More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3136 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3136  precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 
272 aa  546  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.749873 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2300  precorrin-4 C11-methyltransferase  69.57 
 
 
273 aa  330  2e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366203  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2163  precorrin-4 C11-methyltransferase  68.11 
 
 
274 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1024  precorrin-4 C11-methyltransferase  67.32 
 
 
281 aa  324  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.249462  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  66.8 
 
 
284 aa  319  3e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.25946  normal  0.0736251 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0068  precorrin-4 C11-methyltransferase  67.45 
 
 
293 aa  303  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1351  precorrin-4 C11-methyltransferase  62.5 
 
 
259 aa  301  8.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3737  precorrin-4 C11-methyltransferase  64.57 
 
 
275 aa  299  3e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1693  precorrin-4 C11-methyltransferase  62.06 
 
 
269 aa  291  5e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0438  cobalt-precorrin-4 methyltransferase  66.54 
 
 
260 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  66.54 
 
 
260 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.16 
 
 
258 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1294  precorrin-4 C11-methyltransferase  50 
 
 
248 aa  229  4e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.04031 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.39 
 
 
258 aa  228  7e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.81 
 
 
264 aa  225  7e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  48.24 
 
 
257 aa  219  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0638  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.11 
 
 
271 aa  218  7.999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0933  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.37 
 
 
260 aa  218  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452437 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3607  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.85 
 
 
261 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3541  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.23 
 
 
261 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0059  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.48 
 
 
256 aa  217  1e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0571  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.92 
 
 
272 aa  216  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1265  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.95 
 
 
267 aa  215  5e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1557  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.01 
 
 
256 aa  215  7e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.75 
 
 
251 aa  215  7e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3231  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.42 
 
 
258 aa  215  7e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00900029  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.75 
 
 
251 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.45 
 
 
248 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.81 
 
 
254 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2198  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.53 
 
 
257 aa  211  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.333099  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2205  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.53 
 
 
257 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.81 
 
 
259 aa  211  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2151  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.14 
 
 
257 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0163963  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2364  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.14 
 
 
257 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1298  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.85 
 
 
261 aa  209  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.31 
 
 
253 aa  209  3e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1272  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.31 
 
 
251 aa  209  5e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.67 
 
 
867 aa  208  7e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0614  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.09 
 
 
249 aa  207  1e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00328163  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2251  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.14 
 
 
257 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  0.353064 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.5 
 
 
251 aa  206  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.31 
 
 
610 aa  206  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.87 
 
 
253 aa  205  7e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2609  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.88 
 
 
257 aa  202  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0640  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.79 
 
 
257 aa  202  6e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.194872  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.02 
 
 
244 aa  201  7e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.43 
 
 
254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.23833  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.53 
 
 
626 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.28 
 
 
250 aa  196  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.64 
 
 
254 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0801  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.87 
 
 
266 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1014  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.44 
 
 
626 aa  192  4e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0050  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.83 
 
 
255 aa  191  8e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1011  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.24 
 
 
254 aa  190  2e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.04114  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1177  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.24 
 
 
305 aa  189  4e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.14 
 
 
598 aa  187  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0114  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.15 
 
 
262 aa  187  2e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177043  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0211  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-4 C11-methyltransferase  42.46 
 
 
614 aa  187  2e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1376  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.87 
 
 
252 aa  187  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.13 
 
 
252 aa  186  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.74 
 
 
254 aa  186  4e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.4 
 
 
254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25920  precorrin-3 methylase  43.14 
 
 
250 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297541  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2530  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.35 
 
 
250 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2352  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.35 
 
 
250 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2213  precorrin-3 methylase  42.35 
 
 
250 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0559  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.58 
 
 
262 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.96 
 
 
250 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3650  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.25 
 
 
252 aa  176  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.796321  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3384  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.91 
 
 
253 aa  175  7e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3410  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.57 
 
 
250 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.231837 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1853  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.67 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2635  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.33 
 
 
263 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.231618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2117  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.08 
 
 
241 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1972  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.08 
 
 
241 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1955  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.08 
 
 
241 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132176  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.37 
 
 
261 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3103  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.13 
 
 
248 aa  170  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1314  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.58 
 
 
268 aa  169  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144548  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1980  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.31 
 
 
287 aa  168  8e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4162  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.52 
 
 
958 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329616  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3139  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.21 
 
 
243 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103399  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1564  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.03 
 
 
242 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253118  normal  0.214845 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4589  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.61 
 
 
251 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120449  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1157  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.26 
 
 
241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917528  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1598  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.26 
 
 
241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00151458  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0901  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.26 
 
 
241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324814  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0259  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.26 
 
 
241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1375  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.55 
 
 
257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0286247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1887  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.69 
 
 
262 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0177135  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2523  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.78 
 
 
298 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0144072  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2358  precorrin-4 C11-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  39.09 
 
 
243 aa  165  8e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2357  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.35 
 
 
259 aa  165  9e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342045  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2923  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.15 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.680231  normal  0.0185874 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1651  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.44 
 
 
242 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5365  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.21 
 
 
241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.973627 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2446  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.62 
 
 
261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130726  normal  0.124304 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2394  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.85 
 
 
241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1198  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.44 
 
 
242 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1678  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.44 
 
 
242 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0635313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>