48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1706 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1706  DsrH family protein  100 
 
 		 97 aa  199  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000513619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0035  sulfur relay protein TusB/DsrH  44.33 
 
 		 97 aa  104  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1950  DsrH protein  43.3 
 
 		 97 aa  102  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101676  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0042  DsrH protein  42.27 
 
 		 97 aa  99.4  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.932533  normal  0.75194 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2315  sulfur relay protein TusB/DsrH  42.27 
 
 		 97 aa  98.2  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1851  sulfur relay protein TusB/DsrH  40.21 
 
 		 97 aa  95.9  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000563388  normal  0.139435 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0134  DsrH family protein  42.27 
 
 		 97 aa  94.4  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00043522  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0701  sulfur relay protein TusB/DsrH  40.21 
 
 		 97 aa  93.2  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0938457  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2481  DsrH protein  47.47 
 
 		 99 aa  90.1  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.1965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2189  sulfur relay protein TusB/DsrH  44 
 
 		 100 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.62558  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1657  DsrH family protein  45 
 
 		 99 aa  85.9  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1955  DsrH family protein  41 
 
 		 99 aa  80.5  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.392226  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3577  DsrH like protein  43.3 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3340  DsrH family protein  38.14 
 
 		 99 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.171608  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30380  hypothetical protein  36.08 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1333  intracellular sulfur oxidation protein DsrH  36.17 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2601  hypothetical protein  35.05 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.691095  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1838  DsrH family protein  40.21 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000194131 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3995  hypothetical protein  40.21 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19694  hitchhiker  0.00527203 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3441  intracellular sulfur oxidation protein of DsrH family protein  35.71 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000121818  hitchhiker  0.000104159 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2108  DsrH family protein  35.05 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000187811  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2379  DsrH family protein  36.08 
 
 		 99 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.764227  normal  0.0193551 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3399  sulfur relay protein TusB/DsrH  36.08 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.439562 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3170  DsrH like protein  32.99 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225205  normal  0.258355 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28140  dissimilatory sulfite reductase, DsrH-like protein  36.08 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3600  sulfur relay protein TusB/DsrH  38.14 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0315  sulfur relay protein TusB/DsrH  36.36 
 
 		 95 aa  53.5  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000131562  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4552  sulfur transfer complex subunit TusB  35.35 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  normal  0.147371 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0397  sulfur relay protein TusB/DsrH  32.65 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000247543  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1521  hypothetical protein  32.29 
 
 		 95 aa  51.2  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.389974  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00058  hypothetical protein  35.71 
 
 		 91 aa  51.2  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0435  hypothetical protein  34.41 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2004  DsrH family protein  32.94 
 
 		 93 aa  48.9  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000377209  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2057  DsrH family protein  31.96 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0276019  hitchhiker  0.000313289 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2006  DsrH family protein  31.96 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.039715  hitchhiker  0.000293405 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1970  DsrH family protein  31.96 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  0.848273 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2378  hypothetical protein  34.12 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2163  DsrH family protein  31.76 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000886637  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2316  DsrH family protein  31.76 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000019534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2208  DsrH family protein  31.76 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000178516  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0965  DsrH family protein  32.18 
 
 		 95 aa  47.8  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.588711  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2198  sulfur relay protein TusB/DsrH  31.76 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267344  normal  0.0843026 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4011  sulfur relay protein TusB/DsrH  31.63 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000192762  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1806  DsrH like protein  27.45 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000305366  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0514  sulfur relay protein TusB/DsrH  29.67 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00166846  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3831  sulfur relay protein TusB/DsrH  33.33 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0361981  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2476  sulfur relay protein TusB/DsrH  27.84 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000656489  hitchhiker  0.0000966631 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1923  hypothetical protein  24.49 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.597175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>