More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3226 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3226  Hpt sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1251 aa  2556    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796968  normal  0.806997 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  31.78 
 
 
1574 aa  605  1.0000000000000001e-171  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.41 
 
 
1611 aa  396  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.9 
 
 
1768 aa  391  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  33.29 
 
 
1763 aa  389  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 
1765 aa  382  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.48 
 
 
1767 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 
1771 aa  378  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.29 
 
 
1767 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.28 
 
 
1331 aa  375  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.29 
 
 
1767 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.42 
 
 
1245 aa  372  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.97 
 
 
1765 aa  369  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 
1165 aa  370  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.24 
 
 
1193 aa  365  2e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 
1622 aa  364  5.0000000000000005e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0288  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.08 
 
 
1141 aa  360  8e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.42 
 
 
1303 aa  357  5.999999999999999e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 
1284 aa  357  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.6 
 
 
1245 aa  355  2e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 
1310 aa  356  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.49 
 
 
920 aa  355  2.9999999999999997e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 
1340 aa  353  8e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.92 
 
 
1240 aa  353  8e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  33.38 
 
 
1683 aa  352  3e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  33.09 
 
 
2035 aa  347  8e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.11 
 
 
1582 aa  346  2e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 
1128 aa  342  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.47 
 
 
1009 aa  342  4e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.38 
 
 
1326 aa  341  5.9999999999999996e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 
1166 aa  340  9.999999999999999e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.72 
 
 
2654 aa  335  3e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.09 
 
 
1788 aa  332  4e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  33.09 
 
 
1214 aa  330  9e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.19 
 
 
1033 aa  329  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 
1333 aa  330  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.75 
 
 
977 aa  325  3e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3344  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.37 
 
 
1390 aa  324  6e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.49 
 
 
1442 aa  322  3.9999999999999996e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2891  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  36.74 
 
 
858 aa  321  5e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.432629 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 
917 aa  321  6e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.22 
 
 
957 aa  320  7.999999999999999e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 
917 aa  320  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3028  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.7 
 
 
1426 aa  320  1e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.514624  normal  0.437775 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.3 
 
 
1266 aa  317  6e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 
917 aa  317  7e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.1 
 
 
929 aa  317  8e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  37.66 
 
 
1177 aa  316  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.45 
 
 
1363 aa  315  2.9999999999999996e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.68 
 
 
1240 aa  315  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 
1316 aa  315  3.9999999999999997e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.65 
 
 
919 aa  315  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10770  putative sensor/response regulator hybrid  33.38 
 
 
1417 aa  315  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.903284 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  38.18 
 
 
905 aa  314  4.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.19 
 
 
1118 aa  314  6.999999999999999e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.24 
 
 
1202 aa  314  7.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  34.59 
 
 
1287 aa  312  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.98 
 
 
981 aa  312  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  36.7 
 
 
917 aa  311  5e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.04 
 
 
705 aa  311  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  35.39 
 
 
925 aa  311  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.03 
 
 
916 aa  311  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.53 
 
 
1603 aa  311  6.999999999999999e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.06 
 
 
1560 aa  311  6.999999999999999e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  37.55 
 
 
917 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00899  sensory box histidine kinase/response regulator  37.15 
 
 
1070 aa  310  1.0000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 
1398 aa  309  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3703  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.21 
 
 
1021 aa  309  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  35.63 
 
 
925 aa  308  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.09 
 
 
816 aa  308  3e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.14 
 
 
833 aa  308  5.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3174  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 
1087 aa  307  9.000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134389 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 
1040 aa  307  9.000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4002  sensory transduction histidine kinase  32.48 
 
 
1689 aa  307  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0482  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 
1681 aa  307  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.24 
 
 
937 aa  307  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 
835 aa  306  2.0000000000000002e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.21 
 
 
937 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  35.8 
 
 
852 aa  305  4.0000000000000003e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  33.24 
 
 
1135 aa  303  1e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0981  putative sensor/response regulator hybrid  32.94 
 
 
1418 aa  303  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195382  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  36.26 
 
 
932 aa  303  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0416  histidine kinase  34.02 
 
 
896 aa  302  3e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3548  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 
1681 aa  302  3e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0425  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.82 
 
 
893 aa  302  3e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.5 
 
 
922 aa  301  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03340  protein-histidine kinase, putative  35.31 
 
 
1390 aa  301  5e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.205996  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01579  Response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like protein  35.17 
 
 
891 aa  301  6e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.09 
 
 
818 aa  300  8e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1508  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.88 
 
 
1303 aa  300  8e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0136  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 
912 aa  300  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4445  response regulator/sensor histidine kinase  29.07 
 
 
1141 aa  300  1e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0588  ATP-binding region ATPase domain protein  33.52 
 
 
1068 aa  300  1e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04479  Histidine kinase J7 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ24]  35.71 
 
 
1297 aa  300  2e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930158  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3459  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  38.92 
 
 
1055 aa  299  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.82 
 
 
1659 aa  298  3e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 
758 aa  298  3e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  37.27 
 
 
1407 aa  298  5e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 
818 aa  297  9e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.76 
 
 
929 aa  296  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>