More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2321 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 
862 aa  1771    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2534  1A family penicillin-binding protein  43.02 
 
 
804 aa  598  1e-169  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.401637  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2147  penicillin-binding protein 1A  42.43 
 
 
831 aa  588  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.173589  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  42.31 
 
 
802 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  41.9 
 
 
831 aa  578  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3215  penicillin-binding protein, 1A family  43.41 
 
 
778 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1824  penicillin-binding protein 1A  41.52 
 
 
843 aa  575  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0792156  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4201  putative membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  41.09 
 
 
835 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603081  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  41.76 
 
 
795 aa  573  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  42.18 
 
 
797 aa  571  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0803  penicillin-binding protein, 1A  39.63 
 
 
823 aa  566  1e-160  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  40.79 
 
 
819 aa  567  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  40.86 
 
 
818 aa  566  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3276  1A family penicillin-binding protein  42.09 
 
 
908 aa  568  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.658356  normal  0.980736 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  41.49 
 
 
833 aa  568  1e-160  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.75 
 
 
817 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2444  penicillin-binding protein 1A  42.18 
 
 
830 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257563  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0934  1A family penicillin-binding protein  41.78 
 
 
803 aa  561  1e-158  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.305447  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2326  1A family penicillin-binding protein  40.1 
 
 
807 aa  559  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.774073  unclonable  0.0000291309 
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  40.56 
 
 
819 aa  558  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  40.61 
 
 
819 aa  556  1e-157  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2852  penicillin-binding protein 1A  41.91 
 
 
830 aa  558  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456684  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  40.15 
 
 
804 aa  558  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4359  1A family penicillin-binding protein  40.71 
 
 
810 aa  558  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3955  penicillin-binding protein, 1A family  40.51 
 
 
805 aa  555  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.755336 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2730  penicillin-binding protein, 1A family  42.11 
 
 
832 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2091  penicillin-binding protein 1A  40.08 
 
 
793 aa  553  1e-156  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  40.17 
 
 
805 aa  553  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0727  penicillin-binding protein, 1A family  40.95 
 
 
804 aa  553  1e-156  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3662  1A family penicillin-binding protein  40.42 
 
 
833 aa  555  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  40.05 
 
 
808 aa  550  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2630  penicillin-binding protein, 1A family  40.77 
 
 
807 aa  551  1e-155  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  40.45 
 
 
814 aa  550  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  38.88 
 
 
819 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1708  1A family penicillin-binding protein  39.46 
 
 
818 aa  549  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0118  multimodular transpeptidase-transglycosylase PBP 1A  39.82 
 
 
793 aa  550  1e-155  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6049  penicillin-binding protein, 1A family  40.02 
 
 
805 aa  548  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  39.1 
 
 
809 aa  547  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  40.44 
 
 
796 aa  544  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  39.88 
 
 
841 aa  543  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3124  penicillin-binding protein 1A  40.79 
 
 
807 aa  545  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3007  penicillin-binding protein 1A  41.54 
 
 
830 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.160235 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  38.93 
 
 
827 aa  542  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1797  penicillin-binding protein 1a  38.24 
 
 
818 aa  537  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  41.57 
 
 
818 aa  538  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0960  1A family penicillin-binding protein  39.03 
 
 
817 aa  537  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0340726 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  39.67 
 
 
829 aa  536  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4121  1A family penicillin-binding protein  38.87 
 
 
814 aa  534  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.739203  hitchhiker  0.00000203551 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  39.78 
 
 
803 aa  532  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  40.72 
 
 
800 aa  531  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  38.58 
 
 
817 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  38.31 
 
 
817 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  38.31 
 
 
817 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  38.18 
 
 
817 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2574  1A family penicillin-binding protein  39.81 
 
 
791 aa  523  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.95541 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  38.27 
 
 
814 aa  522  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  38.03 
 
 
814 aa  522  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  38.83 
 
 
819 aa  521  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  38.05 
 
 
804 aa  519  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  38.41 
 
 
773 aa  520  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  38.51 
 
 
791 aa  520  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3241  penicillin-binding protein, 1A family  38.48 
 
 
807 aa  517  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  37.72 
 
 
823 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  39.01 
 
 
830 aa  515  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1816  1A family penicillin-binding protein  37.46 
 
 
845 aa  515  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0319957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  37.25 
 
 
823 aa  514  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  37.8 
 
 
815 aa  514  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  36.76 
 
 
794 aa  507  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  36.63 
 
 
794 aa  508  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  37.63 
 
 
777 aa  507  9.999999999999999e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2692  penicillin-binding protein  36.17 
 
 
846 aa  505  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000762848  hitchhiker  0.0050562 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2253  1A family penicillin-binding protein  40.28 
 
 
803 aa  506  1e-141  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.816825  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1171  penicillin-binding protein  38.38 
 
 
840 aa  499  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0742026  normal  0.682279 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2085  penicillin-binding protein, 1A family  40.1 
 
 
904 aa  496  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.535891  normal  0.507146 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1790  1A family penicillin-binding protein  37.63 
 
 
809 aa  496  1e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2978  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a)  38.84 
 
 
849 aa  497  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02356  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  38.29 
 
 
809 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.448545  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0825  1A family penicillin-binding protein  37.86 
 
 
846 aa  496  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397118  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2534  penicillin-binding protein 1A  37.01 
 
 
854 aa  494  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.175244 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1857  1A family penicillin-binding protein  38.53 
 
 
849 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.874221 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1624  1A family penicillin-binding protein  38.84 
 
 
849 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521017  normal  0.641281 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1861  peptidoglycan glycosyltransferase  37.76 
 
 
854 aa  496  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.894237  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  37.74 
 
 
793 aa  491  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4271  peptidoglycan glycosyltransferase  34.59 
 
 
843 aa  491  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0255  penicillin-binding protein 1A  35.58 
 
 
865 aa  490  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0867  penicillin-binding protein 1A  37.56 
 
 
835 aa  489  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.371617  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  38.79 
 
 
796 aa  489  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3374  penicillin-binding protein 1A  35.69 
 
 
846 aa  488  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2907  penicillin-binding protein, 1A family  39.87 
 
 
777 aa  488  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0114663 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0232  1A family penicillin-binding protein  36.32 
 
 
849 aa  486  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.748115  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  38.31 
 
 
799 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  38.56 
 
 
797 aa  488  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  38.18 
 
 
797 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0060  1A family penicillin-binding protein  36.63 
 
 
852 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.133649 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3254  penicillin-binding protein, 1A family  39.87 
 
 
777 aa  489  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0272171  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  38.34 
 
 
797 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0466  penicillin-binding protein  37.08 
 
 
863 aa  483  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  38.2 
 
 
791 aa  485  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0088  penicillin-binding protein, 1A family  37.83 
 
 
778 aa  485  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0128257 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2720  penicillin-binding protein 1A  38.82 
 
 
797 aa  486  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>