More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3494 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  100 
 
 
530 aa  1079    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  43.53 
 
 
542 aa  412  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3869  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  44.37 
 
 
506 aa  379  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0061  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  41.31 
 
 
558 aa  382  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  41.98 
 
 
553 aa  381  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0071  2-octaprenylphenol hydroxylase  40.68 
 
 
553 aa  380  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  44.55 
 
 
504 aa  374  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0213  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.9 
 
 
522 aa  370  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.331416 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0400  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  40.46 
 
 
546 aa  371  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0521  2-octaprenylphenol hydroxylase  44.64 
 
 
527 aa  368  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273302  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4010  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.61 
 
 
522 aa  366  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000133652 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  38.4 
 
 
549 aa  365  1e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0385  2-octaprenylphenol hydroxylase  43.48 
 
 
534 aa  364  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.59 
 
 
509 aa  364  2e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66920  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.26 
 
 
533 aa  364  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5804  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  43.11 
 
 
533 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4887  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  43.56 
 
 
540 aa  362  8e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  38.19 
 
 
549 aa  361  2e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45430  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  44.57 
 
 
537 aa  360  3e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0461  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.51 
 
 
525 aa  360  4e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2345  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.23 
 
 
557 aa  360  5e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0434  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  42.27 
 
 
525 aa  359  6e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0696  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  42.39 
 
 
514 aa  359  8e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0387  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  42.31 
 
 
539 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  42.18 
 
 
547 aa  358  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0101  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  42.21 
 
 
561 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207696  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0351  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.9 
 
 
525 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.594267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0336  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.9 
 
 
525 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0784  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  44.92 
 
 
517 aa  357  3.9999999999999996e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5152  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  42.27 
 
 
539 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0374  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.38 
 
 
525 aa  355  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.218508 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5063  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  43.27 
 
 
540 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.6439  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0452  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  42.89 
 
 
539 aa  352  8e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.755983  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0863  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  44.31 
 
 
517 aa  352  8.999999999999999e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0745  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.71 
 
 
547 aa  351  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0250  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.43 
 
 
543 aa  350  3e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.370587 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3797  2-octaprenylphenol hydroxylase  41.72 
 
 
519 aa  349  7e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00377233  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4098  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.1 
 
 
549 aa  348  1e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4126  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  43.62 
 
 
521 aa  348  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0185917  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1067  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  42.76 
 
 
525 aa  347  3e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.487592  normal  0.456322 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0377  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.33 
 
 
527 aa  347  5e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0429  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.2 
 
 
549 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000673337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5458  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  44.95 
 
 
521 aa  345  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.2 
 
 
549 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.915437  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0870  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  42.92 
 
 
521 aa  345  1e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216871  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3375  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.03 
 
 
549 aa  345  1e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3897  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.2 
 
 
549 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4047  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.59 
 
 
525 aa  344  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.690468 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0525  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.92 
 
 
549 aa  344  2e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0443  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.2 
 
 
549 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.627543 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4510  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  41.63 
 
 
511 aa  345  2e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.850081  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03488  predicted protein kinase  42.04 
 
 
529 aa  343  2.9999999999999997e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3204  ubiquinone biosynthesis protein AarF  38.89 
 
 
549 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0971234  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0595  2-octaprenylphenol hydroxylase  42.63 
 
 
540 aa  343  5e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294006  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2702  2-octaprenylphenol hydroxylase  39.17 
 
 
534 aa  343  5.999999999999999e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136263 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2430  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  42.42 
 
 
544 aa  343  5.999999999999999e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4054  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.82 
 
 
546 aa  342  8e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3794  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  41.15 
 
 
549 aa  342  8e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.647257  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0305  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  41.82 
 
 
560 aa  342  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0481  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  41.82 
 
 
560 aa  342  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0128618  hitchhiker  0.0000163657 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0799  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  42.69 
 
 
521 aa  342  1e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0387  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  41.16 
 
 
527 aa  342  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00400126  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3913  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.99 
 
 
545 aa  341  2e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3367  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  42.09 
 
 
509 aa  341  2e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1294  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  44.09 
 
 
521 aa  341  2e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0881794  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0544  2-octaprenylphenol hydroxylase  42.76 
 
 
544 aa  341  2e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0652  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.08 
 
 
525 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.559631 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0556  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.98 
 
 
525 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001925  ubiquinone biosynthesis monooxygenase UbiB  38.69 
 
 
544 aa  339  5.9999999999999996e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4245  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.16 
 
 
546 aa  339  7e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.806176  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2998  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.56 
 
 
543 aa  339  8e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2120  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase accessory protein  40.19 
 
 
541 aa  338  9.999999999999999e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.191993  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0570  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.75 
 
 
525 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438244  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3553  2-octaprenylphenol hydroxylase  38.89 
 
 
549 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.96851  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0403  2-octaprenylphenol hydroxylase  38.89 
 
 
549 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.977603  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00564  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.9 
 
 
544 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1065  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  42 
 
 
527 aa  338  1.9999999999999998e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.277258  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6056  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  43.83 
 
 
525 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3641  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  44.84 
 
 
522 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.302348  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2647  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  42.45 
 
 
525 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.155538 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1003  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  43.32 
 
 
527 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.232865  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4218  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.36 
 
 
546 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00118244 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2117  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  43.83 
 
 
525 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2756  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  43.83 
 
 
525 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2780  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  43.58 
 
 
525 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2729  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  43.83 
 
 
525 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142339  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3727  2-octaprenylphenol hydroxylase  38.89 
 
 
549 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3657  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  40.54 
 
 
534 aa  337  2.9999999999999997e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.6671799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4208  2-octaprenylphenol hydroxylase  40.42 
 
 
509 aa  337  2.9999999999999997e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3958  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.5 
 
 
546 aa  337  3.9999999999999995e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0959958 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0065  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  40 
 
 
541 aa  337  3.9999999999999995e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1321  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  44.72 
 
 
521 aa  336  5.999999999999999e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0459359  normal  0.0103922 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0189  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.75 
 
 
525 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2321  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.75 
 
 
525 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0848  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.75 
 
 
525 aa  335  9e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.120118  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4637  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  40.32 
 
 
524 aa  335  9e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.657767  normal  0.0525544 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2757  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.75 
 
 
525 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.925826  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0686  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.75 
 
 
525 aa  335  9e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2401  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.75 
 
 
525 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0670  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.75 
 
 
525 aa  335  9e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>