121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3140 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3140  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  100 
 
 
430 aa  840  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00188953  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1959  cobalt transport protein CbiM  60 
 
 
208 aa  222  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3436  cobalt transport protein CbiM  60.3 
 
 
203 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.790482  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2093  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  56.92 
 
 
201 aa  179  7e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00179951  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1951  cobalt transport protein CbiM  58.38 
 
 
211 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70301  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3139  cobalt transport protein CbiM  53.77 
 
 
204 aa  174  2e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3500  cobalt transport protein CbiM  52.53 
 
 
211 aa  173  6e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2022  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  50.25 
 
 
197 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  9.20884e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3138  cobalt transport protein CbiM  48.74 
 
 
208 aa  163  5e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0756  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  46.23 
 
 
204 aa  153  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.535261  normal  0.785347 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1190  cobalt transport protein CbiM  46.23 
 
 
204 aa  146  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  4.65772e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1365  cobalt transport protein CbiM  47.95 
 
 
211 aa  144  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1321  cobalt transport protein CbiM  47.95 
 
 
211 aa  144  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3207  cobalt transport protein CbiM  49.25 
 
 
205 aa  142  8e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.268984  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1346  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  41.62 
 
 
198 aa  134  4e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0137458  unclonable  1.05881e-06 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1936  cobalt transport protein CbiM  50.77 
 
 
204 aa  130  5e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3947  cobalt transport protein CbiM  49.75 
 
 
205 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1471  cobalt transport protein CbiM  47.24 
 
 
207 aa  118  2e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.699456  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1133  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.69 
 
 
198 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.540876 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0557  cobalt transport protein CbiM  39.9 
 
 
195 aa  109  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.583466  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2474  cobalt transport protein CbiM  36.32 
 
 
201 aa  104  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0543  cobalt transport protein CbiM  38.27 
 
 
193 aa  103  5e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0171  cobalt transport protein CbiM  37.56 
 
 
194 aa  102  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3435  ABC-type Co2+ transport system permease component-like protein  35.23 
 
 
190 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.700435  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2782  cobalt transport protein CbiM  37.74 
 
 
214 aa  99.4  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104857  decreased coverage  0.00186647 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2094  hypothetical protein  32.35 
 
 
186 aa  90.1  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0202879  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0757  hypothetical protein  31.65 
 
 
205 aa  87.8  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.321867  normal  0.794251 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1960  hypothetical protein  33 
 
 
210 aa  86.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1803  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.91 
 
 
352 aa  82.4  1e-14  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2131  cobalt transport protein CbiM  33.84 
 
 
197 aa  81.6  2e-14  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3499  hypothetical protein  33.15 
 
 
175 aa  77  5e-13  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.128517  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1950  hypothetical protein  35.38 
 
 
212 aa  70.9  4e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2184  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.13 
 
 
241 aa  68.9  1e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00256059 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0273  cobalt transport protein CbiM  41.58 
 
 
231 aa  67.8  3e-10  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.163023  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1472  hypothetical protein  28.5 
 
 
266 aa  67.4  4e-10  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1366  hypothetical protein  28.57 
 
 
208 aa  67.8  4e-10  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2752  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.11 
 
 
354 aa  67.4  4e-10  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0681  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.27 
 
 
333 aa  65.9  1e-09  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3948  putative CbiL protein  29.95 
 
 
197 aa  65.9  1e-09  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1322  hypothetical protein  29.25 
 
 
210 aa  65.5  2e-09  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1922  hypothetical protein  28.18 
 
 
220 aa  63.9  5e-09  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3208  putative CbiL protein  29.84 
 
 
197 aa  62.8  1e-08  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1200  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.76 
 
 
347 aa  61.2  3e-08  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.028093  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0780  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.86 
 
 
348 aa  60.8  4e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.7293e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0298  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.38 
 
 
213 aa  60.8  5e-08  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.306858  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4360  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.22 
 
 
328 aa  60.8  5e-08  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0486  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.64 
 
 
337 aa  60.5  5e-08  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1044  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.1 
 
 
246 aa  60.5  5e-08  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.116161 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0174  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.96 
 
 
326 aa  60.5  6e-08  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.801433  normal  0.632766 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1370  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.11 
 
 
232 aa  60.1  7e-08  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.711039  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0882  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.55 
 
 
421 aa  60.1  7e-08  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2762  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.05 
 
 
348 aa  59.7  1e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2567  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.23 
 
 
216 aa  58.9  2e-07  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.29234  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2769  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.46 
 
 
342 aa  58.2  3e-07  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1755  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.43 
 
 
306 aa  57.4  4e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379762  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1243  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.27 
 
 
233 aa  57.4  4e-07  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  3.23865e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0192  cobalt transport protein CbiM  35.65 
 
 
230 aa  57.4  5e-07  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0108763  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0772  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.58 
 
 
241 aa  57  6e-07  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0519153  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.58 
 
 
241 aa  56.6  7e-07  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0492  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.49 
 
 
337 aa  56.6  8e-07  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.267913  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1279  cobalamin biosynthesis protein CbiM, putative  28.51 
 
 
343 aa  55.8  1e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0499926  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1959  cobalt transport protein CbiM  27.78 
 
 
226 aa  56.2  1e-06  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1182  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.9 
 
 
331 aa  55.8  1e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00505251  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0895  hypothetical protein  26.89 
 
 
289 aa  55.5  2e-06  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169761 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2021  hypothetical protein  26.03 
 
 
232 aa  55.5  2e-06  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.58905e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1637  cobalt transport protein CbiM  28.83 
 
 
242 aa  54.7  3e-06  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000771093 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0031  cobalt transport protein CbiM  27.8 
 
 
212 aa  55.1  3e-06  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2002  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.28 
 
 
355 aa  54.3  4e-06  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.38373e-24 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2565  cobalt transport protein CbiM  35.97 
 
 
239 aa  53.9  5e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.779557  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2441  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.92 
 
 
346 aa  53.9  5e-06  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.365569  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0330  cobalt transport protein CbiM  28.04 
 
 
325 aa  53.9  6e-06  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1805  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.49 
 
 
341 aa  53.1  1e-05  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.23856e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0062  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  25.84 
 
 
213 aa  52.8  1e-05  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000311798  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1450  cobalt transport protein CbiM  34.78 
 
 
226 aa  52.4  2e-05  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.208192  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6032  membrane protein  31.33 
 
 
217 aa  52.4  2e-05  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2352  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.67 
 
 
310 aa  52  2e-05  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1767  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.93 
 
 
219 aa  52  2e-05  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.113369  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1148  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.41 
 
 
218 aa  52.4  2e-05  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00870535  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1073  hypothetical protein  25.79 
 
 
599 aa  51.2  3e-05  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2225  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.19 
 
 
359 aa  51.6  3e-05  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000325574  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0163  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.37 
 
 
310 aa  51.6  3e-05  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118647  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2134  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.86 
 
 
261 aa  51.2  3e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3004  cobalt transport protein CbiM  30.05 
 
 
321 aa  50.8  4e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1739  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.28 
 
 
204 aa  50.8  5e-05  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.749284  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1351  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.6 
 
 
233 aa  50.4  6e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.309906  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1292  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.77 
 
 
299 aa  50.4  6e-05  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.46518  normal  0.800906 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1766  cobalt transport protein CbiM  27.8 
 
 
212 aa  50.1  7e-05  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1057  cobalt transport protein CbiM  25.45 
 
 
330 aa  50.1  7e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1780  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.61 
 
 
307 aa  50.1  8e-05  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.347196  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4293  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.74 
 
 
230 aa  50.1  9e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0557  cobalamin biosynthesis protein CbiM, putative  31.22 
 
 
326 aa  49.7  9e-05  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0090  cobalt transport protein CbiM  28.32 
 
 
210 aa  49.7  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4182  cobalt transport protein CbiM  30.56 
 
 
251 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11090  cobalt transport protein CbiM  29.11 
 
 
339 aa  48.9  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  3.40042e-06  normal  0.0123253 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1927  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.91 
 
 
242 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0061  ABC-type transport system, permease component  32 
 
 
301 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.43136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0512  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.23 
 
 
343 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.21192 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2005  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.91 
 
 
343 aa  48.9  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0387041  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2621  cobalt transport protein CbiM  29.27 
 
 
214 aa  47.4  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.78373  normal  0.0472515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2063  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.59 
 
 
232 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>