More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3062 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  100 
 
 
403 aa  836  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  8.59331e-07 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  67.77 
 
 
395 aa  579  1e-164  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  66.5 
 
 
407 aa  565  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  67.08 
 
 
407 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  66.5 
 
 
407 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  66.5 
 
 
407 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  66.25 
 
 
407 aa  564  1e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  66.25 
 
 
407 aa  561  1e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  66.25 
 
 
407 aa  564  1e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  66.83 
 
 
407 aa  564  1e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  66.25 
 
 
407 aa  564  1e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  66.83 
 
 
407 aa  563  1e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  66.83 
 
 
407 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  66.83 
 
 
407 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  66.83 
 
 
407 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  65.34 
 
 
405 aa  559  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  66.83 
 
 
407 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  66.33 
 
 
407 aa  560  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  64.27 
 
 
407 aa  555  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2264  cysteine desulfurase  65.19 
 
 
404 aa  556  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  63.77 
 
 
407 aa  554  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  63.95 
 
 
404 aa  551  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  63.95 
 
 
404 aa  551  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  63.95 
 
 
404 aa  551  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  63.95 
 
 
404 aa  551  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  63.95 
 
 
404 aa  551  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  64.34 
 
 
405 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  63.12 
 
 
422 aa  552  1e-156  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  65.09 
 
 
406 aa  554  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  63.95 
 
 
404 aa  551  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  63.95 
 
 
404 aa  551  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  63.95 
 
 
404 aa  551  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  64.34 
 
 
405 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  63.95 
 
 
404 aa  551  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  63.84 
 
 
405 aa  551  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  63.21 
 
 
404 aa  548  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  64.68 
 
 
403 aa  549  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  63.5 
 
 
407 aa  550  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  64.09 
 
 
407 aa  548  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  63.5 
 
 
421 aa  550  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  63.46 
 
 
404 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  63.46 
 
 
404 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  63.46 
 
 
404 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  63.46 
 
 
404 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  63.46 
 
 
404 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1739  cysteine desulfurase  65.19 
 
 
404 aa  547  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125789  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  64.93 
 
 
405 aa  545  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  63.21 
 
 
404 aa  547  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  63.46 
 
 
404 aa  546  1e-154  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  63.46 
 
 
404 aa  545  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  63.93 
 
 
436 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1458  cysteine desulfurase  63.21 
 
 
404 aa  545  1e-154  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1819  cysteine desulfurase  65.19 
 
 
404 aa  546  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00929317  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  62.96 
 
 
404 aa  545  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1776  cysteine desulfurase  63.46 
 
 
404 aa  545  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.743071  hitchhiker  4.39392e-05 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  62.78 
 
 
403 aa  546  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  64.18 
 
 
507 aa  547  1e-154  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  63.93 
 
 
436 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2317  cysteine desulfurase  63.46 
 
 
404 aa  545  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.459864  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2280  cysteine desulfurase  65.19 
 
 
404 aa  546  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0344556  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  62.47 
 
 
404 aa  543  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  62.47 
 
 
404 aa  541  1e-153  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2424  cysteine desulfurase  63.7 
 
 
404 aa  543  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1488  cysteine desulfurase  63.95 
 
 
404 aa  543  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.645778  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0830  cysteine desulfurase IscS  64.2 
 
 
407 aa  541  1e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.184128 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2871  cysteine desulfurase  63.46 
 
 
404 aa  543  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  3.28828e-08 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  62.47 
 
 
404 aa  542  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  62.47 
 
 
404 aa  542  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  63.93 
 
 
403 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0469  cysteine desulfurase IscS  63.84 
 
 
419 aa  541  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00221025  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0997  cysteine desulfurase  63.37 
 
 
415 aa  540  1e-152  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  62.22 
 
 
404 aa  540  1e-152  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05560  cysteine desulfhydrase, putative  61.67 
 
 
502 aa  539  1e-152  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  62.94 
 
 
417 aa  539  1e-152  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1493  cysteine desulfurase IscS  63.84 
 
 
419 aa  540  1e-152  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2149  cysteine desulfurase  65.19 
 
 
404 aa  539  1e-152  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00291634  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  63.7 
 
 
405 aa  540  1e-152  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  8.43977e-09  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1293  cysteine desulfurase  63.46 
 
 
404 aa  538  1e-152  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0405061 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0629  cysteine desulfurase  62.38 
 
 
410 aa  541  1e-152  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0717  cysteine desulfurase  62.22 
 
 
406 aa  538  1e-152  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14730  cysteine desulfurase  63.21 
 
 
404 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179473  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1487  cysteine desulfurase IscS  64.18 
 
 
406 aa  535  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000124631  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2059  cysteine desulfurase IscS  63.7 
 
 
407 aa  535  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0733618  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  62.72 
 
 
404 aa  537  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1961  cysteine desulfurase  64.69 
 
 
404 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.037165  hitchhiker  0.00267346 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2397  cysteine desulfurase  64.44 
 
 
404 aa  532  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0798953  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85588  predicted protein  62.94 
 
 
493 aa  532  1e-150  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464986  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2386  cysteine desulfurase  64.69 
 
 
404 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.40874e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2177  cysteine desulfurase IscS  62.59 
 
 
430 aa  534  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2502  cysteine desulfurase  64.69 
 
 
404 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00893038  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1238  cysteine desulfurase IscS  62.22 
 
 
407 aa  533  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.01856  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1299  cysteine desulfurase  62.96 
 
 
404 aa  531  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0382772  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1324  cysteine desulfurase IscS  62.53 
 
 
403 aa  528  1e-149  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00549463  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2178  cysteine desulfurase IscS  62.34 
 
 
405 aa  528  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000963732  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3999  cysteine desulfurase IscS  62.59 
 
 
406 aa  528  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102036  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  62.09 
 
 
405 aa  528  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  7.72731e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3511  cysteine desulfurase  63.7 
 
 
404 aa  531  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309898  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  62.84 
 
 
405 aa  530  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  61.88 
 
 
403 aa  525  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1638  cysteine desulfurase IscS  62.84 
 
 
406 aa  525  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>