More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1758 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  100 
 
 
592 aa  1198    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
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NC_010581  Bind_1563  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.8 
 
 
610 aa  427  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.553946 
 
 
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NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.93 
 
 
578 aa  419  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.61 
 
 
573 aa  421  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0891  RecJ exonuclease  40.82 
 
 
584 aa  417  9.999999999999999e-116  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2948  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.24 
 
 
603 aa  412  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181074  hitchhiker  0.00226197 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2408  RecJ exonuclease  42.88 
 
 
606 aa  412  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.14 
 
 
589 aa  414  1e-114  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.66 
 
 
586 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_3073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.66 
 
 
603 aa  402  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
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NC_002978  WD0312  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.42 
 
 
579 aa  402  9.999999999999999e-111  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.42 
 
 
574 aa  395  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.4 
 
 
577 aa  395  1e-108  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2797  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.05 
 
 
605 aa  395  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.532995  normal  0.915588 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.89 
 
 
827 aa  390  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3011  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.63 
 
 
605 aa  390  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245556  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.69 
 
 
568 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4751  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.7 
 
 
626 aa  389  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.58 
 
 
885 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.78 
 
 
599 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.23 
 
 
594 aa  382  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.209081  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.35 
 
 
814 aa  379  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1506  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.39 
 
 
603 aa  378  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3002  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.12 
 
 
582 aa  373  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.728985  normal  0.47011 
 
 
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NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.72 
 
 
573 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.76 
 
 
907 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  39.76 
 
 
578 aa  371  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2813  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.93 
 
 
613 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0113123  normal 
 
 
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NC_011004  Rpal_2787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.8 
 
 
613 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007406  Nwi_1645  RecJ exonuclease  39.73 
 
 
613 aa  365  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.79109 
 
 
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NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.89 
 
 
573 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0832  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.92 
 
 
583 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.792862 
 
 
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NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.22 
 
 
788 aa  365  1e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.6 
 
 
564 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.95 
 
 
569 aa  364  3e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0490686 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2885  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.07 
 
 
611 aa  362  8e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2275  single-stranded-DNA-specific exonuclease  40.98 
 
 
585 aa  362  1e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.02 
 
 
785 aa  361  2e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_2274  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.23 
 
 
573 aa  360  3e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349175  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.28 
 
 
811 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0405  single-stranded DNA-specific exonuclease  41.08 
 
 
583 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008044  TM1040_2166  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.76 
 
 
603 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.145891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2762  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.93 
 
 
611 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0347  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.64 
 
 
564 aa  357  5e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_2962  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.36 
 
 
613 aa  356  5e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.972235 
 
 
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NC_007958  RPD_2499  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.36 
 
 
633 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.408241  normal  0.222109 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2059  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.91 
 
 
583 aa  356  6.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.04 
 
 
989 aa  355  2e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1296  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.15 
 
 
594 aa  354  2e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_1547  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.31 
 
 
600 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009485  BBta_4000  exonuclease RecJ  39.76 
 
 
613 aa  355  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0990  exonuclease RecJ  37.44 
 
 
594 aa  354  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1195  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.97 
 
 
584 aa  352  8e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2307  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.7 
 
 
613 aa  350  3e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009616  Tmel_0301  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.75 
 
 
977 aa  348  1e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_2989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.1 
 
 
611 aa  348  1e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.907848 
 
 
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NC_008686  Pden_1877  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.43 
 
 
580 aa  348  2e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2280  single-stranded-DNA-specific exonuclease  36.93 
 
 
600 aa  347  4e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340529  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0590  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.99 
 
 
568 aa  347  4e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50334  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.77 
 
 
573 aa  347  5e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1741  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.14 
 
 
600 aa  346  6e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4733  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.56 
 
 
588 aa  346  7e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.99 
 
 
779 aa  343  4e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1287  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.92 
 
 
831 aa  343  5e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02825  single-stranded-DNA-specific exonuclease recJ  35.09 
 
 
568 aa  343  5e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.274504  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  37 
 
 
932 aa  343  5.999999999999999e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2106  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.23 
 
 
573 aa  342  1e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00306237  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.91 
 
 
732 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1887  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.58 
 
 
570 aa  340  5e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2008  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.13 
 
 
572 aa  339  8e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00291083  decreased coverage  0.00122076 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.61 
 
 
773 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1920  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.29 
 
 
594 aa  336  7e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.01 
 
 
798 aa  336  7e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
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NC_004310  BR1270  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.21 
 
 
594 aa  335  1e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3931  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.89 
 
 
572 aa  335  1e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420242  normal  0.0571898 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3611  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.56 
 
 
801 aa  335  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000975309  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.33 
 
 
568 aa  334  3e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550153 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0707  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.16 
 
 
779 aa  334  3e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.99 
 
 
779 aa  333  4e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.99 
 
 
779 aa  333  4e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3014  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.14 
 
 
588 aa  333  4e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.858016 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2398  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.29 
 
 
577 aa  333  5e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924128  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2502  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.3 
 
 
619 aa  333  5e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386511  normal  0.196855 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4528  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.99 
 
 
779 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3668  single-strand DNA specific exonuclease  31.57 
 
 
574 aa  332  8e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.99 
 
 
779 aa  332  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.3 
 
 
597 aa  332  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4489  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.99 
 
 
779 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000134083 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A4543  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.99 
 
 
779 aa  331  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1422  hypothetical protein  35.13 
 
 
566 aa  332  2e-89  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432451 
 
 
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NC_013161  Cyan8802_1308  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.91 
 
 
655 aa  331  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011726  PCC8801_1279  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.91 
 
 
655 aa  331  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010511  M446_3141  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.01 
 
 
597 aa  330  6e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0346516 
 
 
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NC_006274  BCZK4153  single-stranded-DNA-specific exonuclease  35.81 
 
 
779 aa  329  8e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease  35.64 
 
 
779 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_014148  Plim_0674  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.95 
 
 
583 aa  327  3e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013165  Shel_21910  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.9 
 
 
1102 aa  327  3e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0138959 
 
 
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NC_002950  PG0054  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.04 
 
 
584 aa  326  8.000000000000001e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1395  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.12 
 
 
571 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009505  BOV_1231  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.3 
 
 
575 aa  325  2e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.337799  n/a   
 
 
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