More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1557 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02625  CTP synthetase  58.12 
 
 		 545 aa  646    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000505271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0908  CTP synthase  58.12 
 
 		 545 aa  646    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000342907  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  59.12 
 
 		 536 aa  670    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  60.89 
 
 		 542 aa  694    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  57.35 
 
 		 535 aa  664    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  62.39 
 
 		 552 aa  705    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1094  CTP synthetase  61.55 
 
 		 542 aa  664    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.641491  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  56.25 
 
 		 535 aa  653    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4108  CTP synthetase  59.44 
 
 		 542 aa  652    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2054  CTP synthetase  61.74 
 
 		 542 aa  665    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1134  CTP synthetase  61.18 
 
 		 542 aa  661    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.519093  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3441  CTP synthetase  59.89 
 
 		 546 aa  667    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  59.96 
 
 		 543 aa  683    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  56.07 
 
 		 535 aa  653    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  55.7 
 
 		 535 aa  649    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  56.07 
 
 		 535 aa  653    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4476  CTP synthetase  60.33 
 
 		 543 aa  664    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1184  CTP synthetase  59.33 
 
 		 545 aa  652    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1190  CTP synthetase  59.33 
 
 		 545 aa  654    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1361  CTP synthetase  59.96 
 
 		 543 aa  684    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0802006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1641  CTP synthetase  60.22 
 
 		 544 aa  663    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118223  hitchhiker  0.0000254043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2366  CTP synthetase  60 
 
 		 546 aa  686    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.863535  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  60.37 
 
 		 551 aa  689    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  58.1 
 
 		 555 aa  658    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  57.72 
 
 		 542 aa  669    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0619  CTP synthetase  60.66 
 
 		 546 aa  682    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.626167  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1833  CTP synthetase  61.07 
 
 		 543 aa  662    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392945  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  58.33 
 
 		 545 aa  664    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  57.8 
 
 		 536 aa  667    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0850  CTP synthetase  59.56 
 
 		 550 aa  678    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  60.41 
 
 		 543 aa  691    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2758  CTP synthetase  60.26 
 
 		 545 aa  672    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000221418  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  60.52 
 
 		 534 aa  690    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2979  CTP synthetase  59.81 
 
 		 534 aa  651    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.535852  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  58.96 
 
 		 549 aa  650    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  58.6 
 
 		 549 aa  656    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  60.63 
 
 		 538 aa  677    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  61.47 
 
 		 548 aa  713    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  60.63 
 
 		 543 aa  672    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  56.07 
 
 		 535 aa  653    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1782  CTP synthetase  55.56 
 
 		 536 aa  640    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  57.99 
 
 		 546 aa  659    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1227  CTP synthetase  59.67 
 
 		 566 aa  649    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1887  CTP synthetase  61.07 
 
 		 542 aa  665    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.424468  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1238  CTP synthetase  62.55 
 
 		 543 aa  665    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  59.67 
 
 		 543 aa  684    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  59.93 
 
 		 555 aa  659    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  59.67 
 
 		 542 aa  681    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2790  CTP synthetase  59.85 
 
 		 543 aa  657    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.015258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2017  CTP synthetase  60.89 
 
 		 543 aa  661    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404569  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  58.36 
 
 		 545 aa  655    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  55.88 
 
 		 535 aa  655    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1243  CTP synthetase  59.38 
 
 		 543 aa  677    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2473  CTP synthetase  60.52 
 
 		 543 aa  667    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  61.88 
 
 		 542 aa  694    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18801  CTP synthetase  55.05 
 
 		 536 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  57.36 
 
 		 558 aa  641    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1195  CTP synthetase  59.33 
 
 		 545 aa  663    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.111429  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2824  CTP synthetase  60.97 
 
 		 543 aa  663    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.831934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0617  CTP synthetase  60.41 
 
 		 548 aa  677    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1738  CTP synthetase  60.63 
 
 		 545 aa  665    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1875  CTP synthetase  60.22 
 
 		 544 aa  665    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000103989 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1204  CTP synthetase  60.29 
 
 		 545 aa  672    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000204322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0222  CTP synthetase  56.01 
 
 		 543 aa  639    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.555048  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  59.08 
 
 		 558 aa  671    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3137  CTP synthetase  60.44 
 
 		 545 aa  674    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000110473  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1170  CTP synthetase  60.33 
 
 		 543 aa  660    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.251518  normal  0.0605368 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3128  CTP synthetase  60.44 
 
 		 545 aa  674    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000112535  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3234  CTP synthetase  58.86 
 
 		 545 aa  657    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3265  CTP synthetase  60.63 
 
 		 543 aa  659    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1634  CTP synthetase  60.63 
 
 		 545 aa  673    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.883771  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1670  CTP synthetase  60.22 
 
 		 543 aa  664    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  58.15 
 
 		 535 aa  667    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  58.15 
 
 		 535 aa  667    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0552  CTP synthetase  58.6 
 
 		 542 aa  646    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  60.89 
 
 		 542 aa  694    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1114  CTP synthetase  60.44 
 
 		 546 aa  671    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000131384  normal  0.869869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1185  CTP synthetase  60.26 
 
 		 546 aa  671    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000285694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  62.96 
 
 		 540 aa  711    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1051  CTP synthetase  59.15 
 
 		 545 aa  662    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.333074  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  54.98 
 
 		 542 aa  638    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1408  CTP synthetase  59.89 
 
 		 542 aa  664    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0617949  hitchhiker  0.0000124662 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2348  CTP synthetase  62.8 
 
 		 544 aa  679    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  59.67 
 
 		 542 aa  681    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1069  CTP synthetase  62.48 
 
 		 542 aa  671    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.364938  normal  0.721377 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  55.37 
 
 		 536 aa  640    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  57.8 
 
 		 536 aa  667    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18801  CTP synthetase  55.56 
 
 		 536 aa  638    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  60.48 
 
 		 557 aa  705    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  100 
 
 		 547 aa  1132    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1115  CTP synthetase  60.44 
 
 		 546 aa  670    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000891455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2026  CTP synthetase  61.16 
 
 		 545 aa  665    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406175  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1614  CTP synthetase  60.7 
 
 		 535 aa  655    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.23037  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  57.46 
 
 		 533 aa  641    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  54.98 
 
 		 533 aa  634    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1035  CTP synthetase  60.44 
 
 		 545 aa  672    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.946581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0668  CTP synthetase  57.56 
 
 		 545 aa  654    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00226842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  60.63 
 
 		 542 aa  692    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  62.2 
 
 		 547 aa  706    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1298  CTP synthetase  59.67 
 
 		 544 aa  660    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>