More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2648 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2648  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
997 aa  2050    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.73 
 
 
927 aa  363  8e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0261  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.22 
 
 
948 aa  358  2.9999999999999997e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.82 
 
 
1101 aa  354  5.9999999999999994e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.114215 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.69 
 
 
1260 aa  337  5.999999999999999e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  33.73 
 
 
852 aa  330  1.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 
1064 aa  323  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.7 
 
 
929 aa  321  3.9999999999999996e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.38 
 
 
1340 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2282  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.3 
 
 
685 aa  315  2.9999999999999996e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0298  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 
899 aa  312  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0542846  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3680  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 
744 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.614037  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  37.77 
 
 
1135 aa  311  4e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  34.74 
 
 
1763 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.01 
 
 
816 aa  305  3.0000000000000004e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.32 
 
 
1363 aa  301  4e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 
1548 aa  295  3e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.54 
 
 
916 aa  294  5e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 
957 aa  294  5e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.11 
 
 
1767 aa  294  6e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.11 
 
 
1767 aa  294  6e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 
922 aa  290  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  32.89 
 
 
1200 aa  289  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.28 
 
 
2213 aa  289  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 
1165 aa  289  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  35.52 
 
 
925 aa  289  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  33.08 
 
 
1331 aa  289  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3595  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.29 
 
 
744 aa  288  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.38 
 
 
1234 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.94 
 
 
1771 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000382  putative sensory box sensor histidine kinase/response regulator  31.13 
 
 
873 aa  288  5e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 
1236 aa  287  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  35.34 
 
 
925 aa  287  8e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.69 
 
 
1768 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 
1238 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.25 
 
 
1230 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  33.53 
 
 
1188 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 
914 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  35.2 
 
 
765 aa  285  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
1236 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
1236 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 
1238 aa  285  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 
1238 aa  284  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.38 
 
 
1234 aa  284  5.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 
1238 aa  284  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.08 
 
 
830 aa  283  8.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2022  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 
1258 aa  283  9e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250401  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 
1245 aa  283  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 
833 aa  281  5e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  34.59 
 
 
1014 aa  280  9e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 
1303 aa  280  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.98 
 
 
1611 aa  280  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0413  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.46 
 
 
649 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  36.78 
 
 
917 aa  278  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  31.35 
 
 
1322 aa  278  4e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 
916 aa  278  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 
1326 aa  277  6e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 
767 aa  277  7e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  35.48 
 
 
1765 aa  277  8e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.12 
 
 
1782 aa  277  9e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.18 
 
 
1397 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  36.42 
 
 
917 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  34.95 
 
 
923 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 
1767 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1654  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.37 
 
 
837 aa  276  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00856937  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  32.98 
 
 
1236 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 
1128 aa  275  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 
977 aa  275  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.65 
 
 
1202 aa  275  4.0000000000000004e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  30.68 
 
 
1287 aa  274  7e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.03 
 
 
937 aa  273  9e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.17 
 
 
1784 aa  273  9e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.52 
 
 
1236 aa  273  9e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.26 
 
 
1582 aa  273  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.91 
 
 
929 aa  273  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 
1240 aa  273  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2687  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.69 
 
 
784 aa  272  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.762737  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0119  Signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
754 aa  272  2e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.959467  normal  0.1561 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  36.01 
 
 
905 aa  272  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 
1267 aa  273  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 
917 aa  272  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1191  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.09 
 
 
950 aa  272  2.9999999999999997e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000146059  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0407  ATP-binding region, ATPase-like  33.39 
 
 
650 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.45 
 
 
964 aa  271  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0315  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.8 
 
 
757 aa  271  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 
920 aa  271  5e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0319  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.28 
 
 
636 aa  271  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  33.09 
 
 
1574 aa  271  5.9999999999999995e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  34.97 
 
 
758 aa  270  7e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0129  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 
752 aa  270  7e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.16 
 
 
932 aa  270  8e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.99 
 
 
1792 aa  270  8e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 
946 aa  270  8e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
917 aa  270  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  31.13 
 
 
1683 aa  270  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 
917 aa  270  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.21 
 
 
1266 aa  270  1e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  35.65 
 
 
932 aa  270  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0416  histidine kinase  32.25 
 
 
896 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  33.49 
 
 
2035 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>