More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3481 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 282 aa  584  1e-166  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1140  short-chain dehydrogenase/reductase  65.2 
 
 		 279 aa  354  8.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.68 
 
 		 286 aa  331  6e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2186  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  61.07 
 
 		 281 aa  329  3e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0805  short chain dehydrogenase  54.68 
 
 		 275 aa  314  9.999999999999999e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01319  short chain dehydrogenase  55.43 
 
 		 275 aa  308  8e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.52 
 
 		 285 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.72 
 
 		 300 aa  303  3.0000000000000004e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0898899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004148  putative oxidoreductase  55.43 
 
 		 275 aa  301  8.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0500  short chain dehydrogenase  55.81 
 
 		 275 aa  298  5e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.65 
 
 		 290 aa  293  3e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1694  short-chain dehydrogenase/reductase  55.85 
 
 		 271 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.85 
 
 		 271 aa  288  6e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0407842  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.68 
 
 		 276 aa  287  1e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0220  putative oxidoreductase NAD-/NADP-dependent  54.65 
 
 		 277 aa  287  1e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.21 
 
 		 277 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.191089 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4006  short chain dehydrogenase  54.17 
 
 		 277 aa  281  9e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.9 
 
 		 286 aa  276  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3850  short chain dehydrogenase  54.02 
 
 		 277 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1005  short chain dehydrogenase  52.4 
 
 		 284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3557  short chain dehydrogenase  53.23 
 
 		 277 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18665  normal  0.726998 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.45 
 
 		 271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.566355  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1977  short chain dehydrogenase  52.81 
 
 		 280 aa  272  5.000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1902  short chain dehydrogenase  52.81 
 
 		 280 aa  272  5.000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.18 
 
 		 281 aa  268  1e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1219  peptidoglycan-binding LysM  50.37 
 
 		 280 aa  268  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.370987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3029  short chain dehydrogenase  52.24 
 
 		 277 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.430063  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.45 
 
 		 275 aa  265  7e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2528  short chain dehydrogenase  53.23 
 
 		 277 aa  257  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.589688 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  46.64 
 
 		 283 aa  249  5e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  46.27 
 
 		 283 aa  247  1e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.72 
 
 		 272 aa  244  8e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3006  short chain dehydrogenase  47.76 
 
 		 258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.662258  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1156  short chain dehydrogenase  47.01 
 
 		 258 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565879  hitchhiker  0.0000930327 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1053  short chain dehydrogenase  47.76 
 
 		 258 aa  231  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1121  short chain dehydrogenase  46.24 
 
 		 256 aa  225  6e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0921359  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1270  short chain dehydrogenase  45.32 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3022  short chain dehydrogenase  45.32 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.515629  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3160  short chain dehydrogenase  45.32 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140307  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3194  short chain dehydrogenase  46.24 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234456  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0967  short chain dehydrogenase  44.74 
 
 		 256 aa  212  7e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0559  short chain dehydrogenase  42.48 
 
 		 256 aa  208  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0572  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 		 269 aa  207  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0552  short chain dehydrogenase  42.48 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0597  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 		 269 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.853747 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0542  short chain dehydrogenase  42.48 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0569  short chain dehydrogenase  42.48 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0613  short chain dehydrogenase  42.48 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0554  short chain dehydrogenase  42.48 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 256 aa  206  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00444  short chain dehydrogenase  42.48 
 
 		 269 aa  206  5e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00449  hypothetical protein  42.48 
 
 		 269 aa  206  5e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0532  short chain dehydrogenase  42.48 
 
 		 269 aa  206  5e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0428  short chain dehydrogenase  42.48 
 
 		 269 aa  206  5e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3123  short chain dehydrogenase  42.48 
 
 		 256 aa  205  6e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111305 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 		 317 aa  159  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.87 
 
 		 269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 		 314 aa  149  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  36.07 
 
 		 273 aa  145  9e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152344 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.87 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 		 272 aa  143  4e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.13 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  35.48 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 		 285 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  32.96 
 
 		 277 aa  139  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.300574 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.74 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  35.08 
 
 		 275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.09 
 
 		 268 aa  135  8e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2060  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  35.48 
 
 		 277 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 273 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.09 
 
 		 268 aa  132  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.34 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0783167 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  32.51 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  33.09 
 
 		 271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0106  short chain dehydrogenase  34.22 
 
 		 284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.417565  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 		 275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  34.6 
 
 		 286 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6205  short chain dehydrogenase  34.83 
 
 		 274 aa  129  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1560  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  39.47 
 
 		 272 aa  129  7.000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  38.69 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  33.57 
 
 		 270 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  32.41 
 
 		 278 aa  127  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20980  putative short chain dehydrogenas  34.3 
 
 		 304 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  35.12 
 
 		 284 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.83 
 
 		 266 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  32.7 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10740  short chain dehydrogenase  31.99 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.896736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  32.28 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.09 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000406118  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  35.98 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918039  hitchhiker  0.00000172259 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0723  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.82 
 
 		 275 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>