More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3473 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
292 aa  601  1.0000000000000001e-171  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  52.07 
 
 
290 aa  308  9e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  52.07 
 
 
290 aa  308  9e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  51.38 
 
 
290 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  52.67 
 
 
292 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 
290 aa  300  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 
290 aa  299  4e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  50.89 
 
 
292 aa  295  9e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  48.28 
 
 
290 aa  294  1e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  48.62 
 
 
292 aa  293  3e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  48.28 
 
 
290 aa  292  5e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  50.35 
 
 
297 aa  291  8e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 
292 aa  290  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 
291 aa  286  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  49.47 
 
 
292 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  49.31 
 
 
291 aa  283  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  46.9 
 
 
289 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  47.24 
 
 
289 aa  281  8.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  46.9 
 
 
289 aa  280  3e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  47.59 
 
 
289 aa  280  3e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  47.08 
 
 
292 aa  279  4e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 
293 aa  276  4e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 
293 aa  275  9e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  48.8 
 
 
292 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  43.99 
 
 
290 aa  271  1e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  47.75 
 
 
295 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4192  dihydrodipicolinate synthase  47.75 
 
 
295 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  45.52 
 
 
296 aa  270  2e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4217  dihydrodipicolinate synthase  47.75 
 
 
295 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00266238  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  46.9 
 
 
295 aa  268  7e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  46.9 
 
 
290 aa  268  7e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  47.08 
 
 
291 aa  268  8.999999999999999e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  48.25 
 
 
297 aa  268  8.999999999999999e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  48.11 
 
 
292 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 
292 aa  268  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 
293 aa  268  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 
294 aa  268  1e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1204  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 
298 aa  267  1e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.247588  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  46.07 
 
 
291 aa  267  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  47.9 
 
 
292 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  42.47 
 
 
293 aa  266  4e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  45.52 
 
 
291 aa  266  4e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0897  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 
298 aa  265  5e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0827  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 
298 aa  265  5e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.179848  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  47.08 
 
 
292 aa  265  5e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  46.37 
 
 
326 aa  265  8.999999999999999e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 
292 aa  264  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  44.75 
 
 
300 aa  264  1e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  46.21 
 
 
290 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  46.92 
 
 
292 aa  263  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 
292 aa  263  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  48.63 
 
 
295 aa  264  2e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0354  dihydrodipicolinate synthase  49.13 
 
 
295 aa  262  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.572016  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  45.17 
 
 
293 aa  261  6.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000316742  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  47.26 
 
 
292 aa  261  8e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  42.66 
 
 
297 aa  261  8.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  44.98 
 
 
299 aa  261  8.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  46.02 
 
 
291 aa  261  1e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  44.29 
 
 
288 aa  261  1e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  46.39 
 
 
292 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  43.54 
 
 
294 aa  259  3e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  43.86 
 
 
297 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1738  dihydrodipicolinate synthase  46.5 
 
 
292 aa  258  6e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  43 
 
 
293 aa  258  8e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 
293 aa  258  9e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  47.48 
 
 
286 aa  256  2e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2234  dihydrodipicolinate synthase  47.24 
 
 
290 aa  256  3e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0583  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 
298 aa  256  4e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  45.17 
 
 
292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3191  dihydrodipicolinate synthase  46.53 
 
 
297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0102406  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2262  dihydrodipicolinate synthase  46.9 
 
 
290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  45.73 
 
 
291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  47.37 
 
 
294 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2974  dihydrodipicolinate synthase  48.19 
 
 
292 aa  253  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.484069 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4694  dihydrodipicolinate synthase  44.98 
 
 
296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 
292 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 
292 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 
292 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 
292 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 
292 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  43.45 
 
 
294 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  45.92 
 
 
295 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  45.92 
 
 
295 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  46.08 
 
 
293 aa  252  6e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  45.42 
 
 
294 aa  252  6e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  46.67 
 
 
292 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  45.92 
 
 
295 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  45.73 
 
 
291 aa  251  1e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0626  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 
298 aa  251  1e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  42.07 
 
 
300 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1992  dihydrodipicolinate synthase  48.08 
 
 
291 aa  250  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.122144  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2358  dihydrodipicolinate synthase  48.08 
 
 
291 aa  250  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592923  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  43.06 
 
 
300 aa  250  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 
292 aa  250  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  43.49 
 
 
291 aa  249  3e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  44.69 
 
 
294 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  43.25 
 
 
319 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  45.67 
 
 
296 aa  249  4e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  45.77 
 
 
287 aa  249  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0784  dihydrodipicolinate synthase  46.5 
 
 
297 aa  248  7e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>