479  1e-134  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  40.65 
 
 		 643 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3860  alpha amylase catalytic region  39.65 
 
 		 667 aa  468  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25520  glycosidase  38.08 
 
 		 642 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.563974  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3322  alpha amylase catalytic region  38.97 
 
 		 672 aa  443  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  39.27 
 
 		 641 aa  442  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1690  alpha amylase catalytic region  37.68 
 
 		 639 aa  441  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.526546  normal  0.114706 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1267  alpha amylase, catalytic region  38.99 
 
 		 645 aa  424  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02416  alpha-amlyase  35.36 
 
 		 638 aa  388  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  29.87 
 
 		 551 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  28.21 
 
 		 601 aa  219  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  29.61 
 
 		 596 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1799  alpha amylase catalytic region  29.41 
 
 		 534 aa  219  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  29.61 
 
 		 596 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  29.61 
 
 		 596 aa  219  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  28.32 
 
 		 1088 aa  218  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  28.07 
 
 		 551 aa  216  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  28.82 
 
 		 682 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  28.87 
 
 		 553 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10127  trehalose synthase treS  29.24 
 
 		 601 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000502471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  28.55 
 
 		 567 aa  214  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  27.8 
 
 		 1088 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  27.8 
 
 		 1088 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  27.45 
 
 		 1092 aa  211  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  27.83 
 
 		 606 aa  211  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  28.82 
 
 		 1110 aa  207  6e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  28.3 
 
 		 591 aa  207  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6073  trehalose synthase  29.22 
 
 		 604 aa  207  7e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.887339  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  27.07 
 
 		 571 aa  206  8e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  28.17 
 
 		 548 aa  205  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  28 
 
 		 556 aa  204  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  28.55 
 
 		 1100 aa  204  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3091  trehalose synthase  28.4 
 
 		 582 aa  204  4e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000061423  hitchhiker  0.00000215015 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  28.57 
 
 		 558 aa  203  6e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  27.99 
 
 		 1093 aa  203  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  27.79 
 
 		 572 aa  203  7e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  27.77 
 
 		 577 aa  203  7e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  28 
 
 		 1113 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  28.32 
 
 		 1152 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  27.79 
 
 		 553 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  28.7 
 
 		 1102 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  28.55 
 
 		 1154 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  27.79 
 
 		 572 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  29.06 
 
 		 1114 aa  201  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  28.72 
 
 		 1154 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  28.55 
 
 		 1108 aa  200  7.999999999999999e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  28.54 
 
 		 567 aa  199  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  28.62 
 
 		 1102 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  28.25 
 
 		 1108 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  28.62 
 
 		 1102 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  28.1 
 
 		 1088 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  27.92 
 
 		 1104 aa  198  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  28.37 
 
 		 1101 aa  198  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  27.37 
 
 		 1101 aa  197  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  27.72 
 
 		 1093 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  26.69 
 
 		 562 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  28.42 
 
 		 1108 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  27.8 
 
 		 1085 aa  197  7e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  28.86 
 
 		 1115 aa  196  8.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  26.54 
 
 		 1121 aa  196  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  27.74 
 
 		 1121 aa  196  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  27.71 
 
 		 1088 aa  196  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  27.62 
 
 		 556 aa  195  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8020  trehalose synthase  27.14 
 
 		 553 aa  195  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  28.1 
 
 		 1094 aa  194  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  28.37 
 
 		 1061 aa  194  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  28.52 
 
 		 1109 aa  195  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  27.21 
 
 		 1100 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  27.07 
 
 		 1100 aa  194  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  28.1 
 
 		 1131 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  26.83 
 
 		 1112 aa  192  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  28.1 
 
 		 1131 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0738  trehalose synthase  26.7 
 
 		 598 aa  192  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  28.1 
 
 		 1131 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  26.97 
 
 		 1099 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  27.38 
 
 		 572 aa  192  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  28.1 
 
 		 1131 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  28.1 
 
 		 1131 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09530  trehalose synthase  28.22 
 
 		 616 aa  191  4e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126858  normal  0.324704 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  26.92 
 
 		 1142 aa  190  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  27.75 
 
 		 1100 aa  190  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  27.92 
 
 		 1131 aa  190  8e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  26.88 
 
 		 598 aa  189  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  28.36 
 
 		 1113 aa  189  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36730  putative trehalose synthase  27.9 
 
 		 1100 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.631838 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>