More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1863 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  100 
 
 
305 aa  635    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  64.9 
 
 
306 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  62.5 
 
 
306 aa  414  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  62.91 
 
 
306 aa  413  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  62.17 
 
 
308 aa  409  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  61.31 
 
 
312 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  61.97 
 
 
312 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  61.97 
 
 
312 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  61.84 
 
 
306 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  60.66 
 
 
312 aa  402  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  59.54 
 
 
306 aa  402  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000994351  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  61.31 
 
 
307 aa  401  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  60.86 
 
 
307 aa  398  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  62.5 
 
 
306 aa  399  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  60.66 
 
 
312 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2475  branched-chain amino acid aminotransferase  61.76 
 
 
313 aa  395  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  58.22 
 
 
307 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  60.33 
 
 
307 aa  391  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  60.66 
 
 
307 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0254  branched-chain amino acid aminotransferase  59.42 
 
 
317 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.925789  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  60.33 
 
 
307 aa  391  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  60.33 
 
 
307 aa  391  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  60.33 
 
 
307 aa  391  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  60.33 
 
 
307 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  60.33 
 
 
307 aa  391  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  60.66 
 
 
307 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  58.22 
 
 
307 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  60.33 
 
 
307 aa  391  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  60.33 
 
 
307 aa  391  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  59.87 
 
 
309 aa  389  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  60.66 
 
 
307 aa  388  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  60.53 
 
 
306 aa  388  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  60.66 
 
 
307 aa  387  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  60.66 
 
 
307 aa  387  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  59.21 
 
 
307 aa  388  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  59.67 
 
 
307 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  60.2 
 
 
306 aa  386  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  59.54 
 
 
309 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  60.66 
 
 
307 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  59.02 
 
 
307 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0506  branched-chain amino acid aminotransferase  60.52 
 
 
316 aa  385  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309351  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  59.67 
 
 
307 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  59.27 
 
 
311 aa  386  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  59.34 
 
 
307 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1301  branched-chain amino acid aminotransferase  59.8 
 
 
296 aa  382  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0767028 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  59.21 
 
 
307 aa  378  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0147  branched-chain amino acid aminotransferase  59.48 
 
 
313 aa  378  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65778  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  58.88 
 
 
307 aa  376  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  57.57 
 
 
307 aa  374  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  57.57 
 
 
307 aa  374  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  59.27 
 
 
307 aa  375  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  57.57 
 
 
307 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  58.88 
 
 
305 aa  377  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1209  branched-chain amino acid aminotransferase  57.24 
 
 
306 aa  377  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4078  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  57.95 
 
 
304 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  57.57 
 
 
307 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  56.72 
 
 
310 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  56.62 
 
 
307 aa  367  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  55.45 
 
 
309 aa  358  7e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1216  branched-chain amino acid aminotransferase  55.26 
 
 
309 aa  357  9.999999999999999e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00270183 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  56.29 
 
 
307 aa  357  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1176  branched-chain amino acid aminotransferase  55.59 
 
 
309 aa  356  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1179  branched-chain amino acid aminotransferase  57.95 
 
 
304 aa  356  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0193  branched-chain amino acid aminotransferase  56.95 
 
 
307 aa  355  5e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  55.96 
 
 
307 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0981  branched-chain amino acid aminotransferase  53.92 
 
 
309 aa  354  8.999999999999999e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  57.62 
 
 
304 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1052  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  57.95 
 
 
304 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  54.24 
 
 
306 aa  342  4e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  55.92 
 
 
317 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  52.38 
 
 
311 aa  320  3e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0318  branched-chain amino acid aminotransferase  50.84 
 
 
304 aa  317  2e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1404  branched-chain amino acid aminotransferase  50.17 
 
 
304 aa  315  5e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0180  branched-chain amino acid aminotransferase  50.5 
 
 
304 aa  315  6e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  50.99 
 
 
319 aa  312  2.9999999999999996e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3631  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  50.85 
 
 
308 aa  313  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0296  branched-chain amino acid aminotransferase  50.17 
 
 
304 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1707  branched-chain amino acid aminotransferase  50.17 
 
 
304 aa  312  3.9999999999999997e-84  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  50.66 
 
 
308 aa  312  4.999999999999999e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  51.51 
 
 
309 aa  312  5.999999999999999e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  47.99 
 
 
308 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1877  branched-chain amino acid aminotransferase  50.5 
 
 
306 aa  308  9e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0353  branched-chain amino acid aminotransferase  50.17 
 
 
304 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.170926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1099  branched-chain amino acid aminotransferase  49.83 
 
 
307 aa  306  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0041  branched-chain amino acid aminotransferase  51.99 
 
 
319 aa  306  3e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0855  branched-chain amino acid aminotransferase  48.66 
 
 
304 aa  305  5.0000000000000004e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  50.34 
 
 
309 aa  304  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2109  branched-chain amino acid aminotransferase  49 
 
 
304 aa  303  3.0000000000000004e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  49.16 
 
 
309 aa  302  4.0000000000000003e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  49.83 
 
 
308 aa  302  5.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4113  branched-chain amino acid aminotransferase  48.83 
 
 
309 aa  301  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  49.5 
 
 
302 aa  300  2e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  49.5 
 
 
312 aa  300  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0304  branched-chain amino acid aminotransferase  47.32 
 
 
307 aa  300  2e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3219  branched-chain amino acid aminotransferase  49.49 
 
 
306 aa  300  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000260212  normal  0.0812213 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4128  branched-chain amino acid aminotransferase  48.49 
 
 
309 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4185  branched-chain amino acid aminotransferase  48.49 
 
 
309 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4293  branched-chain amino acid aminotransferase  48.49 
 
 
309 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4234  branched-chain amino acid aminotransferase  48.49 
 
 
309 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  48.83 
 
 
309 aa  299  4e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>