32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2269 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2269  major facilitator transporter  100 
 
 		 427 aa  845    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000581212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2239  ferric reductase domain-containing protein  36.71 
 
 		 642 aa  267  2.9999999999999995e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0544393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1686  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 		 454 aa  145  9e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000674894  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1867  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 436 aa  138  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1647  hypothetical protein  28.16 
 
 		 441 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411737  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1481  transporter, putative  28.54 
 
 		 441 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1094  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 437 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.929439  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0889  transporter, putative  27.53 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1578  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0877587 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0859  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.221691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57608  predicted protein  24.74 
 
 		 474 aa  52.8  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.371537 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 428 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  24.77 
 
 		 415 aa  47.8  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1778  major facilitator superfamily MFS_1  36.59 
 
 		 417 aa  47.4  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.126439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  25.57 
 
 		 455 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  34.02 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  34.02 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  25 
 
 		 426 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 398 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 		 427 aa  44.3  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1879  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 		 435 aa  44.3  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.269185  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  24.18 
 
 		 422 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  26.32 
 
 		 478 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  26.32 
 
 		 478 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  26.32 
 
 		 478 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  26.32 
 
 		 478 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  26.32 
 
 		 478 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  26.32 
 
 		 478 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  26.32 
 
 		 478 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 397 aa  43.5  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1882  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 		 393 aa  43.1  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.36796  normal  0.170219 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>