104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2735 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1336  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 104 aa  214  4e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2564  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 104 aa  214  4e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2735  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 104 aa  214  4e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2419  transcriptional regulator, XRE family  55.45 
 
 		 104 aa  121  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3276  hypothetical protein  60.78 
 
 		 105 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0117  putative DNA-binding protein  58 
 
 		 105 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197061  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1829  transcriptional regulator, XRE family  52.48 
 
 		 103 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0593  transcriptional regulator, XRE family  52 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0244812  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2243  transcriptional regulator, XRE family  50.98 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0601  transcriptional regulator, XRE family  51 
 
 		 108 aa  103  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0834  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 107 aa  97.4  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.259279 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0315  XRE family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 117 aa  96.3  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0773865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2787  transcriptional regulator, XRE family  56.99 
 
 		 99 aa  95.5  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1724  transcriptional regulator, XRE family  48.98 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0084  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 109 aa  94.4  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0870  transcriptional regulator, XRE family  47 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0723  transcriptional regulator, XRE family  47.52 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000669172 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0827  XRE family transcriptional regulator  58.75 
 
 		 116 aa  88.2  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.551431  normal  0.496549 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3280  XRE family transcriptional regulator  51.25 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.843876 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0928  DNA polymerase III delta prime subunit  42.86 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  52.78 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5139  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 95 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4157  XRE family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 95 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.555179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0807  helix-turn-helix domain-containing protein  51.35 
 
 		 94 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0311  transcriptional regulator  45.95 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1879  DNA-binding protein  45.95 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0658  XRE family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  42.68 
 
 		 93 aa  67  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3411  XRE family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5447  XRE family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3174  XRE family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00826056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0763  XRE family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2042  putative cytochrome c  42.22 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3859  transcriptional regulator, XRE family  45.21 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0364  XRE family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000740846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  37.5 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1031  transcriptional regulator, XRE family  38.04 
 
 		 89 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000313321  normal  0.707924 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1462  XRE family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2125  transcriptional regulator, XRE family  37.8 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0647  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.459505 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  40.26 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2529  transcriptional regulator, XRE family  38.2 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000784971  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  41.46 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  41.46 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3540  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0282  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1932  transcriptional regulator, XRE family  34.57 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0590  transcriptional regulator, XRE family  37.66 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4023  transcriptional regulator, XRE family  35.06 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0381  XRE family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 91 aa  50.8  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1909  XRE family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4582  transcriptional regulator, XRE family  31.71 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.752323 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1817  DNA-binding protein  33.65 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.252724  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2220  DNA-binding protein  33.65 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0402427  normal  0.0285701 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1927  XRE family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0099  DNA-binding protein  38.27 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0039  DNA-binding protein  37.04 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.514774  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0744  DNA-binding protein  40 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1138  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 90 aa  46.2  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.4972  normal  0.249316 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2805  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2226  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.782341  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11984  transcriptional regulator  32.93 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8282  putative transcriptional regulator, XRE family  32.61 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  46.3 
 
 		 263 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  28.75 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3281  transcriptional regulator, XRE family  45.24 
 
 		 173 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.871806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5820  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.790408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  32.93 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 374 aa  43.5  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4900  hypothetical protein  35.62 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.978216  normal  0.040659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6629  putative Phage-related transcriptional regulator  36.78 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0010  DNA-binding protein  40 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.235299  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2818  transcriptional regulator, XRE family  45.24 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  31.71 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2425  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2429  helix-turn-helix domain-containing protein  45.61 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0017  transcriptional regulator, XRE family  36.99 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2922  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.562834  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0726  Cro/CI family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 264 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0718  Cro/CI family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 264 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1887  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  42.59 
 
 		 218 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2319  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4345  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0197394  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3853  XRE family molybdate metabolism transcriptional regulator  36.36 
 
 		 377 aa  41.6  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.593506  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  46.15 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 176 aa  41.6  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1922  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189064  normal  0.0105553 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0874  putative transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  43.4 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4042  molybdate metabolism transcriptional regulator  34.55 
 
 		 376 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805509  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1386  XRE family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1888  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0914  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 108 aa  40.4  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0455  helix-turn-helix domain-containing protein  36.62 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.846585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  38.18 
 
 		 210 aa  40.4  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2256  Cro/CI family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.033693 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>