More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1840 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1840  SSU ribosomal protein S2P  100 
 
 		 262 aa  541  1e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  55.08 
 
 		 301 aa  303  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  61.95 
 
 		 267 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  60.18 
 
 		 251 aa  301  9e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  61.95 
 
 		 257 aa  300  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  60.18 
 
 		 251 aa  298  4e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  61.06 
 
 		 256 aa  298  4e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  61.5 
 
 		 233 aa  299  4e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  61.5 
 
 		 255 aa  298  6e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  61.5 
 
 		 255 aa  298  7e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  59.82 
 
 		 257 aa  297  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  60.91 
 
 		 343 aa  295  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  60.91 
 
 		 314 aa  295  6e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0273  30S ribosomal protein S2  61.19 
 
 		 301 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  60.91 
 
 		 315 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  57.96 
 
 		 262 aa  291  9e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  58.41 
 
 		 255 aa  291  1e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  57.52 
 
 		 235 aa  289  3e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  57.96 
 
 		 235 aa  289  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  58.41 
 
 		 271 aa  288  6e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2347  30S ribosomal protein S2  54.74 
 
 		 291 aa  286  2e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  57.52 
 
 		 262 aa  286  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  59.29 
 
 		 238 aa  286  2.9999999999999996e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1381  30S ribosomal protein S2  50.75 
 
 		 267 aa  285  5e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  57.08 
 
 		 258 aa  285  5.999999999999999e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  52.76 
 
 		 252 aa  285  8e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0105  30S ribosomal protein S2  59.29 
 
 		 255 aa  283  1.0000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000131996  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  56.64 
 
 		 235 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  57.08 
 
 		 233 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  57.08 
 
 		 233 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  57.08 
 
 		 233 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  57.08 
 
 		 233 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  57.08 
 
 		 233 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  56.19 
 
 		 255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  57.08 
 
 		 233 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  56.19 
 
 		 255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  57.08 
 
 		 233 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  56.64 
 
 		 233 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  57.08 
 
 		 233 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  57.08 
 
 		 233 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  57.08 
 
 		 262 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  56.64 
 
 		 233 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  58.56 
 
 		 248 aa  281  9e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1583  30S ribosomal protein S2  53.5 
 
 		 255 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  58.41 
 
 		 244 aa  280  2e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  56.25 
 
 		 259 aa  280  2e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  57.08 
 
 		 252 aa  280  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  57.52 
 
 		 232 aa  279  4e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1776  30S ribosomal protein S2  55.56 
 
 		 255 aa  279  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.890792 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  56.64 
 
 		 244 aa  278  5e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1131  30S ribosomal protein S2  56 
 
 		 255 aa  278  6e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.439275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2108  30S ribosomal protein S2  57.59 
 
 		 254 aa  278  8e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  58.04 
 
 		 274 aa  278  9e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1832  30S ribosomal protein S2  58.85 
 
 		 256 aa  277  1e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000152831  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  57.14 
 
 		 257 aa  277  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0577  30S ribosomal protein S2  50.81 
 
 		 294 aa  277  1e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000845501  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0975  SSU ribosomal protein S2P  51.72 
 
 		 260 aa  277  1e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2029  30S ribosomal protein S2  53.78 
 
 		 256 aa  276  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12904  30S ribosomal protein S2  56.64 
 
 		 287 aa  276  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0383521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2805  30S ribosomal protein S2  55 
 
 		 313 aa  276  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00564496  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2924  30S ribosomal protein S2  57.14 
 
 		 271 aa  276  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.240537 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3196  ribosomal protein S2  53.33 
 
 		 253 aa  276  3e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2104  ribosomal protein S2  52.33 
 
 		 272 aa  276  3e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0676  30S ribosomal protein S2  54.2 
 
 		 292 aa  275  5e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.560219  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2528  30S ribosomal protein S2  53.82 
 
 		 248 aa  275  6e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2680  30S ribosomal protein S2  52.67 
 
 		 246 aa  275  7e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000034456  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  55.75 
 
 		 280 aa  275  7e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0926  30S ribosomal protein S2  55.75 
 
 		 257 aa  274  9e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148572  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1162  30S ribosomal protein S2  53.78 
 
 		 256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.278359  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1380  30S ribosomal protein S2  56.19 
 
 		 288 aa  274  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272546  normal  0.0375782 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1444  ribosomal protein S2  57.33 
 
 		 250 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.152019  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1160  ribosomal protein S2  57.33 
 
 		 250 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  52.44 
 
 		 282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1119  30S ribosomal protein S2  53.78 
 
 		 254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  55.45 
 
 		 289 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2548  30S ribosomal protein S2  52.84 
 
 		 250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.443564  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0237  ribosomal protein S2  55.86 
 
 		 314 aa  272  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1322  30S ribosomal protein S2  49.08 
 
 		 295 aa  272  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1230  30S ribosomal protein S2  52.02 
 
 		 279 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133873  normal  0.0467572 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  54.42 
 
 		 232 aa  271  5.000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0583  30S ribosomal protein S2  54.22 
 
 		 271 aa  272  5.000000000000001e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0651099  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0377  30S ribosomal protein S2  50 
 
 		 245 aa  271  6e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000247942  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2376  ribosomal protein S2  54.91 
 
 		 261 aa  271  6e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_321  ribosomal protein S2  50 
 
 		 245 aa  271  6e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000206427  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0994  30S ribosomal protein S2  53.91 
 
 		 303 aa  271  6e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271344  normal  0.423917 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2436  30S ribosomal protein S2  56.14 
 
 		 334 aa  271  9e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9516  30S ribosomal protein S2  50.39 
 
 		 307 aa  271  9e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1161  30S ribosomal protein S2  55.11 
 
 		 300 aa  271  9e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1548  30S ribosomal protein S2  54.22 
 
 		 259 aa  270  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.403357 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1285  ribosomal protein S2  54.91 
 
 		 248 aa  271  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297191  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3581  30S ribosomal protein S2  55.56 
 
 		 289 aa  271  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2306  30S ribosomal protein S2  51.01 
 
 		 276 aa  270  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1466  30S ribosomal protein S2  54.87 
 
 		 247 aa  270  2e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.162448  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1974  30S ribosomal protein S2  53.54 
 
 		 284 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.34334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0359  30S ribosomal protein S2  52.68 
 
 		 245 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000354346  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4133  30S ribosomal protein S2  53.1 
 
 		 279 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1586  30S ribosomal protein S2  54.87 
 
 		 262 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.551794  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1941  ribosomal protein S2  52.89 
 
 		 262 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2039  30S ribosomal protein S2  53.54 
 
 		 284 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.07144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2209  30S ribosomal protein S2  53.54 
 
 		 273 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.092398  normal  0.16392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>