More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3232 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 285 aa  583  1e-166  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  41.37 
 
 		 281 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  41.01 
 
 		 281 aa  208  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  39.15 
 
 		 269 aa  206  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  42.09 
 
 		 310 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  39.93 
 
 		 289 aa  203  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  39.93 
 
 		 289 aa  203  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  42.18 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  40.82 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  41.73 
 
 		 280 aa  198  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  42.35 
 
 		 280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  39.71 
 
 		 274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  39.21 
 
 		 280 aa  189  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2614  thioredoxin family protein  38.04 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  38.16 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  35.96 
 
 		 324 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  36.92 
 
 		 277 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  38.35 
 
 		 282 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  38.49 
 
 		 282 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  35.21 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  35.21 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  37.81 
 
 		 282 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  38.03 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  39.21 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  39.21 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  39.21 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  35.66 
 
 		 302 aa  176  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  34.97 
 
 		 287 aa  176  3e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  35.74 
 
 		 324 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  36.96 
 
 		 282 aa  175  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  36.11 
 
 		 334 aa  173  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  38.87 
 
 		 315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  37.77 
 
 		 282 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  37.98 
 
 		 286 aa  172  5.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  39.57 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  39.57 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  36.46 
 
 		 324 aa  170  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  37.15 
 
 		 320 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  39.21 
 
 		 918 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  34.98 
 
 		 330 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  35.43 
 
 		 302 aa  169  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  34.97 
 
 		 302 aa  169  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  36.71 
 
 		 304 aa  168  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  35.76 
 
 		 329 aa  167  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  38.85 
 
 		 282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  34.11 
 
 		 302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  35.21 
 
 		 317 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  36.49 
 
 		 312 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0294  putative thioredoxin protein  35.03 
 
 		 314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  0.0369237 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  34.26 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  36.23 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  34.86 
 
 		 326 aa  163  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  33.77 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  36.52 
 
 		 282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  32.52 
 
 		 287 aa  162  7e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  36.07 
 
 		 297 aa  162  7e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  36.59 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  35.29 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  36.49 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  34.15 
 
 		 299 aa  159  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  31.13 
 
 		 326 aa  159  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  36.36 
 
 		 306 aa  158  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  36.24 
 
 		 302 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  34.63 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  35.89 
 
 		 286 aa  158  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  36.49 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  32.87 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  33.22 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  36.15 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  36.33 
 
 		 300 aa  155  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  35.76 
 
 		 291 aa  155  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1093  thioredoxin  31.41 
 
 		 268 aa  155  6e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0251638  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  37.11 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  34.92 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  32.16 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  34.65 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  33.9 
 
 		 289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  32.13 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  34.27 
 
 		 290 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0979  thioredoxin domain-containing protein  34.98 
 
 		 263 aa  153  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.248497  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1199  thioredoxin  31.91 
 
 		 268 aa  152  5e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  34.45 
 
 		 290 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  32.4 
 
 		 290 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  33.57 
 
 		 290 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0364  thioredoxin domain-containing protein  33.01 
 
 		 312 aa  149  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000110184 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1467  thioredoxin  30.94 
 
 		 268 aa  148  8e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  33.11 
 
 		 290 aa  148  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  34.55 
 
 		 318 aa  148  9e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0886  putative thioredoxin protein  31.47 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  32.89 
 
 		 290 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  32.87 
 
 		 290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  33.45 
 
 		 338 aa  145  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5094  thioredoxin  30.72 
 
 		 306 aa  145  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.443129  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  37.42 
 
 		 310 aa  145  9e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2864  thioredoxin domain-containing protein  33.09 
 
 		 272 aa  145  9e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.499317  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  34.15 
 
 		 304 aa  145  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2127  thioredoxin domain-containing protein  34.45 
 
 		 311 aa  145  9e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  30.49 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  34.3 
 
 		 235 aa  143  3e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  32.17 
 
 		 303 aa  143  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>