More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3183 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3183  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 371 aa  741    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0392805  normal  0.124808 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1697  periplasmic solute binding protein  37.29 
 
 		 347 aa  265  7e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2718  periplasmic solute binding protein  36.93 
 
 		 344 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11219  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1122  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  38.57 
 
 		 334 aa  256  3e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.124728  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1027  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  38.57 
 
 		 334 aa  256  3e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4176  periplasmic solute binding protein  38.08 
 
 		 346 aa  251  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2384  periplasmic solute binding protein  39.13 
 
 		 351 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.691591  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4006  periplasmic solute binding protein  36.84 
 
 		 303 aa  243  3e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129807  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2184  ABC transporter substrate binding protein (zinc)  35.21 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2291  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0312  periplasmic solute binding protein  38.07 
 
 		 362 aa  223  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2142  high-affinity zinc transporter periplasmic component  35.09 
 
 		 340 aa  199  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000717331  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2251  high-affinity zinc transporter periplasmic component  35.71 
 
 		 340 aa  192  8e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000558415  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1704  putative high-affinity zinc uptake system protein  36.71 
 
 		 356 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0200273  normal  0.0153509 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2140  high-affinity zinc transporter periplasmic component  33.71 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000251275  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2027  high-affinity zinc transporter periplasmic component  33.71 
 
 		 318 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000130529  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0852  high-affinity zinc uptake system protein ZnuA precursor  30.35 
 
 		 297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0338292  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1827  high-affinity zinc transporter periplasmic component  33.52 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0735941  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2593  high-affinity zinc transporter periplasmic component  32.07 
 
 		 310 aa  188  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00016843  normal  0.856449 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2111  high-affinity zinc transporter periplasmic component  32.57 
 
 		 339 aa  186  8e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0209857  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0059  periplasmic solute binding protein  32.07 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1730  periplasmic solute binding protein  34.57 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1329  high-affinity zinc transporter periplasmic component  31.49 
 
 		 352 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00390701  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01828  high-affinity zinc transporter periplasmic component  31.2 
 
 		 310 aa  180  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0190601  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1783  periplasmic solute binding protein  31.2 
 
 		 328 aa  180  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000935054  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01816  hypothetical protein  31.2 
 
 		 310 aa  180  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1775  high-affinity zinc transporter periplasmic component  31.2 
 
 		 310 aa  180  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2087  high-affinity zinc transporter periplasmic component  31.2 
 
 		 310 aa  180  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000165105  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1951  high-affinity zinc transporter periplasmic component  31.2 
 
 		 310 aa  180  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00866903  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2050  high-affinity zinc transporter periplasmic component  30.9 
 
 		 314 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153419  normal  0.0811015 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2045  high-affinity zinc transporter periplasmic component  30.9 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1357  high-affinity zinc transporter periplasmic component  30.9 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00461561 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2105  high-affinity zinc transporter periplasmic component  30.9 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.060713  normal  0.639588 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1233  high-affinity zinc transporter periplasmic component  30.9 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00176582  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72550  putative adhesin  31.51 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00830  ABC transporter, periplasmic binding protein  33.7 
 
 		 297 aa  176  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6299  putative adhesin  31.51 
 
 		 307 aa  176  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3253  periplasmic solute binding protein  35.99 
 
 		 347 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0556768 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0275  periplasmic solute binding protein  30.71 
 
 		 313 aa  169  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3571  ABC zinc transporter, periplasmic binding protein ZnuA  35.26 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004106  zinc ABC transporter-binding protein ZnuA  42.77 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4140  periplasmic solute binding protein  32.56 
 
 		 326 aa  158  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.101102 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2751  periplasmic solute binding protein  44.05 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1122  periplasmic solute binding protein  39.88 
 
 		 328 aa  149  8e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1194  periplasmic solute binding protein  43.68 
 
 		 329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170646 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1712  periplasmic solute binding protein  38.41 
 
 		 369 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.333525  normal  0.532025 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0953  high-affinity zinc transporter periplasmic component  36.11 
 
 		 310 aa  142  7e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0035869  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01361  hypothetical protein  34.94 
 
 		 293 aa  138  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2426  high-affinity zinc transporter periplasmic component  36.99 
 
 		 314 aa  138  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000208109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0135  periplasmic solute binding protein  36.47 
 
 		 318 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3616  periplasmic solute binding protein  33.82 
 
 		 378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0144381 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0577  periplasmic solute binding protein  25.36 
 
 		 301 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.289421  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5108  periplasmic solute binding protein  35.29 
 
 		 302 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1667  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  36.9 
 
 		 297 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0120  periplasmic solute binding protein  35.88 
 
 		 302 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0137  periplasmic solute binding protein  35.88 
 
 		 302 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0937  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  29.59 
 
 		 293 aa  119  9.999999999999999e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.388709  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  26.32 
 
 		 310 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1256  high-affinity zinc transporter periplasmic component  30.06 
 
 		 372 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000280798  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0842  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  32.74 
 
 		 282 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.290902  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0248  periplasmic solute binding protein  32.14 
 
 		 287 aa  110  5e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  25.56 
 
 		 365 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  25.67 
 
 		 328 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.02 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  28.78 
 
 		 358 aa  106  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4495  periplasmic solute binding protein  38.71 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  32.28 
 
 		 311 aa  105  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3151  hypothetical protein  37.87 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.506548 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  30.16 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  31.79 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  24.72 
 
 		 313 aa  100  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17080  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  32.98 
 
 		 347 aa  99.4  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222095  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 344 aa  99.4  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  22.69 
 
 		 368 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0989  periplasmic solute binding protein  22.9 
 
 		 295 aa  98.6  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  26.65 
 
 		 307 aa  96.3  8e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  31.45 
 
 		 314 aa  95.9  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  29.03 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  31.43 
 
 		 312 aa  95.1  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  25.14 
 
 		 345 aa  94  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  22.4 
 
 		 323 aa  92.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  32.7 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1156  periplasmic solute binding protein  29.66 
 
 		 303 aa  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  26.69 
 
 		 300 aa  91.3  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  33.97 
 
 		 294 aa  89  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0516  periplasmic solute binding protein  21.45 
 
 		 299 aa  88.6  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  30.41 
 
 		 311 aa  88.2  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1011  periplasmic solute binding protein  27.11 
 
 		 357 aa  88.2  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.932798  normal  0.91735 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  32.1 
 
 		 292 aa  87.8  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  24.65 
 
 		 346 aa  87.4  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  30.14 
 
 		 324 aa  87.4  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  29.25 
 
 		 302 aa  87  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 331 aa  87  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36810  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  33.8 
 
 		 288 aa  86.7  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00286711  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  19.83 
 
 		 308 aa  86.3  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000303257  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  27.04 
 
 		 307 aa  86.3  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  26.47 
 
 		 307 aa  85.9  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1008  periplasmic solute binding protein  28.17 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  21.81 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  34.46 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.58 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>