More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1794 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1794  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 589 aa  1216    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000132214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3226  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.71 
 
 		 1251 aa  288  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796968  normal  0.806997 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  29.17 
 
 		 1574 aa  273  6e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  35.42 
 
 		 794 aa  216  8e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1889  diguanylate cyclase  31.63 
 
 		 714 aa  200  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.838759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2278  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 		 357 aa  187  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.530752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  34.58 
 
 		 1065 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0841  GGDEF domain-containing protein  34.02 
 
 		 489 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0842  diguanylate cyclase with extracellular sensor  34.93 
 
 		 484 aa  179  9e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.105968  hitchhiker  0.00226884 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0726  histidine kinase  25.72 
 
 		 570 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.408803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1063  diguanylate cyclase  32.21 
 
 		 458 aa  177  4e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.868006  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0854  diguanylate cyclase  34.59 
 
 		 507 aa  177  7e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.485181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3689  diguanylate cyclase  29.67 
 
 		 935 aa  176  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0819  diguanylate cyclase  35.64 
 
 		 507 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00531525  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1733  diguanylate cyclase  31.46 
 
 		 464 aa  174  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546701  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3519  extracellular solute-binding protein  34.21 
 
 		 366 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3325  diguanylate cyclase  35.43 
 
 		 482 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3437  diguanylate cyclase  34.46 
 
 		 483 aa  172  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0184931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0697  diguanylate cyclase  34.77 
 
 		 482 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000140018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2637  diguanylate cyclase with extracellular sensor  29.97 
 
 		 474 aa  169  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0136  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 		 665 aa  168  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0549  diguanylate cyclase  29.61 
 
 		 488 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0215358  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  35.59 
 
 		 778 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2855  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 		 348 aa  161  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02407  GGDEF domain protein  31.29 
 
 		 503 aa  161  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1920  diguanylate cyclase  31.77 
 
 		 893 aa  160  5e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0500  histidine kinase  23.55 
 
 		 922 aa  160  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1010  signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 626 aa  152  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.82 
 
 		 1248 aa  152  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0144  sensor protein evgS precursor  24.14 
 
 		 830 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0191  sensor protein EvgS  23.69 
 
 		 830 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.337786  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2444  sensor histidine kinase  25.44 
 
 		 610 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.119384  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1136  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0386  sensory box protein  29.41 
 
 		 1247 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.298787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 729 aa  144  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.15545  normal  0.515162 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.52 
 
 		 768 aa  145  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4029  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  30.54 
 
 		 1244 aa  145  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0420  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  29.41 
 
 		 1247 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2349  Hpt sensor hybrid histidine kinase  25.31 
 
 		 1093 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0868194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1030  histidine kinase  37.27 
 
 		 261 aa  144  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.975788  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4445  response regulator/sensor histidine kinase  24.11 
 
 		 1141 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2782  Hpt sensor hybrid histidine kinase  23.88 
 
 		 1091 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0417  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.07 
 
 		 1247 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3413  Hpt sensor hybrid histidine kinase  25.49 
 
 		 1093 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.464366 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.08 
 
 		 1165 aa  140  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.51 
 
 		 2213 aa  139  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  26.15 
 
 		 775 aa  139  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  23.49 
 
 		 856 aa  139  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07500  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1245 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.411522  normal  0.391796 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0288  Hpt sensor hybrid histidine kinase  22.3 
 
 		 1141 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0687  ATP-binding region ATPase domain protein  23.1 
 
 		 813 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1958  putative PAS/PAC sensor protein  25.14 
 
 		 598 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4816  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.34 
 
 		 1247 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.201907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2154  Hpt sensor hybrid histidine kinase  25.09 
 
 		 815 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.13 
 
 		 2654 aa  134  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4966  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  22.59 
 
 		 951 aa  134  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.292915 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.9 
 
 		 1410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  27.53 
 
 		 2035 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4410  virulence sensor protein BvgS  22.72 
 
 		 948 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213714  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0885  membrane associated GGDEF protein  26.81 
 
 		 712 aa  132  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4002  sensory transduction histidine kinase  27.43 
 
 		 1689 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0480  putative PAS/PAC sensor protein  27.53 
 
 		 1686 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2693  histidine kinase  22.35 
 
 		 782 aa  129  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.145264  normal  0.474998 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.2 
 
 		 1102 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2961  GGDEF domain-containing protein  39.13 
 
 		 204 aa  127  6e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0857681  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 1255 aa  126  9e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3548  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.92 
 
 		 1681 aa  125  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0482  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.92 
 
 		 1681 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0717  hypothetical protein  26.05 
 
 		 1245 aa  124  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 		 1788 aa  123  7e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2527  Hpt sensor hybrid histidine kinase  24.47 
 
 		 1090 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120042  normal  0.0845157 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.45 
 
 		 940 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3999  sensor histidine kinase  34.23 
 
 		 310 aa  120  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.5 
 
 		 1436 aa  118  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.701044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.97 
 
 		 1237 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473456  normal  0.0283242 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3358  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.5 
 
 		 1436 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.504651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1864  Hpt sensor hybrid histidine kinase  21.67 
 
 		 1069 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30700  putative sensor/response regulator hybrid  22.77 
 
 		 992 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.716544  hitchhiker  0.000396049 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.66 
 
 		 1194 aa  114  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0814409  normal  0.0127622 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0082  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.33 
 
 		 946 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2074  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.09 
 
 		 912 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.136005  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 		 1109 aa  110  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1844  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 		 932 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0076  GGDEF domain-containing protein  25.74 
 
 		 941 aa  109  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0481  response regulator receiver protein  28.83 
 
 		 523 aa  106  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2185  diguanylate cyclase  26.58 
 
 		 941 aa  105  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.260855  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1888  GGDEF domain-containing protein  27.64 
 
 		 930 aa  105  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000133848  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0483  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 524 aa  104  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3547  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 524 aa  104  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1952  diguanylate cyclase  25.44 
 
 		 937 aa  104  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.105215  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2113  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 955 aa  104  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2324  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 1089 aa  103  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2029  diguanylate cyclase  26.35 
 
 		 932 aa  101  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0571217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2080  diguanylate cyclase  26.83 
 
 		 934 aa  99.8  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1934  diguanylate cyclase  25.61 
 
 		 937 aa  99  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0766434  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2081  diguanylate cyclase  24.39 
 
 		 937 aa  99  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0379355  normal  0.0338945 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2834  Hpt sensor hybrid histidine kinase  22.24 
 
 		 808 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.83958  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2367  diguanylate cyclase  25.76 
 
 		 923 aa  98.6  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.457753  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0759  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.19 
 
 		 818 aa  98.2  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2113  PAS  26.64 
 
 		 1206 aa  97.8  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.819255  normal  0.387177 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>