More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1731 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  100 
 
 
268 aa  546  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  50 
 
 
262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  50 
 
 
262 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  51.81 
 
 
265 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  51.81 
 
 
265 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  44.32 
 
 
270 aa  206  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  45.42 
 
 
267 aa  205  6e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  44.49 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  41.38 
 
 
263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  42.46 
 
 
272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  41.38 
 
 
263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2034  ModE family transcriptional regulator  42.68 
 
 
267 aa  192  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.64775  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  41 
 
 
263 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  40.61 
 
 
263 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  38.7 
 
 
263 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  42.91 
 
 
269 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  41.64 
 
 
276 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  42.68 
 
 
269 aa  186  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  40.7 
 
 
274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  45.34 
 
 
265 aa  182  6e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  46.75 
 
 
268 aa  178  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  44.53 
 
 
268 aa  177  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0256  transcriptional regulator, ModE family  39.55 
 
 
264 aa  178  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749956 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  37.55 
 
 
266 aa  177  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  45.16 
 
 
281 aa  176  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  45.97 
 
 
290 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  44.94 
 
 
270 aa  171  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  43.95 
 
 
263 aa  170  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  43.95 
 
 
263 aa  168  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  43.72 
 
 
270 aa  166  4e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  41.13 
 
 
269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  45.02 
 
 
278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2953  ModE family transcriptional regulator  40 
 
 
263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2640  ModE family transcriptional regulator  38.11 
 
 
263 aa  163  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0622782  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  43.72 
 
 
269 aa  163  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  37.31 
 
 
270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  45.6 
 
 
279 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  36.95 
 
 
263 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  45.6 
 
 
279 aa  161  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  44.22 
 
 
278 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  41.06 
 
 
270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  46.58 
 
 
282 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  46.58 
 
 
282 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  46.58 
 
 
282 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  44.18 
 
 
281 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  44.18 
 
 
281 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  46.58 
 
 
282 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  46.58 
 
 
262 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  46.58 
 
 
282 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  44.18 
 
 
278 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  44.87 
 
 
282 aa  155  8e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  43.78 
 
 
278 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  46.15 
 
 
282 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  43.32 
 
 
269 aa  154  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2731  ModE family transcriptional regulator  39.06 
 
 
266 aa  153  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  42.86 
 
 
276 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  36.65 
 
 
263 aa  149  4e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  42.97 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  38.52 
 
 
260 aa  146  3e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  38.19 
 
 
270 aa  135  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  38.19 
 
 
270 aa  135  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  34.54 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  39.13 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  35.38 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  34.43 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0511  molybdenum-pterin binding protein  46.1 
 
 
141 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6661  TOBE domain-containing protein  48.23 
 
 
141 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166904  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5816  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  47.52 
 
 
141 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0469657  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6181  molybdenum-pterin binding  47.52 
 
 
141 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220379  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5767  TOBE domain-containing protein  46.1 
 
 
141 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309688  normal  0.727293 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6011  molybdenum-pterin binding  46.1 
 
 
141 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807877  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6152  TOBE domain-containing protein  46.81 
 
 
141 aa  122  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0318  ModE family transcriptional regulator  29.53 
 
 
261 aa  122  7e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.647823  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7726  molybdenum-pterin binding protein  46.81 
 
 
141 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  47.1 
 
 
142 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  47.14 
 
 
142 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2052  TOBE domain protein  50 
 
 
142 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  47.14 
 
 
142 aa  119  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  30.49 
 
 
263 aa  119  6e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  45.71 
 
 
142 aa  116  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0360  ModE family transcriptional regulator  37.25 
 
 
254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.970254  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1452  TOBE domain-containing protein  43.26 
 
 
142 aa  115  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06340  putative molybdenum transport regulator  35.25 
 
 
252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0099259  normal  0.759448 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1580  TOBE domain protein  38.18 
 
 
378 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0590  molybdenum transport regulator  35.25 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376287  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3324  TOBE domain-containing protein  43.97 
 
 
141 aa  112  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4689  helix-turn-helix, Fis-type:molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  34.96 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  44.37 
 
 
177 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1296  DNA-binding transcriptional regulator ModE  34.68 
 
 
263 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0386  ModE family transcriptional regulator  38.36 
 
 
254 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129709  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  47.52 
 
 
140 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4842  ModE family transcriptional regulator  36.55 
 
 
254 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00572189  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5363  TOBE domain-containing protein  46.81 
 
 
142 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288358  normal  0.835722 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  45.39 
 
 
141 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0436  TOBE domain-containing protein  40.71 
 
 
141 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3475  molybdenum-pterin binding protein  42.55 
 
 
141 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703856  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5121  molybdenum-pterin binding domain (dual function transport/regulation)  41.13 
 
 
142 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5178  ModE family transcriptional regulator  33.88 
 
 
254 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047301  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4091  ModE family transcriptional regulator  34.01 
 
 
254 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.376442  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1267  DNA-binding transcriptional regulator ModE  32.69 
 
 
263 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>