More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1834 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 		 878 aa  1770    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 		 784 aa  343  5.999999999999999e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 783 aa  342  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 686 aa  340  5e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 808 aa  339  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 		 772 aa  339  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  39.14 
 
 		 734 aa  338  2.9999999999999997e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 804 aa  338  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 896 aa  336  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 		 679 aa  335  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 896 aa  335  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  41.2 
 
 		 742 aa  331  3e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 741 aa  330  8e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 		 679 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 		 760 aa  329  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 		 781 aa  329  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  39.63 
 
 		 740 aa  327  5e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 		 777 aa  326  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 		 762 aa  324  4e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  34.42 
 
 		 793 aa  323  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  40.13 
 
 		 769 aa  323  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 765 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  35.18 
 
 		 763 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 755 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  34.13 
 
 		 789 aa  320  5e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  38.3 
 
 		 768 aa  321  5e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.22 
 
 		 764 aa  319  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0357  CheA signal transduction histidine kinase  38.48 
 
 		 695 aa  318  2e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 865 aa  318  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 865 aa  318  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  39.61 
 
 		 764 aa  318  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 		 767 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  37.43 
 
 		 801 aa  315  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 		 762 aa  314  4.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  38.63 
 
 		 752 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  39.96 
 
 		 777 aa  312  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  35.73 
 
 		 798 aa  310  6.999999999999999e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  34.41 
 
 		 2336 aa  309  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2678  CheA signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 		 705 aa  308  3e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.295272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2773  CheA signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 		 705 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00107192  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  36.4 
 
 		 864 aa  306  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0964  chemotaxis histidine kinase  36.27 
 
 		 1079 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  36.4 
 
 		 864 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  36.4 
 
 		 864 aa  305  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  36.4 
 
 		 864 aa  305  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3683  CheA signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 		 769 aa  305  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  36.4 
 
 		 864 aa  305  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  36.4 
 
 		 864 aa  305  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5517  CheA signal transduction histidine kinases  37.32 
 
 		 769 aa  304  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0873322  normal  0.1808 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 766 aa  304  6.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0505  chemotaxis sensor histidine kinase, putative  35.92 
 
 		 832 aa  303  9e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391708  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2304  CheA signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 		 769 aa  302  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400657 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  33.75 
 
 		 764 aa  301  3e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3733  CheA signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 		 769 aa  300  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.577352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4572  CheA signal transduction histidine kinases  36.91 
 
 		 769 aa  300  6e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3791  CheA signal transduction histidine kinases  36.91 
 
 		 769 aa  300  6e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.267283 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 777 aa  296  9e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 2423 aa  296  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  35.26 
 
 		 770 aa  295  4e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  26.01 
 
 		 803 aa  294  6e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  33.9 
 
 		 770 aa  291  2e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0469  CheA signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 		 830 aa  292  2e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153889  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  35.09 
 
 		 2476 aa  292  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  34.91 
 
 		 2458 aa  291  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0238  CheA signal transduction histidine kinases  37.66 
 
 		 764 aa  291  5.0000000000000004e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 756 aa  291  5.0000000000000004e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  33.83 
 
 		 769 aa  290  8e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  33.83 
 
 		 769 aa  290  1e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 2539 aa  290  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  34.04 
 
 		 769 aa  288  2e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 		 1907 aa  288  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  34.26 
 
 		 785 aa  285  3.0000000000000004e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  33.26 
 
 		 783 aa  283  1e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 2212 aa  282  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0638  CheA signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 		 753 aa  282  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0647  CheA signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 		 756 aa  280  6e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  31.66 
 
 		 2301 aa  280  8e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 1647 aa  280  9e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0613  CheA signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 750 aa  280  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.972381  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  33.67 
 
 		 1992 aa  279  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  35.81 
 
 		 839 aa  278  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.31 
 
 		 1180 aa  278  4e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 1974 aa  278  5e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3533  CheA signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 808 aa  277  5e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.229129  normal  0.100521 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  34.53 
 
 		 1989 aa  277  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  32.05 
 
 		 2026 aa  276  9e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 2026 aa  276  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 1646 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  31.86 
 
 		 2301 aa  275  3e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 1646 aa  275  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1193  CheA signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 		 706 aa  275  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0440291  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 1609 aa  275  3e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.85 
 
 		 1971 aa  274  5.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  32.51 
 
 		 1987 aa  273  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 1758 aa  272  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0657  CheA signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 		 758 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0137797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  31.6 
 
 		 2284 aa  270  8e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  32.73 
 
 		 1956 aa  270  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  33.83 
 
 		 774 aa  269  1e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 1127 aa  270  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>