11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2790 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2790  periplasmic protein  100 
 
 		 413 aa  835    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0086  periplasmic protein  28.81 
 
 		 435 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0088  hypothetical protein  25.64 
 
 		 400 aa  97.8  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.259915  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0182  hypothetical protein  25 
 
 		 385 aa  97.4  4e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0128  hypothetical protein  25.64 
 
 		 400 aa  95.9  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1523  hypothetical protein  23.1 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1237  hypothetical protein  23.6 
 
 		 484 aa  71.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.78414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0418  hypothetical protein  24.12 
 
 		 551 aa  68.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051405 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3849  hypothetical protein  25.13 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0636697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5699  hypothetical protein  25.49 
 
 		 447 aa  57  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.674769  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0797  hypothetical protein  32.26 
 
 		 131 aa  45.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000503074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>