More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1712 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 595 aa  1222    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  34.36 
 
 		 601 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 602 aa  261  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  33.96 
 
 		 653 aa  256  6e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  33.96 
 
 		 653 aa  256  6e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  38.95 
 
 		 472 aa  246  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  31.19 
 
 		 1077 aa  240  6.999999999999999e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  33.16 
 
 		 615 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  33.22 
 
 		 626 aa  232  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  34.08 
 
 		 592 aa  231  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 767 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.64 
 
 		 3145 aa  223  8e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 740 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 		 1827 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  35.38 
 
 		 556 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  35.73 
 
 		 1038 aa  220  5e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  34.26 
 
 		 703 aa  220  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  36.43 
 
 		 872 aa  220  7e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  34.91 
 
 		 473 aa  219  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.5 
 
 		 1034 aa  219  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  34.5 
 
 		 1005 aa  218  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 		 620 aa  219  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 		 1450 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  31.4 
 
 		 620 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.44 
 
 		 760 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  35.28 
 
 		 542 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  32.02 
 
 		 688 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  30.42 
 
 		 607 aa  213  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  34.91 
 
 		 1677 aa  213  7.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  34.03 
 
 		 649 aa  213  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  34.03 
 
 		 649 aa  213  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  32.77 
 
 		 714 aa  211  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.16 
 
 		 689 aa  210  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.29 
 
 		 604 aa  209  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 		 646 aa  210  8e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  37.8 
 
 		 608 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  33.17 
 
 		 780 aa  204  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  31.6 
 
 		 614 aa  204  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4266  hypothetical protein  37.15 
 
 		 389 aa  204  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  32.11 
 
 		 648 aa  204  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  33.1 
 
 		 612 aa  203  9e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  31.26 
 
 		 626 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  28.08 
 
 		 630 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 		 614 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  30.21 
 
 		 626 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  39.57 
 
 		 747 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 614 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  30.21 
 
 		 614 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  30.35 
 
 		 523 aa  201  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  30.21 
 
 		 614 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  33.93 
 
 		 520 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 1454 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1856  hypothetical protein  36.56 
 
 		 360 aa  199  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 1451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 636 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  32.64 
 
 		 639 aa  197  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  38.94 
 
 		 573 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  35.77 
 
 		 611 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  38.71 
 
 		 600 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  38.71 
 
 		 496 aa  194  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 637 aa  193  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 747 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  29.12 
 
 		 607 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 637 aa  192  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 		 714 aa  192  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  34.36 
 
 		 545 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 955 aa  191  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  36.28 
 
 		 546 aa  191  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  32.19 
 
 		 635 aa  190  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  32.19 
 
 		 635 aa  190  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  35.67 
 
 		 387 aa  189  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 611 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1212  hypothetical protein  34.91 
 
 		 385 aa  188  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  30.04 
 
 		 577 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  31.66 
 
 		 1764 aa  187  4e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 		 578 aa  187  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  28.68 
 
 		 603 aa  187  6e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  30.04 
 
 		 529 aa  187  7e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 		 505 aa  186  9e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 502 aa  186  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 		 502 aa  186  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 		 502 aa  186  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 545 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  37.76 
 
 		 571 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  37.61 
 
 		 593 aa  184  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 588 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  28.6 
 
 		 681 aa  182  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  32.2 
 
 		 503 aa  180  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  31.83 
 
 		 935 aa  179  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  31.32 
 
 		 457 aa  178  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 559 aa  177  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0550  TPR repeat-containing protein  41.5 
 
 		 595 aa  177  5e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.492764  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  32.53 
 
 		 1073 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 		 527 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 		 1212 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  30.67 
 
 		 615 aa  176  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  29.16 
 
 		 583 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 574 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  32.59 
 
 		 546 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0955  TPR domain-containing protein  37.19 
 
 		 705 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>