191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2717 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  53.16 
 
 
1118 aa  1148    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  38.89 
 
 
1082 aa  673    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  37.85 
 
 
1172 aa  674    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  79.44 
 
 
1116 aa  1843    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  100 
 
 
1126 aa  2324    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  34.75 
 
 
1153 aa  552  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  33.57 
 
 
1121 aa  526  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  34.35 
 
 
1151 aa  505  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  33.62 
 
 
1139 aa  504  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  33.5 
 
 
1198 aa  494  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  34.57 
 
 
1163 aa  491  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  33.36 
 
 
1143 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  33.36 
 
 
1143 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  31.76 
 
 
1228 aa  473  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  32.79 
 
 
1215 aa  468  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  33.22 
 
 
1143 aa  465  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  32.3 
 
 
1250 aa  449  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  31 
 
 
1196 aa  412  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1529  hypothetical protein  31.66 
 
 
1175 aa  378  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0907559  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  34.48 
 
 
1215 aa  268  5.999999999999999e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  34.88 
 
 
1280 aa  262  3e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  39.2 
 
 
1270 aa  240  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  37.11 
 
 
1324 aa  229  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  35.4 
 
 
1247 aa  222  3e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  32.2 
 
 
1350 aa  191  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4059  hypothetical protein  30.46 
 
 
522 aa  186  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0336  hypothetical protein  26.27 
 
 
487 aa  137  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2051  hypothetical protein  27.94 
 
 
480 aa  136  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3349  hypothetical protein  25.69 
 
 
512 aa  131  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4865  hypothetical protein  28.21 
 
 
494 aa  131  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120137  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0186  hypothetical protein  25.81 
 
 
512 aa  129  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  26.98 
 
 
934 aa  125  4e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3226  nuclease (RecB family)-like protein  27.31 
 
 
493 aa  125  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.492235  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2870  hypothetical protein  27.31 
 
 
493 aa  125  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  27.82 
 
 
986 aa  120  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1720  hypothetical protein  26.91 
 
 
1259 aa  119  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  26.67 
 
 
902 aa  116  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2410  RecB family nuclease, putative  24.65 
 
 
486 aa  117  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  26.27 
 
 
902 aa  116  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  26.28 
 
 
1271 aa  106  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  26.84 
 
 
606 aa  106  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  26.75 
 
 
752 aa  104  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  24.58 
 
 
486 aa  102  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  24.32 
 
 
1275 aa  101  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  26.06 
 
 
797 aa  99  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  24.59 
 
 
1255 aa  97.4  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  31.09 
 
 
629 aa  95.5  5e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24981  RecB family nuclease  29.43 
 
 
535 aa  95.1  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  25.68 
 
 
1048 aa  93.6  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  25.55 
 
 
901 aa  93.6  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  23.43 
 
 
611 aa  93.6  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  26.84 
 
 
650 aa  92.8  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  26.84 
 
 
650 aa  92  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0719  RecB family-like nuclease  23.31 
 
 
495 aa  90.9  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253334  hitchhiker  0.0000000430551 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0524  RecB family-like nuclease  26.62 
 
 
396 aa  90.9  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  27.22 
 
 
754 aa  89.7  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  25.58 
 
 
622 aa  90.1  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  29.51 
 
 
1018 aa  89.7  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  25.84 
 
 
1090 aa  88.6  6e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  29.84 
 
 
632 aa  88.6  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  25.35 
 
 
622 aa  88.2  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  25.4 
 
 
655 aa  85.9  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  28.83 
 
 
619 aa  85.1  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  23.22 
 
 
585 aa  84.7  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  24.6 
 
 
952 aa  84.3  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  27.48 
 
 
636 aa  84.3  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  28.47 
 
 
609 aa  84  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  25.06 
 
 
1038 aa  83.6  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0518  RecB family-like nuclease  25.61 
 
 
390 aa  82.8  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.13317  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2796  transcription factor jumonji, jmjC  47.13 
 
 
193 aa  82.4  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132584  hitchhiker  0.00000604093 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  23.97 
 
 
1408 aa  82  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0570  superfamily I DNA/RNA helicase  25 
 
 
1457 aa  82  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.010636 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  24.03 
 
 
1097 aa  81.6  0.00000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  23.44 
 
 
1077 aa  81.6  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  25.65 
 
 
914 aa  81.3  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  26.36 
 
 
636 aa  80.9  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  22.26 
 
 
1099 aa  80.1  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0258  hypothetical protein  25.64 
 
 
502 aa  79  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.715645  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  27.7 
 
 
925 aa  78.6  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  27.7 
 
 
1189 aa  78.6  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3303  hypothetical protein  33.33 
 
 
222 aa  78.6  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.844138 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  24.65 
 
 
635 aa  78.6  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  27.49 
 
 
716 aa  78.2  0.0000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  30.68 
 
 
686 aa  77.8  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0229  hypothetical protein  28.33 
 
 
491 aa  77.8  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  28.52 
 
 
795 aa  77  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  29.08 
 
 
651 aa  76.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2280  AAA ATPase  25.83 
 
 
1403 aa  75.9  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00184905  decreased coverage  0.00000493751 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  24.41 
 
 
633 aa  75.5  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  24.75 
 
 
633 aa  75.1  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  27.34 
 
 
928 aa  73.9  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  26.3 
 
 
521 aa  74.7  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  25.13 
 
 
479 aa  72.8  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03571  RecB family nuclease  22.38 
 
 
483 aa  72.8  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.551533  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  25.95 
 
 
643 aa  71.6  0.00000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0279  putative nuclease (RecB family)  20.55 
 
 
472 aa  71.6  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.762829  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03041  RecB family nuclease  20.52 
 
 
490 aa  71.6  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0542901  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  26.21 
 
 
1999 aa  70.5  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  27.24 
 
 
464 aa  70.5  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  28.79 
 
 
553 aa  70.1  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>