279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2678 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 371 aa  748    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0948  permease YjgP/YjgQ  29.68 
 
 		 368 aa  137  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.046524  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  25.34 
 
 		 358 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  27.3 
 
 		 359 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  28.8 
 
 		 364 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  28.8 
 
 		 364 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  27.88 
 
 		 364 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  25.47 
 
 		 360 aa  123  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  25.2 
 
 		 365 aa  123  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  25.47 
 
 		 360 aa  123  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  26.7 
 
 		 358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  25.61 
 
 		 353 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  25.96 
 
 		 359 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  22.95 
 
 		 356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  25.97 
 
 		 360 aa  116  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  27.44 
 
 		 792 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  27.45 
 
 		 359 aa  114  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  24.8 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  25.68 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5099  permease YjgP/YjgQ family protein  27.64 
 
 		 362 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.624296  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2312  permease YjgP/YjgQ  25.81 
 
 		 362 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  25.96 
 
 		 353 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  26.16 
 
 		 356 aa  109  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1020  permease YjgP/YjgQ family protein  25.96 
 
 		 353 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362766  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2341  permease YjgP/YjgQ  25.74 
 
 		 365 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231587  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  22.34 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  25.89 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4235  permease YjgP/YjgQ family protein  25.68 
 
 		 353 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0988  permease YjgP/YjgQ family protein  25.68 
 
 		 353 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1813  permease YjgP/YjgQ  25 
 
 		 364 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.578456  normal  0.607435 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3472  permease YjgP/YjgQ family protein  24.46 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5837  permease YjgP/YjgQ family protein  28.18 
 
 		 362 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3339  permease YjgP/YjgQ family protein  28.34 
 
 		 363 aa  107  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465141 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  24.66 
 
 		 360 aa  107  5e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3830  putative permease  24.93 
 
 		 365 aa  106  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.105268 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0991  permease YjgP/YjgQ  28.4 
 
 		 353 aa  106  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  26.81 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  27.03 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  28.01 
 
 		 350 aa  105  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0507  YjgP/YjgQ permease  26.82 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  23.41 
 
 		 355 aa  104  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  28.53 
 
 		 1040 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0582  hypothetical protein  26.8 
 
 		 356 aa  103  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.878195  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  23.94 
 
 		 360 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1189  permease YjgP/YjgQ family protein  24.66 
 
 		 365 aa  102  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216183  normal  0.433432 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3525  permease YjgP/YjgQ family protein  28.08 
 
 		 354 aa  102  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.246904 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2967  permease YjgP/YjgQ  25.07 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0631438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1542  hypothetical protein  25.6 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2177  permease YjgP/YjgQ  27.49 
 
 		 366 aa  100  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  23.6 
 
 		 359 aa  100  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1093  permease YjgP/YjgQ  26.78 
 
 		 353 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1678  permease YjgP/YjgQ  24.13 
 
 		 365 aa  100  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.626554 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2479  permease YjgP/YjgQ  24.46 
 
 		 361 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0963  permease YjgP/YjgQ family protein  26.03 
 
 		 353 aa  99.8  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0651  permease YjgP/YjgQ family protein  26.15 
 
 		 362 aa  99.8  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2837  permease YjgP/YjgQ family protein  27.1 
 
 		 364 aa  99.8  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240939  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0403  permease YjgP/YjgQ  28.65 
 
 		 354 aa  99.8  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0309466  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  27.24 
 
 		 355 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0686  hypothetical protein  26.95 
 
 		 362 aa  99.4  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3718  permease YjgP/YjgQ family protein  25.55 
 
 		 356 aa  98.6  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  26.07 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  26.72 
 
 		 359 aa  99.4  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  23.16 
 
 		 356 aa  99.4  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0678  hypothetical protein  26.95 
 
 		 362 aa  98.6  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002430  hypothetical protein  24.93 
 
 		 356 aa  98.2  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895033  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 1061 aa  97.8  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1141  putative permease  20.94 
 
 		 355 aa  96.7  5e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3045  permease YjgP/YjgQ family protein  25.61 
 
 		 369 aa  96.7  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.453296 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 360 aa  96.3  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  23.48 
 
 		 354 aa  95.9  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2222  permease YjgP/YjgQ family protein  24.53 
 
 		 361 aa  95.9  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.225398 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  24.74 
 
 		 1061 aa  95.5  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11680  permease YjgP/YjgQ family  27.48 
 
 		 353 aa  95.9  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.623053  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03633  hypothetical protein  25.21 
 
 		 356 aa  95.1  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  26.63 
 
 		 355 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0876  hypothetical membrane spanning protein  20.66 
 
 		 355 aa  94.7  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  25.13 
 
 		 434 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  23.96 
 
 		 352 aa  94.4  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  22.49 
 
 		 1153 aa  94  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3080  permease YjgP/YjgQ  23.25 
 
 		 362 aa  94  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1944  hypothetical protein  24.26 
 
 		 373 aa  93.6  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.085708 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2602  permease YjgP/YjgQ family protein  26.15 
 
 		 362 aa  92.8  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193291  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0528  putative permease  24.93 
 
 		 358 aa  92.8  9e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0041624  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3932  permease YjgP/YjgQ family protein  27.76 
 
 		 362 aa  92  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1211  permease YjgP/YjgQ family protein  24.16 
 
 		 362 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000556533 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3649  permease YjgP/YjgQ family protein  27.76 
 
 		 362 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3942  permease YjgP/YjgQ family protein  27.76 
 
 		 362 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1067  permease YjgP/YjgQ family protein  24.02 
 
 		 362 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183228 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  25.14 
 
 		 359 aa  90.9  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2627  permease YjgP/YjgQ family protein  27.68 
 
 		 376 aa  90.9  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2081  hypothetical protein  24.06 
 
 		 356 aa  90.1  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000262997  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3555  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 356 aa  90.1  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0390  permease YjgP/YjgQ family protein  23.22 
 
 		 358 aa  90.1  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0209469  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0397  permease YjgP/YjgQ family protein  24.01 
 
 		 354 aa  90.1  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0180892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  23.25 
 
 		 352 aa  90.1  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1230  permease YjgP/YjgQ family protein  23.37 
 
 		 376 aa  89.7  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.494831  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2021  permease YjgP/YjgQ family protein  27.65 
 
 		 369 aa  89.7  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3541  putative permease  25.54 
 
 		 358 aa  89.7  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000398482  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4049  hypothetical protein  25.54 
 
 		 358 aa  89.7  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000497834  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>