More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1598 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 964 aa  1976    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.95 
 
 		 1768 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 		 1245 aa  429  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  34.89 
 
 		 2035 aa  426  1e-118  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.9 
 
 		 1771 aa  423  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  38.65 
 
 		 1765 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.24 
 
 		 2213 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.86 
 
 		 1326 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.42 
 
 		 1165 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  41.81 
 
 		 1763 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.58 
 
 		 1767 aa  415  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.94 
 
 		 1767 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.59 
 
 		 1767 aa  412  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.76 
 
 		 1784 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.76 
 
 		 1792 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.21 
 
 		 1765 aa  413  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 		 1303 aa  412  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.81 
 
 		 1611 aa  404  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.99 
 
 		 2654 aa  404  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  33.73 
 
 		 1331 aa  403  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.23 
 
 		 1548 aa  406  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.25 
 
 		 1782 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.12 
 
 		 1786 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 		 1340 aa  395  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.93 
 
 		 1245 aa  395  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.28 
 
 		 1582 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.21 
 
 		 920 aa  393  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.76 
 
 		 1622 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 		 1267 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  36.39 
 
 		 1574 aa  385  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.31 
 
 		 1240 aa  386  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.05 
 
 		 1788 aa  380  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.49 
 
 		 1230 aa  378  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.45 
 
 		 1245 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  40.55 
 
 		 1200 aa  379  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  42.11 
 
 		 1233 aa  379  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  37.01 
 
 		 1439 aa  376  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.36 
 
 		 1234 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.53 
 
 		 1236 aa  376  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.19 
 
 		 1284 aa  372  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.24 
 
 		 1009 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.34 
 
 		 1238 aa  369  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.16 
 
 		 1238 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.16 
 
 		 1238 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  41.61 
 
 		 1236 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.34 
 
 		 1238 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  38.05 
 
 		 1030 aa  369  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.89 
 
 		 1234 aa  366  1e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  38.77 
 
 		 1188 aa  365  3e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.46 
 
 		 957 aa  365  3e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.28 
 
 		 1166 aa  365  3e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.32 
 
 		 929 aa  364  6e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.83 
 
 		 1128 aa  363  8e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.86 
 
 		 1236 aa  362  3e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.18 
 
 		 1236 aa  361  3e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.18 
 
 		 1236 aa  361  3e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  32.32 
 
 		 1683 aa  360  8e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 		 1193 aa  360  8e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  34.75 
 
 		 1014 aa  359  9.999999999999999e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0480  putative PAS/PAC sensor protein  36.86 
 
 		 1686 aa  360  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 		 1266 aa  358  3.9999999999999996e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 		 1310 aa  357  7.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0482  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.99 
 
 		 1681 aa  355  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3548  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.13 
 
 		 1681 aa  354  4e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 		 1560 aa  352  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0463  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.72 
 
 		 1314 aa  350  5e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332875  normal  0.985136 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.52 
 
 		 916 aa  350  9e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 1005 aa  347  4e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 1202 aa  343  5.999999999999999e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.38 
 
 		 1333 aa  342  1e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.82 
 
 		 1033 aa  342  2e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  33.73 
 
 		 1214 aa  342  2.9999999999999998e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  35.75 
 
 		 1053 aa  340  5.9999999999999996e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 		 1040 aa  339  9.999999999999999e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  38.23 
 
 		 1135 aa  337  5.999999999999999e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00899  sensory box histidine kinase/response regulator  35.62 
 
 		 1070 aa  337  7.999999999999999e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1508  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.38 
 
 		 1303 aa  336  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.63 
 
 		 1397 aa  333  8e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 1643 aa  333  1e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.63 
 
 		 1442 aa  333  1e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  31.9 
 
 		 1287 aa  333  1e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 		 981 aa  332  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  35.54 
 
 		 932 aa  332  3e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10770  putative sensor/response regulator hybrid  37.23 
 
 		 1417 aa  331  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.903284 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3344  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.93 
 
 		 1390 aa  332  3e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1250  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.41 
 
 		 936 aa  331  4e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3703  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.89 
 
 		 1021 aa  330  9e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3028  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.28 
 
 		 1426 aa  330  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.514624  normal  0.437775 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.68 
 
 		 1659 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  39.14 
 
 		 925 aa  328  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  39.08 
 
 		 917 aa  327  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  39.14 
 
 		 925 aa  327  6e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.56 
 
 		 1109 aa  327  7e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  39.44 
 
 		 917 aa  326  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.27 
 
 		 932 aa  326  1e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.49 
 
 		 921 aa  326  1e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0136  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.5 
 
 		 912 aa  326  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.97 
 
 		 1603 aa  325  3e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.76 
 
 		 946 aa  324  4e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.13 
 
 		 927 aa  324  6e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>