290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3213 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  100 
 
 
133 aa  267  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  40.52 
 
 
111 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  39.37 
 
 
143 aa  94.4  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  39.83 
 
 
126 aa  91.7  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  43.18 
 
 
144 aa  90.5  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 
123 aa  88.2  3e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  39.42 
 
 
94 aa  88.2  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2891  preprotein translocase subunit YajC  47.13 
 
 
110 aa  87.4  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  hitchhiker  0.000439753 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  45.45 
 
 
110 aa  86.7  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1757  preprotein translocase subunit YajC  44.83 
 
 
110 aa  87  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000115206  hitchhiker  0.00353276 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  42.24 
 
 
110 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
110 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
110 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  40.77 
 
 
118 aa  84  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  39.69 
 
 
133 aa  83.6  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  35.88 
 
 
168 aa  83.6  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  45.24 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  40.16 
 
 
113 aa  82.4  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  39.34 
 
 
111 aa  82.4  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 
125 aa  82.4  0.000000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  40.5 
 
 
113 aa  82.4  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  41.38 
 
 
111 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  41.24 
 
 
113 aa  82.4  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  38.52 
 
 
113 aa  82  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  42.37 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  42.42 
 
 
105 aa  81.3  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
104 aa  80.5  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  36.89 
 
 
110 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000416487  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  36.89 
 
 
110 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  36.89 
 
 
110 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  36.89 
 
 
110 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  44.05 
 
 
110 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  44.05 
 
 
110 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  39.83 
 
 
133 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  38.26 
 
 
109 aa  78.6  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  38.6 
 
 
93 aa  77.8  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0523  preprotein translocase, YajC subunit  42.11 
 
 
154 aa  77.4  0.00000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  48.75 
 
 
123 aa  77.4  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0271  preprotein translocase subunit YajC  40.74 
 
 
110 aa  77  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.253267  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  42.27 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
109 aa  77  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  40.4 
 
 
108 aa  77  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  40.4 
 
 
108 aa  77  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  39.62 
 
 
143 aa  77  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  37.27 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  35.71 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  36.46 
 
 
110 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3383  preprotein translocase subunit YajC  34.78 
 
 
111 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000227784  normal  0.514524 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3122  preprotein translocase subunit YajC  34.78 
 
 
111 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00795341  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  42.11 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3263  preprotein translocase subunit YajC  34.78 
 
 
111 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000145315  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0147  preprotein translocase, YajC subunit  32.77 
 
 
101 aa  74.3  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000391893  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  40.21 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  40.62 
 
 
114 aa  73.9  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  45.16 
 
 
115 aa  73.6  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2336  preprotein translocase, YajC subunit  44.12 
 
 
91 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000343241  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2733  preprotein translocase, YajC subunit  41.05 
 
 
142 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0506  preprotein translocase subunit YajC  36.71 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0445  preprotein translocase subunit YajC  36.71 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0452  preprotein translocase subunit YajC  36.71 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.654019  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0446  preprotein translocase subunit YajC  36.71 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0465  preprotein translocase subunit YajC  36.71 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0326  preprotein translocase subunit YajC  37.66 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  35.58 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  50 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  50 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4748  preprotein translocase, YajC subunit  39.56 
 
 
110 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0608539 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1930  preprotein translocase, YajC subunit  42.17 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  31.82 
 
 
108 aa  72  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  42.53 
 
 
108 aa  71.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  42.03 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  35.58 
 
 
107 aa  72  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  35.58 
 
 
107 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  43.16 
 
 
114 aa  71.6  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  35.58 
 
 
107 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1062  preprotein translocase subunit YajC  35.44 
 
 
110 aa  72  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9983  hitchhiker  0.00140347 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1448  protein translocase subunit yajC  43.94 
 
 
91 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000194286  hitchhiker  0.00984378 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  35.58 
 
 
107 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  35.58 
 
 
107 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  35.58 
 
 
107 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1436  protein translocase subunit yajC  43.94 
 
 
91 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000109142  hitchhiker  0.000636763 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00355  preprotein translocase subunit YajC  36.36 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3202  preprotein translocase, YajC subunit  36.36 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.463836  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0477  preprotein translocase subunit YajC  36.36 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0487  preprotein translocase subunit YajC  36.36 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00359  hypothetical protein  36.36 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35742  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0439  preprotein translocase subunit YajC  36.36 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1693  preprotein translocase, YajC subunit  38.14 
 
 
115 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0437  preprotein translocase subunit YajC  36.36 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3226  preprotein translocase subunit YajC  36.36 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000105955 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0876  preprotein translocase subunit YajC  33.33 
 
 
110 aa  71.2  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187628  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  39.53 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2275  preprotein translocase, YajC subunit  40.91 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300335  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2213  preprotein translocase, YajC subunit  29.09 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00866418  normal  0.209417 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1216  protein translocase subunit yajC  46.05 
 
 
112 aa  70.5  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.366662 
 
 
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NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  44.44 
 
 
93 aa  70.5  0.000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1402  preprotein translocase subunit YajC  43.28 
 
 
91 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000229037  n/a   
 
 
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NC_013512  Sdel_1622  preprotein translocase, YajC subunit  51.92 
 
 
91 aa  70.1  0.000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_003912  CJE1237  preprotein translocase subunit YajC  41.89 
 
 
90 aa  69.3  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.371648  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  34.48 
 
 
106 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
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