29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3141 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3141  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  540  9.999999999999999e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000239033  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1958  hypothetical protein  56.37 
 
 		 264 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3437  hypothetical protein  50 
 
 		 248 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1551  Nickel transport complex, NikM subunit, transmembrane  44.12 
 
 		 273 aa  247  1e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0798681  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0648  hypothetical protein  44.32 
 
 		 274 aa  239  4e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1470  hypothetical protein  41.09 
 
 		 256 aa  175  8e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.225358  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2058  hypothetical protein  39.34 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00309016  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2061  hypothetical protein  36.16 
 
 		 337 aa  162  6e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00336712  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1345  hypothetical protein  37.14 
 
 		 283 aa  160  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000531806  unclonable  0.00000125757 
 
 
-
 
NC_004310  BR1364  putative lipoprotein  35.58 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1320  putative lipoprotein  35.58 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0540  hypothetical protein  40.15 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1189  hypothetical protein  39.36 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000903745  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3501  putative lipoprotein  35.46 
 
 		 265 aa  150  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1134  hypothetical protein  36 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3139  hypothetical protein  37.98 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2859  hypothetical protein  36.94 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2023  hypothetical protein  34.6 
 
 		 257 aa  139  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000011532  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1952  ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  32.7 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3109  hypothetical protein  33.61 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000053036  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0558  ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  33.46 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0545  ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  33.08 
 
 		 252 aa  136  4e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0755  Nickel transport complex, NikM subunit, transmembrane  32.41 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.824327 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0170  ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  32.55 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3946  ABC cobalt transporter, periplasmic binding protein CbiN  35.32 
 
 		 256 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2092  ABC cobalt transporter, periplasmic binding protein CbiN  29.93 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0064068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6168  ABC cobalt transporter periplasmic binding protein CbiN  33.49 
 
 		 256 aa  118  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.651315  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1734  hypothetical protein  29.61 
 
 		 379 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00120517  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1113  hypothetical protein  27.38 
 
 		 205 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.149736 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>