143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2963 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2963  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 293 aa  599  1e-170  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3046  radical SAM family protein  51.37 
 
 		 293 aa  286  4e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0201  radical SAM domain-containing protein  39.25 
 
 		 293 aa  240  2e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3668  radical SAM domain-containing protein  45.05 
 
 		 293 aa  222  6e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0423  radical SAM family protein  42.76 
 
 		 293 aa  215  8e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3059  radical SAM domain-containing protein  44.17 
 
 		 293 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1151  Radical SAM domain protein  40.73 
 
 		 291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.388903 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2654  Radical SAM domain protein  40.34 
 
 		 291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000344406  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1640  radical SAM domain-containing protein  43.54 
 
 		 297 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.387627  normal  0.955096 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3790  Radical SAM domain protein  43.32 
 
 		 338 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0456  radical SAM domain-containing protein  42.23 
 
 		 309 aa  209  4e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1475  radical SAM domain-containing protein  42.23 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0640288  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1360  radical SAM domain-containing protein  41.33 
 
 		 300 aa  206  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.397431  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2529  radical SAM domain-containing protein  43.96 
 
 		 296 aa  202  6e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.496911  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4516  radical SAM domain-containing protein  40.67 
 
 		 293 aa  202  6e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3076  radical SAM family protein  38.59 
 
 		 292 aa  201  8e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0110421  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1884  radical SAM family protein  40.68 
 
 		 296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2205  hypothetical protein  41.84 
 
 		 298 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0530  radical SAM domain-containing protein  41 
 
 		 295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3501  radical SAM domain-containing protein  41 
 
 		 295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3395  radical SAM domain-containing protein  40.68 
 
 		 292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00495336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25810  hypothetical protein  41.5 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.723648  normal  0.254703 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3100  Radical SAM domain protein  41.58 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.358776  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1162  Radical SAM domain protein  42.29 
 
 		 295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0199468 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2265  Radical SAM domain protein  40.57 
 
 		 293 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2989  radical SAM domain-containing protein  41.22 
 
 		 293 aa  195  6e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000144866  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3965  radical SAM domain-containing protein  40.92 
 
 		 295 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0486  radical SAM domain-containing protein  40.92 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0407  hypothetical protein  40.07 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0528  hypothetical protein  40.86 
 
 		 295 aa  193  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0919  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  37.97 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0453  radical SAM domain-containing protein  38 
 
 		 294 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2142  Radical SAM domain protein  39.8 
 
 		 291 aa  188  8e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.608518  decreased coverage  0.00173745 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0717  radical SAM domain-containing protein  35.74 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0365  radical SAM domain-containing protein  36.55 
 
 		 289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00570597  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0657  Radical SAM domain protein  39.23 
 
 		 292 aa  170  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3617  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  36.68 
 
 		 293 aa  169  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0173  radical SAM domain-containing protein  34.47 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000741532  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0443  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  32.52 
 
 		 291 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3411  Elongator protein 3/MiaB/NifB  36.82 
 
 		 257 aa  152  8e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1410  Radical SAM domain protein  29.73 
 
 		 377 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2870  Radical SAM domain protein  30.07 
 
 		 373 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.578576 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02260  Fe-S oxidoreductase  30.22 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13790  Fe-S oxidoreductase  30.58 
 
 		 297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2726  Radical SAM domain protein  26.61 
 
 		 399 aa  122  9e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26860  Fe-S oxidoreductase  25.99 
 
 		 291 aa  119  6e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2061  radical SAM domain-containing protein  28.94 
 
 		 294 aa  119  9e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.952171  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0066  Radical SAM domain protein  27.8 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.628263  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1505  radical SAM domain-containing protein  27.64 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00044584 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3579  radical SAM domain-containing protein  35.96 
 
 		 409 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.630491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3023  radical SAM domain-containing protein  29.39 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1372  radical SAM domain-containing protein  33.66 
 
 		 402 aa  109  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0622  radical SAM domain-containing protein  24.13 
 
 		 311 aa  109  6e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.044899  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1744  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 380 aa  108  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743194  decreased coverage  0.000183859 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24530  Fe-S oxidoreductase  29.22 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04170  Fe-S oxidoreductase  29.22 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.63469 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25530  Fe-S oxidoreductase  26.46 
 
 		 308 aa  98.2  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.261112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1019  Radical SAM domain protein  27.41 
 
 		 390 aa  94  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25380  Fe-S oxidoreductase  25.79 
 
 		 300 aa  88.2  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.76381  normal  0.564969 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00660  Fe-S oxidoreductase  28.18 
 
 		 321 aa  87  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2640  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.65 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase putative  25.41 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16730  Fe-S oxidoreductase  25.19 
 
 		 332 aa  75.9  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3838  radical SAM domain-containing protein  36.24 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0353  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  29.38 
 
 		 485 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.90319 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3569  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  30.54 
 
 		 478 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.663184 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2393  radical SAM domain-containing protein  28.03 
 
 		 490 aa  56.2  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.386797  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0852  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.38 
 
 		 436 aa  55.8  0.0000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17330  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  33.33 
 
 		 389 aa  55.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395345  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1836  radical SAM domain-containing protein  30.41 
 
 		 474 aa  55.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0100  radical SAM domain-containing protein  27.51 
 
 		 705 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0253265  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3390  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  28.48 
 
 		 485 aa  53.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0581  coproporphyrinogen III oxidase  25.7 
 
 		 469 aa  53.5  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.496412  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4964  radical SAM family protein  27.43 
 
 		 476 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.576294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0800  radical SAM domain-containing protein  20.85 
 
 		 455 aa  52.4  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.422662  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2319  radical SAM family Fe-S protein  24.24 
 
 		 501 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3233  radical SAM domain-containing protein  25.57 
 
 		 531 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 		 1250 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  23.6 
 
 		 471 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2215  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.33 
 
 		 412 aa  49.7  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.892548  normal  0.0148235 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2199  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.59 
 
 		 448 aa  50.1  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.186673  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3496  hypothetical protein  51.35 
 
 		 38 aa  49.7  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.871156  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0076  coproporphyrinogen III oxidase  24.1 
 
 		 445 aa  49.3  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3730  coproporphyrinogen III oxidase  21.94 
 
 		 445 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.421344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3801  coproporphyrinogen III oxidase  21.94 
 
 		 445 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2929  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 497 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3127  radical SAM domain-containing protein  26.45 
 
 		 475 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3926  coproporphyrinogen III oxidase  21.94 
 
 		 445 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0219  coproporphyrinogen III oxidase  23.71 
 
 		 445 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.809943  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0228  radical SAM domain-containing protein  20.37 
 
 		 441 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0661  radical SAM domain-containing protein  23.61 
 
 		 438 aa  48.5  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.692136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4239  coproporphyrinogen III oxidase  23.71 
 
 		 445 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4520  coproporphyrinogen III oxidase  23.2 
 
 		 445 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0221  coproporphyrinogen III oxidase  23.71 
 
 		 445 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0517942 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3506  coproporphyrinogen III oxidase  23.2 
 
 		 445 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4118  coproporphyrinogen III oxidase  23.71 
 
 		 445 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4414  coproporphyrinogen III oxidase  23.71 
 
 		 445 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  28.42 
 
 		 388 aa  47.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0595  radical SAM domain-containing protein  20.37 
 
 		 437 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.063528  normal  0.361831 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  23.56 
 
 		 435 aa  47  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>