More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1871 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1871  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 336 aa  690    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  42.09 
 
 		 357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  39.19 
 
 		 356 aa  226  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  37.43 
 
 		 338 aa  223  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  40.66 
 
 		 355 aa  223  4e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  41.37 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  41.09 
 
 		 334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  38.48 
 
 		 338 aa  220  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  44.88 
 
 		 349 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  38.71 
 
 		 442 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  40.5 
 
 		 339 aa  214  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  39.7 
 
 		 405 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  39.76 
 
 		 335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  44.17 
 
 		 349 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  38.81 
 
 		 412 aa  212  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2244  aminodeoxychorismate lyase  39.51 
 
 		 336 aa  210  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00467758  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  39.94 
 
 		 351 aa  209  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  38.33 
 
 		 335 aa  209  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2301  hypothetical protein  40.37 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142743  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02713  hypothetical protein  40.75 
 
 		 357 aa  207  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117678  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1661  aminodeoxychorismate lyase  38.08 
 
 		 341 aa  206  4e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.148869  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  41.43 
 
 		 324 aa  204  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  37.76 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  38.75 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0876  aminodeoxychorismate lyase  41.38 
 
 		 353 aa  202  9e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02331  hypothetical protein  39.56 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  38.6 
 
 		 332 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1529  aminodeoxychorismate lyase  38.05 
 
 		 387 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.538963 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  36.87 
 
 		 343 aa  199  7e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  35.59 
 
 		 343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  41.14 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4153  aminodeoxychorismate lyase  37.93 
 
 		 393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.507493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  37.75 
 
 		 356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  36.89 
 
 		 599 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  38.18 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1218  aminodeoxychorismate lyase  38.44 
 
 		 348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  40 
 
 		 327 aa  196  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  45.06 
 
 		 335 aa  197  3e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  40.07 
 
 		 358 aa  196  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  37.43 
 
 		 341 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1584  aminodeoxychorismate lyase  40 
 
 		 364 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0339039  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3828  hypothetical protein  37.54 
 
 		 379 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0420652  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  35.55 
 
 		 579 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  37.43 
 
 		 341 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  38.62 
 
 		 339 aa  196  5.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  36.98 
 
 		 338 aa  196  6e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  38.3 
 
 		 414 aa  196  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  36.01 
 
 		 471 aa  196  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  37.43 
 
 		 363 aa  196  7e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  41.47 
 
 		 345 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  37.92 
 
 		 456 aa  195  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  40.83 
 
 		 377 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  36.61 
 
 		 464 aa  195  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2504  aminodeoxychorismate lyase  41.08 
 
 		 337 aa  195  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  40.78 
 
 		 332 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1641  hypothetical protein  39.69 
 
 		 350 aa  195  1e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.667934  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  36.39 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  41.01 
 
 		 454 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  39.53 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  39.47 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  39.46 
 
 		 345 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1651  hypothetical protein  37.87 
 
 		 371 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.245799  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  39.23 
 
 		 315 aa  194  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1829  aminodeoxychorismate lyase  39.82 
 
 		 332 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021454  normal  0.121238 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  39.21 
 
 		 345 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  39.21 
 
 		 345 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  38.73 
 
 		 403 aa  192  8e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  40.45 
 
 		 345 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  40.45 
 
 		 345 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  36.2 
 
 		 467 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  37.95 
 
 		 339 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  41.16 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  41.16 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  36.2 
 
 		 467 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1612  hypothetical protein  37.06 
 
 		 340 aa  190  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000845082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3796  aminodeoxychorismate lyase  36.87 
 
 		 406 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.77523  normal  0.494507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  38.67 
 
 		 372 aa  190  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1494  aminodeoxychorismate lyase  36.28 
 
 		 400 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1765  aminodeoxychorismate lyase  40.82 
 
 		 336 aa  188  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0979727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  38.23 
 
 		 329 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  40.21 
 
 		 391 aa  187  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0967  aminodeoxychorismate lyase  38.7 
 
 		 357 aa  186  5e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829028  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1918  aminodeoxychorismate lyase  35.99 
 
 		 421 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.204138  unclonable  0.000000331509 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1275  hypothetical protein  38.8 
 
 		 340 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310439  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1341  aminodeoxychorismate lyase  38.54 
 
 		 325 aa  186  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  37.75 
 
 		 341 aa  186  7e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  39.27 
 
 		 338 aa  186  7e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1298  hypothetical protein  38.8 
 
 		 340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166048  hitchhiker  0.00000000000000101215 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1433  aminodeoxychorismate lyase  41.11 
 
 		 331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1987  hypothetical protein  38.8 
 
 		 340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000318105  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2170  hypothetical protein  38.8 
 
 		 340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.7368  hitchhiker  0.0000000000000363112 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1313  hypothetical protein  38.8 
 
 		 340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000010184 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1004  aminodeoxychorismate lyase  42.59 
 
 		 320 aa  185  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0005  aminodeoxychorismate lyase  37.69 
 
 		 327 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000992333  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  37.27 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2614  hypothetical protein  41.16 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  36.84 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2520  aminodeoxychorismate lyase  43.43 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0480566  hitchhiker  0.003327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  36.11 
 
 		 344 aa  183  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  37.8 
 
 		 312 aa  184  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>