More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1811 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
322 aa  666    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  34.46 
 
 
319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  40.3 
 
 
420 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  41.92 
 
 
447 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  39.74 
 
 
427 aa  152  8.999999999999999e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  38.5 
 
 
402 aa  150  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  40 
 
 
294 aa  150  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  41.21 
 
 
429 aa  142  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  36.99 
 
 
417 aa  142  8e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  37.39 
 
 
401 aa  140  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  36.12 
 
 
428 aa  135  8e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  30.87 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  35.25 
 
 
440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  32.79 
 
 
487 aa  112  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  33.08 
 
 
456 aa  111  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  31.89 
 
 
623 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  32.35 
 
 
478 aa  111  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 
388 aa  109  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  32.49 
 
 
380 aa  109  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  30.11 
 
 
320 aa  106  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  29.76 
 
 
1755 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  32.39 
 
 
1987 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.32 
 
 
542 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  30 
 
 
637 aa  102  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  30.51 
 
 
458 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  32.16 
 
 
490 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  33.47 
 
 
374 aa  99.8  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 
544 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  34.01 
 
 
381 aa  98.6  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  32.89 
 
 
543 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  32.83 
 
 
510 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  30.96 
 
 
506 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  30.41 
 
 
368 aa  95.5  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  30.45 
 
 
386 aa  92.4  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  47.06 
 
 
1707 aa  92  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  31.64 
 
 
366 aa  90.1  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  35.71 
 
 
266 aa  88.2  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  31.45 
 
 
386 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  32.38 
 
 
727 aa  86.7  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  32.2 
 
 
362 aa  86.7  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  31.45 
 
 
412 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  32.39 
 
 
365 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2655  agarase  42.64 
 
 
1335 aa  84  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0452542  normal  0.27666 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  31.58 
 
 
240 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  31.93 
 
 
445 aa  81.6  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  33.82 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  31.17 
 
 
585 aa  79.7  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  34.31 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1657  opacity protein/surface antigen  48.39 
 
 
290 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.92077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  29.34 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  29.82 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  29.82 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  29.94 
 
 
239 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  38.53 
 
 
613 aa  76.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  31.33 
 
 
449 aa  76.3  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  34.48 
 
 
509 aa  76.3  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  32.72 
 
 
230 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  32.72 
 
 
230 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  31.03 
 
 
222 aa  75.1  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  33.57 
 
 
264 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000182136  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  33.53 
 
 
375 aa  75.1  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  32.46 
 
 
669 aa  74.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  30.54 
 
 
440 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  31.14 
 
 
239 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  29.94 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  36.45 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  32.1 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  32.85 
 
 
333 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  32.61 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  30.24 
 
 
1264 aa  73.6  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2201  OmpA/MotB domain-containing protein  32.86 
 
 
264 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.203533  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2411  OmpA/MotB domain-containing protein  32.86 
 
 
264 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00660043  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  27.33 
 
 
656 aa  73.6  0.000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  34.48 
 
 
537 aa  73.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  30 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  30.72 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  33.56 
 
 
630 aa  72.8  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  32.79 
 
 
677 aa  72.4  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  36.54 
 
 
352 aa  72.4  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  35.92 
 
 
638 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  32.41 
 
 
344 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  32.19 
 
 
345 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  31.03 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3164  OmpA/MotB domain protein  55.93 
 
 
486 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0221  OmpA/MotB domain protein  40.19 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0210773 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  31.34 
 
 
498 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  32.1 
 
 
230 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  37.62 
 
 
464 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  33.64 
 
 
671 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  33.66 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  31.13 
 
 
645 aa  70.9  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  37.74 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1289  OmpA/MotB domain protein  31.73 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000447727  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  29.53 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  30.25 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  29.05 
 
 
226 aa  70.5  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  30.77 
 
 
376 aa  70.1  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  37.25 
 
 
415 aa  70.1  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  30.63 
 
 
658 aa  70.1  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  30.2 
 
 
653 aa  70.1  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>