More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1584 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1584  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
290 aa  589  1e-167  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000121386  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0005  extracellular solute-binding protein, family 1  43.62 
 
 
291 aa  231  8.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  33.71 
 
 
285 aa  135  8e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  33.58 
 
 
278 aa  132  5e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  35.61 
 
 
273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  34.87 
 
 
272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  37.72 
 
 
283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  33.76 
 
 
272 aa  125  7e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  35.02 
 
 
271 aa  125  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  36.74 
 
 
381 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  31.07 
 
 
279 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  34.96 
 
 
284 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  32.55 
 
 
273 aa  122  6e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  32.49 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  35.71 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  33.33 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  33.82 
 
 
267 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  33.2 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2588  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  31.23 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72146  normal  0.887714 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  33.33 
 
 
272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  35.37 
 
 
272 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  35.37 
 
 
272 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  33.69 
 
 
284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  32.07 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  34.83 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  30.94 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  36 
 
 
270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  34.82 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  32.27 
 
 
281 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  31.5 
 
 
271 aa  113  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  33.04 
 
 
218 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  36.76 
 
 
287 aa  112  6e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  29.96 
 
 
269 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2587  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  28.93 
 
 
270 aa  112  9e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.705823  normal  0.898892 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  36.26 
 
 
301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  31.6 
 
 
290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  32.57 
 
 
281 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  35.44 
 
 
332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  28.27 
 
 
273 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  30 
 
 
299 aa  109  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  29 
 
 
268 aa  109  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  33.03 
 
 
281 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  29.96 
 
 
276 aa  108  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  31.82 
 
 
279 aa  107  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  31.14 
 
 
272 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  31.6 
 
 
272 aa  107  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4292  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  29.06 
 
 
269 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  33.82 
 
 
274 aa  107  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  27.76 
 
 
273 aa  106  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  32.54 
 
 
278 aa  105  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  30.8 
 
 
264 aa  105  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  28.47 
 
 
290 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  33.48 
 
 
276 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 
273 aa  102  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  32.84 
 
 
285 aa  102  6e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3818  OmpA/MotB domain protein  29.2 
 
 
435 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0260085  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  33.99 
 
 
284 aa  102  9e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  33.04 
 
 
276 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1097  phosphate binding protein  32.13 
 
 
277 aa  101  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00171228  normal  0.562956 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0427  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.11 
 
 
278 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177912  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  33.17 
 
 
278 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  28.32 
 
 
274 aa  99.8  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0405  phosphate binding protein  30.49 
 
 
281 aa  99  9e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000789455  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2834  phosphate binding protein  33.33 
 
 
307 aa  97.1  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28140  phosphate-binding protein  30.41 
 
 
285 aa  96.7  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.549529  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  31.09 
 
 
273 aa  96.3  6e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1951  OmpA/MotB domain-containing protein  28.32 
 
 
435 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2613  OmpA family protein  27.98 
 
 
482 aa  94.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429058  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  29.78 
 
 
274 aa  92.4  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0584  extracellular solute-binding protein  29.3 
 
 
268 aa  92  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  31.53 
 
 
281 aa  91.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  32.02 
 
 
282 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03279  hypothetical protein  30.77 
 
 
330 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.720807  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03231  hypothetical protein  30.77 
 
 
330 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4737  hypothetical protein  30.77 
 
 
330 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  32.3 
 
 
278 aa  91.3  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0286  hypothetical protein  30.77 
 
 
330 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  29.52 
 
 
274 aa  90.9  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2295  phosphate-binding protein  29.39 
 
 
304 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0311  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  26.36 
 
 
325 aa  90.5  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1384  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1917  phosphate binding protein  32.97 
 
 
328 aa  89.7  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266865  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2746  OmpA family protein  30.26 
 
 
451 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0862852  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0220  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  29.6 
 
 
279 aa  89.7  5e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00000480634  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2087  OmpA/MotB domain-containing protein  28.14 
 
 
435 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3625  hypothetical protein  30.77 
 
 
330 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0589  phosphate binding protein  32.35 
 
 
292 aa  89.4  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2475  OmpA/MotB  29.52 
 
 
447 aa  89  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.201724  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  32.95 
 
 
280 aa  89  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1908  OmpA/MotB domain protein  28.95 
 
 
519 aa  88.6  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.533887  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4359  OmpA/MotB domain-containing protein  30.13 
 
 
558 aa  88.6  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  34.07 
 
 
330 aa  88.6  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2212  putative phosphate ABC transporter  32.83 
 
 
255 aa  88.2  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317891  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1147  phosphate binding protein  31.02 
 
 
263 aa  87.4  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  29.2 
 
 
274 aa  87.8  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2886  phosphate binding protein  33.18 
 
 
271 aa  87  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.197521 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3708  hypothetical protein  30.21 
 
 
330 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.371578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2467  phosphate transport system substrate-binding protein  26.6 
 
 
292 aa  86.3  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2437  OmpA/MotB domain-containing protein  27.95 
 
 
460 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31620  hypothetical protein  31.61 
 
 
464 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1647  phosphate transport system substrate-binding protein  29.63 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal  0.670421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>