More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3211 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  100 
 
 		 311 aa  617  1e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  50.86 
 
 		 315 aa  289  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  47.9 
 
 		 307 aa  285  8e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  52.29 
 
 		 313 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  51.25 
 
 		 315 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  52.4 
 
 		 313 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  52.58 
 
 		 315 aa  282  6.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  50.68 
 
 		 315 aa  275  8e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  50.52 
 
 		 316 aa  271  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1330  SecF protein  50.49 
 
 		 338 aa  269  4e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0105179  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  45.81 
 
 		 315 aa  269  4e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  46.75 
 
 		 315 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2775  preprotein translocase subunit SecF  48.36 
 
 		 334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.33037 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  46.1 
 
 		 337 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  50 
 
 		 314 aa  265  5.999999999999999e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  47.44 
 
 		 304 aa  264  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  46.1 
 
 		 316 aa  265  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  47.54 
 
 		 322 aa  264  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3171  preprotein translocase subunit SecF  47.08 
 
 		 372 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.203608  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  48.65 
 
 		 313 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  48.98 
 
 		 312 aa  262  6e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  47.4 
 
 		 316 aa  262  6e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2776  preprotein translocase subunit SecF  47.06 
 
 		 369 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.686561  normal  0.719321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4405  preprotein translocase subunit SecF  46.41 
 
 		 335 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0338927  normal  0.256135 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2731  preprotein translocase subunit SecF  48.14 
 
 		 367 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.258523 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  50.32 
 
 		 315 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.05 
 
 		 844 aa  257  2e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2211  preprotein translocase subunit SecF  49.33 
 
 		 314 aa  255  7e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433949  normal  0.220964 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2879  preprotein translocase subunit SecF  46 
 
 		 315 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0152003  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.9 
 
 		 845 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2804  preprotein translocase subunit SecF  46 
 
 		 315 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00594045  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2784  preprotein translocase subunit SecF  46 
 
 		 315 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0481367  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1450  preprotein translocase subunit SecF  46.33 
 
 		 315 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1573  preprotein translocase subunit SecF  46 
 
 		 315 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00583403  hitchhiker  0.000000100837 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2190  preprotein translocase subunit SecF  46.18 
 
 		 315 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.447622  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2334  preprotein translocase subunit SecF  47.47 
 
 		 315 aa  252  7e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307818  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  44 
 
 		 315 aa  252  7e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1385  preprotein translocase subunit SecF  46 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00983524  hitchhiker  0.000000302266 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1438  preprotein translocase subunit SecF  46 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107161  hitchhiker  0.00000672809 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  44.56 
 
 		 323 aa  249  3e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2481  preprotein translocase subunit SecF  45.67 
 
 		 315 aa  249  4e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0456849  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  41.45 
 
 		 303 aa  248  8e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  42.42 
 
 		 311 aa  247  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1473  preprotein translocase subunit SecF  44.34 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13163  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  41.45 
 
 		 303 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1768  preprotein translocase subunit SecF  47.39 
 
 		 352 aa  245  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0148605  normal  0.0118701 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  41.35 
 
 		 323 aa  245  9e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2443  preprotein translocase subunit SecF  40.46 
 
 		 347 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105757  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  42.11 
 
 		 302 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  41.78 
 
 		 302 aa  242  6e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1002  protein-export membrane protein SecF  42.95 
 
 		 319 aa  241  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2426  preprotein translocase subunit SecF  40.73 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  41.95 
 
 		 302 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  42.03 
 
 		 323 aa  240  2e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1800  preprotein translocase subunit SecF  49.83 
 
 		 340 aa  240  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0690803  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2185  protein-export membrane protein SecF  43.33 
 
 		 312 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  41.81 
 
 		 307 aa  239  4e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0540  preprotein translocase subunit SecF  42.05 
 
 		 361 aa  239  4e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0258314 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2889  preprotein translocase subunit SecF  47.12 
 
 		 315 aa  239  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000629469 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  38.51 
 
 		 323 aa  239  5.999999999999999e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1759  preprotein translocase subunit SecF  46.91 
 
 		 315 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.020465  normal  0.0122623 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1819  preprotein translocase subunit SecF  41.48 
 
 		 356 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814771  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  41.5 
 
 		 322 aa  238  6.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.37 
 
 		 844 aa  238  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44.1 
 
 		 856 aa  237  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1695  preprotein translocase subunit SecF  50.68 
 
 		 320 aa  236  3e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0687  preprotein translocase subunit SecF  42.75 
 
 		 316 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0235  preprotein translocase subunit SecF  42.75 
 
 		 316 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0719  preprotein translocase subunit SecF  42.75 
 
 		 316 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  44.72 
 
 		 357 aa  235  8e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3807  preprotein translocase subunit SecF  42.38 
 
 		 316 aa  235  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3281  preprotein translocase subunit SecF  42.28 
 
 		 314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0339451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  42.29 
 
 		 323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  40.85 
 
 		 323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44.68 
 
 		 853 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0634  preprotein translocase subunit SecF  42.38 
 
 		 316 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  40.53 
 
 		 302 aa  231  9e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  40.45 
 
 		 305 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2080  preprotein translocase subunit SecF  40.94 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.348624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0609  preprotein translocase subunit SecF  42.38 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  40.45 
 
 		 305 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1275  preprotein translocase subunit SecF  41.58 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2903  preprotein translocase subunit SecF  42.29 
 
 		 323 aa  231  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1342  preprotein translocase subunit SecF  40.72 
 
 		 362 aa  230  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507667  normal  0.548062 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3331  preprotein translocase subunit SecF  41.58 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0935512  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3374  preprotein translocase subunit SecF  41.58 
 
 		 316 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3365  preprotein translocase subunit SecF  41.58 
 
 		 316 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  42.07 
 
 		 304 aa  229  4e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4342  preprotein translocase subunit SecF  43.94 
 
 		 302 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.0000000544827 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.52 
 
 		 844 aa  229  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  42.07 
 
 		 304 aa  229  4e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44.95 
 
 		 856 aa  229  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2667  preprotein translocase subunit SecF  41.37 
 
 		 316 aa  228  8e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452274  normal  0.524558 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1085  preprotein translocase subunit SecF  42.44 
 
 		 328 aa  228  9e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  42.86 
 
 		 323 aa  227  2e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2384  preprotein translocase subunit SecF  41.94 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1162  preprotein translocase subunit SecF  41.94 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.954336  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2570  preprotein translocase subunit SecF  41.94 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14650  preprotein translocase subunit SecF  41.61 
 
 		 306 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  42.86 
 
 		 323 aa  227  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>