282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1728 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  61.93 
 
 		 613 aa  733    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1728  citrate transporter  100 
 
 		 650 aa  1289    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000373143  normal  0.108041 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0233  putative citrate transporter  58.53 
 
 		 627 aa  660    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2565  Citrate transporter  56.69 
 
 		 612 aa  634  1e-180  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000262812  hitchhiker  0.00846498 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0502  TrkA-C domain protein  48.42 
 
 		 620 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2399  TrkA domain-containing protein  44.01 
 
 		 608 aa  427  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.9987  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3192  TrkA-C domain protein  38.98 
 
 		 615 aa  416  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.213915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01839  sulfur deprivation response regulator  38.18 
 
 		 620 aa  405  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.379301  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2059  sulfur deprivation response regulator  37.32 
 
 		 620 aa  398  1e-109  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1981  TrkA domain-containing protein  37.32 
 
 		 620 aa  397  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0994833  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0357  citrate transporter  38.65 
 
 		 595 aa  360  5e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.152666  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  29.53 
 
 		 588 aa  260  6e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  30.41 
 
 		 609 aa  258  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  30.39 
 
 		 613 aa  257  5e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  29.7 
 
 		 592 aa  246  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  29.62 
 
 		 612 aa  241  4e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  29.89 
 
 		 627 aa  241  4e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  28.34 
 
 		 623 aa  237  5.0000000000000005e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  27.23 
 
 		 602 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  27.23 
 
 		 596 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  28.14 
 
 		 596 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  27.37 
 
 		 619 aa  226  7e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  28.14 
 
 		 596 aa  226  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  28.95 
 
 		 597 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  27.5 
 
 		 610 aa  224  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  28.8 
 
 		 610 aa  223  7e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  27.17 
 
 		 611 aa  221  3.9999999999999997e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  28.64 
 
 		 610 aa  220  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  28.52 
 
 		 608 aa  219  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  27.5 
 
 		 610 aa  216  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  28.97 
 
 		 593 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  27.93 
 
 		 610 aa  216  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  27.71 
 
 		 608 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  27.34 
 
 		 610 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  27.49 
 
 		 630 aa  215  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  29.57 
 
 		 605 aa  215  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  27.49 
 
 		 610 aa  215  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  27.71 
 
 		 608 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  27.71 
 
 		 608 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  27.71 
 
 		 608 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  27.5 
 
 		 610 aa  214  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  27.5 
 
 		 610 aa  214  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  27.5 
 
 		 610 aa  214  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  27.5 
 
 		 610 aa  214  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  27.5 
 
 		 610 aa  214  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  27.34 
 
 		 610 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2561  citrate transporter  27.71 
 
 		 608 aa  214  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1177  Citrate transporter  27.96 
 
 		 604 aa  213  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437417  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  28.01 
 
 		 610 aa  213  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  26.32 
 
 		 609 aa  213  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  28.97 
 
 		 622 aa  213  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  26.28 
 
 		 588 aa  211  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  27.34 
 
 		 610 aa  210  6e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  27.81 
 
 		 610 aa  206  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  28.43 
 
 		 605 aa  205  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  27.67 
 
 		 611 aa  204  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  27.03 
 
 		 620 aa  203  7e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  26.89 
 
 		 609 aa  203  8e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  29.04 
 
 		 616 aa  203  9e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  25.9 
 
 		 621 aa  202  9.999999999999999e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  27.24 
 
 		 609 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  27.79 
 
 		 614 aa  200  7e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  26.51 
 
 		 588 aa  199  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  28.94 
 
 		 618 aa  196  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  27.84 
 
 		 619 aa  196  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  26.69 
 
 		 609 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  26.74 
 
 		 609 aa  193  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3534  citrate transporter  29.25 
 
 		 609 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.433375 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  27.04 
 
 		 593 aa  187  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  24.84 
 
 		 616 aa  186  9e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  25.97 
 
 		 594 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  26.89 
 
 		 601 aa  184  6e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  26.64 
 
 		 632 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1537  Citrate transporter  27.19 
 
 		 604 aa  181  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.853419  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  27.84 
 
 		 589 aa  181  4.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  27.29 
 
 		 606 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  29.05 
 
 		 581 aa  178  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  26.16 
 
 		 600 aa  179  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1349  Citrate transporter  25.62 
 
 		 609 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000776771  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  26.23 
 
 		 605 aa  176  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  26.74 
 
 		 613 aa  175  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  26.79 
 
 		 627 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  27.12 
 
 		 591 aa  172  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  27.74 
 
 		 588 aa  172  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  27.71 
 
 		 593 aa  171  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3860  transporter  28.62 
 
 		 586 aa  171  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102256  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  25.04 
 
 		 590 aa  169  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  25.08 
 
 		 592 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22453  predicted protein  26.39 
 
 		 622 aa  168  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5235  citrate transporter  27.79 
 
 		 612 aa  169  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  25.24 
 
 		 593 aa  168  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3434  TrkA-C  27.66 
 
 		 603 aa  167  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0196864  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  26.93 
 
 		 619 aa  166  9e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  24.76 
 
 		 592 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0637  membrane transporter  25.82 
 
 		 620 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.797217  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  28.16 
 
 		 591 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  24.16 
 
 		 592 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  24.42 
 
 		 624 aa  166  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  24.96 
 
 		 590 aa  166  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  25.37 
 
 		 605 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>