167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1775 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1775  SSU ribosomal protein S21P  100 
 
 
67 aa  129  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000600029  decreased coverage  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5536  30S ribosomal protein S21  66.67 
 
 
111 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725076  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1490  30S ribosomal protein S21  66.67 
 
 
96 aa  84  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4071  30S ribosomal protein S21  66.67 
 
 
105 aa  84  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3777  30S ribosomal protein S21  66.67 
 
 
105 aa  84  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0857629  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4033  30S ribosomal protein S21  66.67 
 
 
102 aa  84  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.734588  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0684  30S ribosomal protein S21  66.67 
 
 
97 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.42682 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3994  SSU ribosomal protein S21P  75 
 
 
75 aa  82.4  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.756973  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0811  30S ribosomal protein S21  70.15 
 
 
78 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.218062 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0924  30S ribosomal protein S21  70.15 
 
 
79 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0294351  normal  0.228952 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4529  30S ribosomal protein S21  65.08 
 
 
91 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4580  30S ribosomal protein S21  70 
 
 
77 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.44401  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2753  30S ribosomal protein S21  67.16 
 
 
71 aa  81.6  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0302  30S ribosomal protein S21  67.16 
 
 
77 aa  81.3  0.000000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6336  30S ribosomal protein S21  70 
 
 
78 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3362  30S ribosomal protein S21  65.67 
 
 
70 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17899  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3664  30S ribosomal protein S21  69.64 
 
 
71 aa  79.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.159023  normal  0.324172 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2255  30S ribosomal protein S21  66.1 
 
 
64 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000394301  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3891  30S ribosomal protein S21  69.64 
 
 
68 aa  79  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0666745 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2519  30S ribosomal protein S21  69.64 
 
 
68 aa  79  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3775  30S ribosomal protein S21  69.64 
 
 
79 aa  79.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4259  30S ribosomal protein S21  64.18 
 
 
82 aa  79  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156071  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1951  30S ribosomal protein S21  65.67 
 
 
78 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258071  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1546  ribosomal protein S21  63.33 
 
 
111 aa  78.2  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.770446 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0318  30S ribosomal protein S21  69.64 
 
 
79 aa  77.8  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.124405  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0246  30S ribosomal protein S21  67.86 
 
 
68 aa  78.2  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2287  30S ribosomal protein S21  71.43 
 
 
79 aa  77  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.281823 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4656  30S ribosomal protein S21  62.69 
 
 
87 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1445  30S ribosomal protein S21  62.69 
 
 
101 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.815794  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3962  30S ribosomal protein S21  62.69 
 
 
100 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00936772  normal  0.750031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1422  30S ribosomal protein S21  62.69 
 
 
100 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6850  30S ribosomal protein S21  62.69 
 
 
100 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321881  normal  0.688892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7554  30S ribosomal protein S21  58.73 
 
 
99 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190009  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0999  30S ribosomal protein S21  67.86 
 
 
95 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3283  30S ribosomal protein S21  67.86 
 
 
67 aa  74.7  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116244  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1043  30S ribosomal protein S21  69.64 
 
 
80 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1233  30S ribosomal protein S21  67.86 
 
 
95 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110904  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2835  30S ribosomal protein S21  66.07 
 
 
68 aa  74.3  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0730941  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0718  30S ribosomal protein S21  64.29 
 
 
68 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0404324  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2373  30S ribosomal protein S21  64.29 
 
 
68 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.542346 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2437  30S ribosomal protein S21  64.29 
 
 
68 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0560968 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2267  30S ribosomal protein S21  64.29 
 
 
68 aa  73.6  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399019  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0966  30S ribosomal protein S21  70.59 
 
 
75 aa  73.6  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.14611  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2800  30S ribosomal protein S21  70.59 
 
 
76 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.556498  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0906  30S ribosomal protein S21  70.59 
 
 
75 aa  73.6  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1391  30S ribosomal protein S21  70.59 
 
 
75 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.356035  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2067  ribosomal protein S21  70.59 
 
 
73 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000824864 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6014  ribosomal protein S21  66.07 
 
 
79 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1253  ribosomal protein S21  68.63 
 
 
76 aa  70.9  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193368  normal  0.239118 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2562  SSU ribosomal protein S21P  64.71 
 
 
92 aa  70.1  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0900  30S ribosomal protein S21  62.75 
 
 
89 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0906  30S ribosomal protein S21  52.54 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1039  30S ribosomal protein S21  64.29 
 
 
68 aa  59.7  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.823264  normal  0.810122 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3869  SSU ribosomal protein S21P  64.29 
 
 
81 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.174187  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0094  ribosomal protein S21  46.55 
 
 
73 aa  58.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0373  30S ribosomal protein S21  67.5 
 
 
67 aa  57.4  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0468  ribosomal protein S21  50.91 
 
 
68 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000123547  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0360  30S ribosomal protein S21  45.16 
 
 
71 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000120281  hitchhiker  0.000381464 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0211  30S ribosomal protein S21  43.55 
 
 
71 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000174469  hitchhiker  0.00173439 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0231  30S ribosomal protein S21  43.55 
 
 
71 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00000608143  normal  0.965473 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0149  30S ribosomal protein S21  49.21 
 
 
91 aa  48.9  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.000244084  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0978  30S ribosomal protein S21  49.21 
 
 
90 aa  49.3  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0896  30S ribosomal protein S21  39.68 
 
 
70 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.82181  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0389  30S ribosomal protein S21  39.68 
 
 
70 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1947  30S ribosomal protein S21  39.68 
 
 
70 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1856  30S ribosomal protein S21  39.68 
 
 
70 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1001  30S ribosomal protein S21  38.18 
 
 
70 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.428205  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1781  30S ribosomal protein S21  37.29 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.966323  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0396  30S ribosomal protein S21  37.29 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6777  30S ribosomal protein S21  39.68 
 
 
70 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.634891  hitchhiker  0.00809578 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1898  30S ribosomal protein S21  40.35 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0497287 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0529  30S ribosomal protein S21  35.59 
 
 
70 aa  44.3  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0008  30S ribosomal protein S21  39.62 
 
 
70 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.334489 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3426  30S ribosomal protein S21  39.62 
 
 
70 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3749  30S ribosomal protein S21  39.62 
 
 
70 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2823  30S ribosomal protein S21  41.38 
 
 
70 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1191  SSU ribosomal protein S21P  46.51 
 
 
57 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.172941  normal  0.0994572 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3254  30S ribosomal protein S21  36.21 
 
 
70 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0163212 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3780  30S ribosomal protein S21  36.21 
 
 
70 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0792875  normal  0.0326962 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1191  30S ribosomal protein S21  36.21 
 
 
70 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2307  30S ribosomal protein S21  37.7 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2280  30S ribosomal protein S21  37.7 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0827  ribosomal protein S21  41.51 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0760536  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2991  ribosomal protein S21  39.66 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1786  30S ribosomal protein S21  36.21 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000177604 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2385  30S ribosomal protein S21  37.5 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.66325 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2207  30S ribosomal protein S21  34.48 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1809  ribosomal protein S21  42.37 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000175133  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0618  30S ribosomal protein S21  38.98 
 
 
71 aa  42.7  0.002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.141682  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4482  30S ribosomal protein S21  34.48 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.590266  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3883  30S ribosomal protein S21  34.48 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0313  ribosomal protein S21  42.59 
 
 
71 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00659412  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3644  30S ribosomal protein S21  34.48 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3944  30S ribosomal protein S21  36.21 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0635  ribosomal protein S21  38.89 
 
 
71 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.12914e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4639  30S ribosomal protein S21  38.98 
 
 
71 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.459831 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0301  30S ribosomal protein S21  38.89 
 
 
71 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000000915609  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3469  30S ribosomal protein S21  38.89 
 
 
71 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000763372  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3399  30S ribosomal protein S21  38.89 
 
 
71 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000123882  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3463  30S ribosomal protein S21  38.89 
 
 
71 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000248235  normal  0.0117511 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>