More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1879 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 617 aa  1271    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0772  excinuclease ABC subunit C  47.99 
 
 		 633 aa  553  1e-156  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00962744  normal  0.347624 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2276  excinuclease ABC, C subunit  46.66 
 
 		 644 aa  543  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  48.32 
 
 		 609 aa  542  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  45.42 
 
 		 613 aa  526  1e-148  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  45.35 
 
 		 607 aa  524  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  45.52 
 
 		 607 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3066  excinuclease ABC subunit C  45.18 
 
 		 607 aa  522  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2220  excinuclease ABC subunit C  45.27 
 
 		 639 aa  522  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0021269  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  45.52 
 
 		 607 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2896  excinuclease ABC subunit C  44.84 
 
 		 607 aa  521  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189646  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  44.86 
 
 		 599 aa  520  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  45.52 
 
 		 607 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  44.84 
 
 		 608 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  44.67 
 
 		 608 aa  519  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2859  excinuclease ABC subunit C  45.56 
 
 		 623 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1082  excinuclease ABC subunit C  45.9 
 
 		 644 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3919  excinuclease ABC subunit C  44.22 
 
 		 631 aa  513  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  45.17 
 
 		 611 aa  514  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0420  excinuclease ABC subunit C  45.29 
 
 		 620 aa  510  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000882939  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1086  excinuclease ABC subunit C  44.44 
 
 		 680 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000501867 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  43.45 
 
 		 626 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3104  excinuclease ABC, C subunit  42.46 
 
 		 682 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.299342  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2735  excinuclease ABC subunit C  44.72 
 
 		 623 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.0935486 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1074  excinuclease ABC subunit C  44.72 
 
 		 623 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.969621  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3671  excinuclease ABC subunit C  44.96 
 
 		 585 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159711  hitchhiker  0.0000000375345 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1975  excinuclease ABC subunit C  44.17 
 
 		 653 aa  505  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2878  excinuclease ABC, C subunit  42.61 
 
 		 682 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2589  excinuclease ABC subunit C  43.26 
 
 		 691 aa  502  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0718587  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2526  excinuclease ABC subunit C  45.87 
 
 		 666 aa  503  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  45.01 
 
 		 607 aa  502  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  43.65 
 
 		 607 aa  503  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4491  excinuclease ABC subunit C  44.98 
 
 		 642 aa  503  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.191027 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0046  excinuclease ABC subunit C  44 
 
 		 629 aa  499  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.714841  hitchhiker  0.00962006 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25040  excinuclease ABC subunit C  44.41 
 
 		 607 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0644  excinuclease ABC subunit C  44.35 
 
 		 631 aa  501  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1232  excinuclease ABC subunit C  44.12 
 
 		 680 aa  498  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101228 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3001  excinuclease ABC, C subunit  42.66 
 
 		 700 aa  496  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3146  excinuclease ABC subunit C  43.91 
 
 		 690 aa  496  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.055346  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0853  excinuclease ABC, C subunit  43.9 
 
 		 608 aa  497  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0979  excinuclease ABC, C subunit  43.9 
 
 		 623 aa  497  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0363417 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1362  excinuclease ABC subunit C  43.67 
 
 		 704 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0782  excinuclease ABC subunit C  43.92 
 
 		 674 aa  495  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191761  normal  0.0714693 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5405  excinuclease ABC, C subunit  41.81 
 
 		 688 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1281  excinuclease ABC subunit C  43.21 
 
 		 695 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.280524  normal  0.136737 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1558  excinuclease ABC subunit C  42.83 
 
 		 690 aa  493  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2520  excinuclease ABC subunit C  43.38 
 
 		 635 aa  494  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0699  excinuclease ABC subunit C  43.07 
 
 		 690 aa  489  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1803  excinuclease ABC, C subunit  44.17 
 
 		 657 aa  491  1e-137  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0340936  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1177  excinuclease ABC subunit C  43.04 
 
 		 695 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.8668  normal  0.100977 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0901  excinuclease ABC subunit C  43.33 
 
 		 699 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.686054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0690  excinuclease ABC subunit C  43.23 
 
 		 690 aa  490  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.485523  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4277  excinuclease ABC subunit C  44.5 
 
 		 634 aa  489  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.471865 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1060  excinuclease ABC subunit C  44.33 
 
 		 658 aa  487  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41739  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0516  excinuclease ABC subunit C  41.78 
 
 		 658 aa  486  1e-136  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1728  excinuclease ABC subunit C  43.44 
 
 		 688 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0415792 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1316  excinuclease ABC subunit C  44.07 
 
 		 627 aa  476  1e-133  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.235211  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1410  excinuclease ABC subunit C  44.07 
 
 		 621 aa  476  1e-133  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00582  excinuclease ABC subunit C  44.46 
 
 		 618 aa  474  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  41.05 
 
 		 613 aa  473  1e-132  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1403  excinuclease ABC subunit C  44.74 
 
 		 614 aa  473  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.252536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0659  excinuclease ABC subunit C  43.22 
 
 		 609 aa  474  1e-132  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.25379  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  43.57 
 
 		 619 aa  475  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2652  excinuclease ABC, C subunit  43.29 
 
 		 668 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2312  excinuclease ABC subunit C  43.48 
 
 		 623 aa  471  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.136814 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  43.05 
 
 		 610 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  41.37 
 
 		 612 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  43.05 
 
 		 610 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  43.05 
 
 		 610 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000023615  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  43.05 
 
 		 610 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000100265  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  42.88 
 
 		 610 aa  464  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110405  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  39.48 
 
 		 607 aa  465  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1849  excinuclease ABC subunit C  42.88 
 
 		 610 aa  465  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  43.05 
 
 		 610 aa  464  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000190411  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  43.05 
 
 		 610 aa  465  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000021646  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1434  excinuclease ABC, C subunit  42.22 
 
 		 679 aa  462  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  41.08 
 
 		 599 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1712  excinuclease ABC, C subunit  41.97 
 
 		 692 aa  460  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2454  excinuclease ABC subunit C  41.36 
 
 		 609 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.263996  normal  0.543932 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1297  excinuclease ABC subunit C  43.21 
 
 		 610 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000512015  hitchhiker  0.00000387597 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2102  excinuclease ABC subunit C  43.05 
 
 		 610 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000495467  normal  0.0150424 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2161  excinuclease ABC subunit C  43.05 
 
 		 610 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138205  hitchhiker  0.0000000035589 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1595  excinuclease ABC subunit C  42.38 
 
 		 610 aa  455  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.31766  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3713  excinuclease ABC, C subunit  42.49 
 
 		 668 aa  458  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1174  excinuclease ABC subunit C  43.05 
 
 		 610 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000294093  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2676  excinuclease ABC subunit C  39.67 
 
 		 609 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2109  excinuclease ABC subunit C  42.88 
 
 		 610 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0217985  hitchhiker  0.00000000000000291711 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2668  excinuclease ABC subunit C  42.72 
 
 		 610 aa  459  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146387  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01878  excinuclease ABC subunit C  42.91 
 
 		 588 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000583054  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1519  excinuclease ABC subunit C  41.89 
 
 		 610 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0983209  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1861  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 		 609 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2561  excinuclease ABC subunit C  39.51 
 
 		 609 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00257936  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2599  excinuclease ABC subunit C  39.51 
 
 		 609 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00115318  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2449  excinuclease ABC subunit C  41.58 
 
 		 608 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0823614  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1783  excinuclease ABC subunit C  39.51 
 
 		 610 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0533171  hitchhiker  0.000000162173 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1548  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 		 609 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000704584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1615  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 		 609 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000543557  normal  0.3636 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1609  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 		 609 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000167064  normal  0.0818954 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1193  excinuclease ABC, C subunit  40.89 
 
 		 609 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1954  excinuclease ABC subunit C  40.4 
 
 		 609 aa  451  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00983646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>