25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2371 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2371  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  346  1e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221129 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2315  putative transmembrane protein  33.79 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.49097  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4007  hypothetical protein  26.51 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3846  hypothetical protein  29.65 
 
 		 183 aa  70.9  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2462  putative transmembrane protein  28.19 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.656793  normal  0.0703226 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0665  hypothetical protein  26.22 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1267  putative transmembrane protein  28.75 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0093  hypothetical protein  30.57 
 
 		 188 aa  63.9  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000564586 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4009  hypothetical protein  27.06 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.898368  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0112  putative transmembrane protein  31.16 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0937  hypothetical protein  25.34 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.650732  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2951  hypothetical protein  25.61 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2786  putative transmembrane protein  25.87 
 
 		 180 aa  62  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000254813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1561  hypothetical protein  24.49 
 
 		 215 aa  62  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1551  hypothetical protein  22.94 
 
 		 217 aa  61.2  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3745  putative transmembrane protein  29.93 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3849  hypothetical protein  30.2 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125049  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0901  putative transmembrane protein  26.9 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0767133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1668  putative transmembrane protein  23.86 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3832  hypothetical protein  23.43 
 
 		 183 aa  53.9  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0778  putative transmembrane protein  25 
 
 		 199 aa  48.1  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05846  hypothetical protein  24.05 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1282  hypothetical protein  21.43 
 
 		 186 aa  45.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4467  putative transmembrane protein  26.92 
 
 		 190 aa  40.8  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00546453  normal  0.335651 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4601  putative transmembrane protein  26.92 
 
 		 190 aa  40.8  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0346452  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>